Những năm tới đây, mục tiêu của hoạt động nghiên cứu khoa học cơng nghệ trong TCT là tập trung nghiên cứu các đề tài và ứng dụng thành tựu khoa học bảo đảm tăng hiệu quả kinh doanh, tăng năng lực cạnh tranh của Tổng cơng ty. Những hướng ưu tiên nghiên cứu ứng dụng là :
• Nghiên cứu các đề tài, đề án sản xuất kinh doanh sản phẩm dịch vụ mới cĩ hiệu quả cao
• Nghiên cưú các đề tài, đề án để dần thay thế phần phải mua hay thuê của nước ngồi
• Nghiên cứu cơng nghệ và chuyển giao cơng nghệ khai thác, bảo dưỡng máy bay
• Nghiên cưú về cơng nghệ thơng tin và tin học
Để nghiên cứu ứng dụng cĩ hiệu quả các thành tựu khoa học theo những hướng ưu tiên trên, cần tổ chức lại hoặc tổ chức mới cơ sở nghiên cứu của Tổng cơng ty theo hướng gắn chặt với hoạt động sản xuất kinh doanh. Đổi mới chính sách đối với người làm khoa học để thu hút những người cĩ năng lực nghiên cưú trong lĩnh vực đặc thù này. Tăng cường tiềm lực nghiên cứu của Tổng cơng ty khơng những về đội ngũ cán bộ mà cả về thơng tin khoa học và phương tiện làm việc cần phải tính tốn một cách kỹ lưỡng trên quan điểm hiệu quả việc đầu tư mua các thành tựu khoa học cĩ sẵn với việc tự nghiên cứu hoặc đặt hàng nghiên cứu. Đặc biệt phải phân biệt sản phẩm nghiên cứu khoa học với sản phẩm của hoạt động quản lý để tránh chuyển các vấn đề thuộc hoạt động quản lý bình thường sang hoạt động nghiên cứu làm tăng chi phí, thực hiện chế độ đưa kinh phí nghiên cứu khoa học vào giá thành sản phẩm và dịch vụ mà kết quả nghiên cứu phục vụ cho việc kinh doanh sản xuất.