PHỤ LỤC 1. Cấu trúc của toàn bộ cơ sở dữ liệu
Cơ sở dữ liệu gồm 372 chất được thu thập từ 16 bài báo khoa học, có khung cấu trúc đa dạng (PHỤ LỤC 3).
Cơ sở dữ liệu này được trình bày trong 115 trang và đã được upload trên trang web https://sites.google.com/site/phanthienvy2016/documents
PHỤ LỤC 2. Giá trị hoạt tính của các hợp chất xây dựng mô hình CPG-C ABCC2 và iABCC2
Cơ sở dữ liệu này được trình bày trong 10 trang và đã được upload trên trang web https://sites.google.com/site/phanthienvy2016/documents
PHỤ LỤC 3. Các nhóm dẫn chất có hoạt tính trên bơm ABCC2
PHỤ LỤC 4. Hoạt tính của các hợp chất trong cơ sở dữ liệu để xây dựng mô hình CPG-C iVT
Cơ sở dữ liệu này được trình bày trong 7 trang và đã được upload trên trang web https://sites.google.com/site/phanthienvy2016/documents
PHỤ LỤC 5. Hoạt tính của các hợp chất trong cơ sở dữ liệu để xây dựng mô hình CPG-C iUT
Cơ sở dữ liệu này được trình bày trong 3 trang và đã được upload trên trang web https://sites.google.com/site/phanthienvy2016/documents
PHỤ LỤC 6. Hoạt tính của các hợp chất trong cơ sở dữ liệu để xây dựng mô hình CPG-C EG và iEG
Cơ sở dữ liệu này được trình bày trong 8 trang và đã được upload trên trang web https://sites.google.com/site/phanthienvy2016/documents
PHỤ LỤC 7. Hoạt tính của các hợp chất trong cơ sở dữ liệu để xây dựng mô hình CPG-C iCDCF
Cơ sở dữ liệu này được trình bày trong 3 trang và đã được upload trên trang web https://sites.google.com/site/phanthienvy2016/documents
PHỤ LỤC 8. Ý nghĩa các thông số mô tả phân tử để xây dựng các mô hình phân loại và hồi quy dự đoán hoạt tính trên bơm ABCC2 bằng CPG-NN
PHỤ LỤC 9. Kết quả mô hình phân loại hoạt tính trên bơm ABCC2 (CPG- C ABCC2)
Hình PL-4. Bản đồ tự tổ chức của tập huấn luyện với (a) thể hiện hoạt tính ức chế (b) thể hiện hoạt tính cảm ứng
(Màu sắc nơ-ron ứng với giá trị hoạt tính. Xanh nhạt: không có hoạt tính; Xanh đậm: ức chế, Đỏ: cảm ứng)
Bảng PL-4. Kết quả mô hình CPG-C ABCC2 phân loại hoạt tính trên bơm ABCC2
PHỤ LỤC 10. Kết quả mô hình phân loại hoạt tính ức chế trên bơm ABCC2 với giá trị hoạt tính xác định bằng phương pháp sử dụng màng túi (CPG-C iVT)
Hình PL-5. Bản đồ tự tổ chức của tập huấn luyện mô hình CPG-C iVT.
(Màu sắc nơ-ron ứng với giá trị hoạt tính. Xanh nhạt: không có hoạt tính; Xanh đậm: ức chế)
Bảng PL-5. Kết quả mô hình CPG-C iVT phân loại hoạt tính ức chế trên bơm ABCC2
PHỤ LỤC 11. Kết quả mô hình phân loại hoạt tính ức chế bơm ABCC2 với giá trị hoạt tính xác định bằng phương pháp hấp thu (CPG-C iUT)
Hình PL-6. Bản đồ tự tổ chức của tập huấn luyện mô hình CPG-C iUT.
(Màu sắc nơ-ron ứng với giá trị hoạt tính. Xanh nhạt: không có hoạt tính; Xanh đậm: ức chế)
Bảng PL-6. Kết quả mô hình CPG-C iUT phân loại hoạt tính ức chế trên bơm ABCC2
PHỤ LỤC 12. Kết quả mô hình phân loại hoạt tính trên bơm ABCC2 với cơ chất EG (CPG-C EG)
Hình PL-7. Bản đồ tự tổ chức của tập huấn luyện với (a) thể hiện hoạt tính ức chế (b) thể hiện hoạt tính cảm ứng.
(Màu sắc nơ-ron ứng với giá trị hoạt tính. Xanh nhạt: không có hoạt tính; Xanh đậm: ức chế, Đỏ: cảm ứng)
Bảng PL-7. Kết quả đánh giá mô hình CPG-C EG phân loại hoạt tính trên bơm ABCC2
PHỤ LỤC 13. Mô hình phân loại hoạt tính ức chế cơ chất CDCF (CPG-C iCDCF)
Hình PL-8. Bản đồ tự tổ chức của tập huấn luyện mô hình CPG-C iCDCF.
(Màu sắc nơ-ron ứng với giá trị hoạt tính. Xanh nhạt: không có hoạt tính; Xanh đậm: ức chế)
Bảng PL-8. Kết quả mô hình CPG-C iCDCF phân loại hoạt tính ức chế trên bơm ABCC2
PHỤ LỤC 14. Giá trị hoạt tính các chất ức chế bơm ABCC2 cơ chất EG dùng để xây dựng mô hình hồi quy
PHỤ LỤC 15. Giá trị hoạt tính các chất ức chế bơm ABCC2 cơ chất CDCF dùng để xây dựng mô hình hồi quy
PHỤ LỤC 16. Trình tự acid amin của bơm ABCC2
Kết quả sàng lọc ảo, 369 chất có khả năng ức chế bơm cả cơ chất EG và CDCF
PHỤ LỤC 17. Mười protein mẫu được I-TASSER sử dụng
PHỤ LỤC 18. Điểm số docking của các chất có hoạt tính ức chế
PHỤ LỤC 19. Điểm số docking và giá trị hoạt tính sinh học Ki của các dẫn chất methotrexat có hoạt tính ức chế
BỘ Y TẾ CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM
ĐẠI HỌC Y DƯỢC Độc lập – Tự do – Hạnh phúc
THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH
GIẤY XÁC NHẬN ĐÃ BỔ SUNG, SỬA CHỮA LUẬN VĂN THEO Ý KIẾNĐÓNG GÓP CỦA HỘI ĐỒNG CHẤM LUẬN VĂN THẠC SĨ ĐÓNG GÓP CỦA HỘI ĐỒNG CHẤM LUẬN VĂN THẠC SĨ