Khai thác các gen mã hóa enzyme hemicellulase

Một phần của tài liệu Nghiên cứu khai thác các gen mã hóa enzyme thủy phân hemicellulose từ hệ vi sinh vật cộng sinh trong ruột mối coptotermes gestroi (Trang 34 - 35)

Hình 3.10: Biểu đồ thể hiện % nhóm enzyme tham gia thủy phân lignocellulose trên tổng số enzyme tham gia vào đường phân.

Biểu đồ trên cho thấy nhóm enzyme tham gia thủy phân lignocellulose chỉ chiếm một phần nhỏ trong tổng số enzyme tham gia vào quá trình đường phân, đồng nghĩa với nhóm enzyme thủy phân hemicellulose là rất ít.

Sử dụng phầm mềm MetaGeneAnnotator, chúng tôi đã tìm ra ra các contig mã hóa cho protein chức năng.

Trong tổng số trên 290000 ORF (khung đọc mở mã hóa cho một protein chức năng), chúng tôi đã lọc được 8508 ORF (2.93%) có chức năng liên quan đến quá trình trao đổi carbohydrate. Tuy nhiên, trong số các ORF này, có 441(5.18%) đoạn ORF chưa xác định được thuộc nhóm enzyme, protein nào và có 584 ORF (6.88%) mã hóa cho cellulase, hemicellulase, còn

lại số lượng rất lớn enzyme khác (7924 ORF) tham gia trong quá trình chuyển hóa đường. Các ORF này đều là của nhóm vi khuẩn cộng sinh trong ruột mối. Điều này cho thấy hệ vi sinh vật trong ruột mối có khả năng sử dụng nhiều nguồn cacbon khác nhau và tạo được nguồn năng lượng lớn để mối sử dụng. Số ORF thuộc nhóm enzyme mã hóa cho hemicellulase gồm 7 loại:alpha- galactosidase, alpha-glucuronidase, alpha-N-arabinofuranosidase, arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase, endo-1,4-beta-xylanase, mannan endo-1,4- beta-mannosidase, xylan 1,4-beta-xylosidase (bảng 2):

Bảng 2: Sự đa dạng các enzyme thủy phân hemicellulose của hệ vi sinh vật trong ruột mối

STT Mã EC Hemicellulase được mã hóa từ gen Complete L‎ack 5'-endL‎ack 3'-end

L‎ack both ends Total 1 3.2.1.22 alpha-galactosidase 9 20 22 26 77 2 3.2.1.139 alpha-glucuronidase 3 4 5 8 20 3 3.2.1.55 alpha-N- arabinofuranosidase 15 11 14 29 69 4 3.2.1.99 arabinan endo-1,5-alpha-L- arabinosidase 2 3 7 12 5 3.2.1.8 endo-1,4-beta-xylanase 3 9 5 10 27

Một phần của tài liệu Nghiên cứu khai thác các gen mã hóa enzyme thủy phân hemicellulose từ hệ vi sinh vật cộng sinh trong ruột mối coptotermes gestroi (Trang 34 - 35)

Tải bản đầy đủ (DOC)

(43 trang)
w