bộ phải cao hơn, địa bàn quản lý rộng, số đối tợng kinh doanh đông vì vậy cán bộ thuế không bao quát hết đợc nguồn thu, thậm chí có hiện tợng thông đồng với đối tợng kinh doanh làm mất số thu, mất hộ.
- Hệ thống văn bản hớng dẫn, sửa đổi, bổ sung của Nhà nớc và các ngành chức năng quá nhiều, chồng chéo, không kịp thời làm cho việc thực hiện của cán bộ thuế gặp nhiều khó khăn, dễ nhầm lẫn.
- Thu thuê khâu lu thông cha hợp lý ở chỗ: đặc điểm của thuế GTGT là thu vào phần giá trị tăng thêm của hàng hoá nhng ở loại hình kinh doanh buôn chuyến lại phải nộp thuế trớc khi vận chuyển hàng đi, nh vậy, đối tợng kinh doanh phải nộp thuế khi cha phát sinh GTGT, không đúng với đặc điểm của thuế GTGT.
- Đối với những hộ có nhu cầu nộp thuế theo phơng pháp khấu trừ, đủ điều kiện thì đợc chi cục thuế chấp nhận. Nhng theo Luật thuế GTGT, chỉ đợc khấu trừ số thuế đối với những hàng hoá mua vào từ khi đ- ợc chấp nhận nộp theo phơng pháp khấu trừ và phải là hoá đơn GTGT còn những hàng hoá mua từ trớc khi đợc chấp nhận thu theo phơng pháp khấu trừ thì sẽ không đợc khấu trừ khi bán ra, vì vậy, các hộ phải nộp thuế GTGT số hàng hoá này với thuế suất 5%, 10% hoặc 20%( tuỳ theo từng mặt hàng) trên số doanh thu bán hàng hoá đó, dẫn đến số thuế phải nộp rất cao là không phù hợp.
- Chơng trình quản lý thuế GTGT trên máy tính còn nhiều vấn đề cha phù hợp với diễn biến thực tế nh:
+ Cách tính phạt nộp chậm phức tạp.
+ Số thuế nợ đợc báo theo phơng pháp luỹ tiến, với những hộ nợ nhiều tháng sẽ khó xác định đợc số thuế nợ của những tháng nào.
+ Lực lợng cán bộ sử dụng máy tính cha đợc đào tạo cơ bản, thiếu đồng bộ.
+ Chơng trình còn nhiều lỗi kỹ thuật, gây khó khăn không ít cho công tác quản lý thuế trên máy tính của chi cục.
Việc áp dụng Luật thuế mới trên địa bàn quận Hoàn Kiếm đã nảy sinh những khó khăn, vớng mắc kể trên, vấn đề cần đặt ra là các nhà quản lý thuế phải có những giải pháp phù hợp trong việc quản lý để sao cho Luật thuế mới