- Khó khăn++ để phân tích các nồng độ đỉnh không rõ
1. SCN1A (2/3 các trường hợp), 2 SCN1B
2. SCN1B 3. GABA(A)-R s-u γ2 4. PCDH19 (females) Các động kinh nặng khác SZT2
Các bệnh ĐK đột biến đơn gen hiếm khi được xác nhận
Hầu hết Các động kinh vô căn chỉ xuất hiện rải rác và không có đặc trưng di truyền
Rất nhiều gene có thể là nguyên nhân
Fragmentation of Genomic DNA (sonication)
Linkers attached to DNA fragments,
Fragments hybridized to a capture microarray designed to target only the v.dons
Target v.dons enriched, eluted, then amplified by ligation-mediated PCR.
Amplified target DNA ready for high-throughput sequencing
Nghiên cứu bộ gen tổng thể trong các hội chứng ĐK và các động kinh toàn thể vô căn:
Exome sequencing in well-defined epileptic syndromes ex: GEFS+/Dravet Syndrome
Bài 1. « De novo » loss-of-function mutations in CHD2 cause a fever-sensitive myoclonic epileptic encephalopathy sharing
features with Dravet syndrome ».
Suls A, Jaehn JA, Kecsk駸 A, et al EuroEPINOMICS RES Consortium..
Am J Hum Genet 2013 ;93(5):967-75
« We studied a cohort of 9 Dravet-syndrome-affected individuals without SCN1A mutation … by using whole-exome sequencing in proband-parent trios.
In 2 individuals, we identified a de novo loss-of-function mutation in CHD2 (a chromodomain helicase DNA binding protein 2). A third CHD2 mutation was identified in an epileptic proband of a second cohort. »
Bài 2. « Exome sequencing reveals new causal mutations in children with epileptic encephalopathies. »
Veeramah KR, Johnstone L, Karafet TM, Wolf D, et al Epilepsia. 2013 Jul; 54(7):1270-81
« We performed WES on 10 trios ..with .. difficult-to-control seizures and
some combination of developmental delay, epileptic encephalopathy, autistic features, cognitive impairment or motor deficits.
In 9 of 10 probands, we identified one or more de novo variants predicted to alter protein function, for a total of 15.
Four probands had de novo mutations in known epilepsy genes (two in
SCN1A, one in CDKL5, one in EEF1A2). in three children, de novo variants were.. in genes plausibly relevant to epilepsy (KCNH5, CLCN4, ARHGEF15) … »
NGS in idiopathic epilepsies:
NGS in idiopathic generalized epilepsies: which variants are pathogenic?
Bài 3. « Exome sequencing followed by large-scale
genotyping fails to identify single rare variants of large effect in idiopathic generalized epilepsy (IGE) »
Heinzen EL, Depondt C, Cavalleri GL, Ruzzo EK, Walley NM et al Am J Hum Genet. 2012 ;91(2):293-302. -
« …In this study, we compare the exome sequences of 118 individuals
with IGE and 242 controls
1,935 variants were observed either as heterozygous or homozygous genotypes.
It is likely that this set of variants includes real risk factors. However, the
lack of significant association of single variants with disease in this two- stage approach emphasizes the high genetic heterogeneity of epilepsy disorders… »
Tổng hợp 2013
- Các bệnh ĐK đột biến đơn gen = gene với các chức năng rất đa dạng
- Gene gây động kinh --> biểu lộ lâm sàng bằng các cơn ĐK (kiểu hình) rất thay đổi ++
- Các hội chứng ĐK đơn gen rải rác: tần suất cao các đột biến trội "mới xuất hiện"
- Hầu hết các động kinh vô căn không có liên quan đến những gen đã biết
Kết luận