Trong thời gian qua, ngân hàng đã triển khai mô hình tổ chức mới theo loại hình doanh nghiệp nhà nớc đặc biệt, bao gồm các đơn vị thành viên có quan hệ chặt chẽ với nhau về lợi ích kinh tế, tài chính, công nghệ, thông tin, đào tạo trong hoạt động kinh doanh. Ngân hàng ngoại thơng hoạt động trong lĩnh vực kinh doanh tiền tệ, tín dụng và các hoạt động liên quan đến hoạt động tài chính, tiền tệ, ngân hàng.
Sơ đồ tổ chức ngân hàng ngoại thơng Việt Nam
Hội đồng quản trị Ban kiểm soát Ban Tổng giám đốc Trụ sở chính
Phòng kiểm tra nội bộ Phòng tổng hợp thanh toán Phòng quản lý tín dụng Phòng tổng hợp và phân tích kinh tế Phòng đầu t và chứng khoán Phòng vốn
Phòng Công nợ Phòng quan hệ quốc tế Phòng Khách hàng Phòng quản lý liên doanh và
văn phòng đại diện Phòng kế toán tài chính Phòng tín dụng quốc tế Phòng kế toán quốc tế Phòng báo chí Phòng quản lý thẻ Văn phòng Trung tâm thanh toán
Phòng đầu t và chứng khoán Phòng tin học
Phòng quản trị Hội đồng
Cơ quan cao nhất của Ngân hàng ngoại thơng là hội đồng quản trị mà đứng đầu là vị chủ tịch. Hội đồng quản trị là nơi đề ra các chiến lợc kinh doanh chủ yếu cũng nh các chế độ chính sách lớn của ngân hàng. Ban kiểm soát có nhiệm vụ giám sát các hoạt động của Hội đồng. Tổng giám đốc trực thuộc Hội đồng quản trị thay mặt Hội đồng quản trị để điều hành hoạt động kinh doanh hàng ngày của ngân hàng. Ngoài ra theo cơ cấu tổ chức của Ngân hàng ngoại thơng còn có một hội đồng tín dụng giám sát hoạt động tín dụng của Tổng giám đốc ngăn ngừa những vi phạm chế độ tín dụng có thể xảy ra. Tại VCB Trung ơng có 23 phòng ban có nhiệm vụ phối hợp với nhau để giúp cho Tổng giám đốc điều hành công việc kinh doanh.