Đỗ Tước (năm 1999) đã khảo sát ở 10 địa điểm thuộc 10 tỉnh: Cao Bằng, Hà Giang, Tuyên Quang, Bắc Kạn, Lạng Sơn, Sơn
La, Ninh Bình, Hải Phòng, Thanh Hoá, Quảng Bình.
thống kê có: 69 loài và phân loài thú thuộc 18 họ, 6 bộ chiếm khoảng 40% khu hệ thú của địa phương.
Trong đó, có 2 bộ có tính đa dạng sinh học cao là bộ Dơi và bộ Linh trưởng.
Về bộ Gặm nhấm chỉ quan sát 8 loài sóc, còn các loài chuột chưa đủ dẫn liệu.
• ĐDSH phong phú nhất là loài Dơi thuộc bộ Chiroptera với khoảng 50 loài sống trong những hang động lớn
• Những loai dơi này thuộc các họ Dơi lá mũi, Dơi muỗi, Dơi quả,
Dơi ma v.v…
2. Bộ Linh trưởng
• Có nhiều ở Hà Tĩnh, Quảng Bình, Cúc Phương (Ninh Bình), Cát Bà (Hải Phòng).
• Bộ Linh trưởng có 16 loài và phân loài, trong đó có các loài đặc hữu trên núi đá vôi như: Voọc quần đùi , voọc đầu trắng , voọc mũi hếch vượn đen .
3. Bộ ăn thịt và bộ guốc chẵn
• Bộ Ăn thịt (Carnivora) có 8 loài như gấu ngựa, các loài cầy và mèo rừng.
• Bộ Guốc chẵn có 5 loài như hươu xạ, mang, sơn dương, lợn rừng và chào vao
4. Về chim:
• Có hệ chim phong phú trong đó đa dạng nhất là bộ Sẻ .
• Nơi đây quy tụ các loài quí hiếm như gà lôi trắng , cú lợn rừng , ác là , gà lam đuôi trắng .
5. Lưỡng cư, bò sát:
• Có 17 loài ,tất cả 17 loài này đều là những loài quí hiếm ghi tên trong Sách đỏ, CITES.
• Các loài này có giá trị kinh tế cao như rắn hổ chúa, rùa hộp tráng vàng,….