Hiện nay, chất thải bệnh viện đang trở thành vấn đề về môi tr−ờng và xã hội cấp bách ở n−ớc ta. Hiện trạng xử lý chất thải bệnh viện kém hiệu quả đang gây d− luận trong cộng đồng và đặt ra nhiều thách thức đối với nhiều cấp, ngành, đặc biệt là ngành môi tr−ờng và y tế. Tuy nhiên, giải quyết vấn đề này không phải một sớm một chiều vì chúng ta đang đối mặt với rất nhiều khó khăn.
Nguồn kinh phí đầu t− cho xử lý chất thải y tế là rất lớn. Theo −ớc tính sơ bộ, tổng kinh phí cho toàn bộ ch−ơng trình đầu t− xây dựng hệ thống xử lý chất thải rắn, lỏng, khí vào khoảng 1,16 tỷ đồng ch−a kể chi phí cho sử dụng đất, ph−ơng tiện thu gom, vận chuyển, kinh phí vận hành và bảo trì. Vốn đầu t− cần đ−ợc huy động từ các nguồn ngân sách Nhà n−ớc, hỗ trợ của các tổ chức quốc tế, nguồn giúp đỡ của các tổ chức chính phủ và các tổ chức phi chính phủ. Hiện nay, các bệnh viện có lò đốt nh−ng kinh phí mua năng l−ợng để vận hành, để xử lý tro, để trả l−ơng cho nhân công còn ch−a đ−ợc quy định sẽ lấy từ đâu. Các bệnh viện không thể tự tiện nâng giá khám chữa bệnh để bù vào chi phí xử lý chất thải của mình. Vì vậy, có bệnh viện đã đ−ợc trang bị lò nh−ng vẫn không vận hành vì không có kinh phí.
Nhận thức về thực hành xử lý chất thải trong cán bộ y tế, nhân viên trực tiếp làm công tác xử lý chất thải và bệnh nhân còn ch−a cao, làm ảnh h−ởng không nhỏ đến chất l−ợng phân loại, thu gom, vận chuyển và tiêu huỷ chất thải. Một số lãnh đạo bệnh viện ch−a thực sự quan tâm đến việc xử lý chất thải. Việc tuyên truyền giáo dục ý thức cộng đồng ch−a sâu rộng, đôi khi d− luận qua báo chí còn làm nhân dân hoang mang, gây tâm lý quá lo sợ đối với chất thải bệnh viện và từ đó gây sức ép không đáng có lên các cơ quan quản lý chuyên ngành.
Môi tr−ờng thực hiện pháp chế ch−a thuận lợi. Mặc dù đã có Luật Bảo vệ Môi tr−ờng, Quy chế quản lý chất thải nguy hại do Thủ t−ớng Chính phủ ban hành và Quy chế chất thải y tế do Bộ tr−ởng Bộ Y tế ban hành nh−ng các văn bản pháp quy này ch−a thấm sâu vào đời sống. Việc thực hiện tốt Quy chế quản lý chất thải y tế mới chỉ có ở một số ít bệnh viện. Nhiều nơi chính quyền vẫn ch−a quan tâm đầu t− kinh phí và ph−ơng tiện để thực hiện Quy chế này.
Các giải pháp về xử lý chất thải ch−a đồng bộ, sự phối hợp liên ngành còn kém hiệu quả trong mọi công đoạn quản lý chất thải. Nhiều nơi bệnh viện đã phân loại chất
thải y tế và chất thải sinh hoạt nh−ng công ty môi tr−ờng đô thị từ chối vận chuyển chất thải y tế. Chúng ta ch−a có quy định cụ thể trách nhiệm của từng bộ, ngành trong từng công đoạn quản lý chất thải y tế.