Như chúng ta đã biết, hệ thống kiểm soát nội bộ bao gồm 4 yếu tố là môi trường kiểm soát chung, hệ thống kế toán, thủ tục hay quy trình kiểm soát và kiểm toán nội bộ. Mặc dù trong điều lệ công ty có nêu lên vấn đề phải tổ chức và thực hiện công tác kiểm tra, kiểm soát nội bộ song trên thực tế cũng chưa ban hàng 1văn bản, qui định cụ thể nào về việc thành lập và tổ chức hệ thống kiểm soát nội bộ ra sao. Vì vậy, ở đây chúng ta chỉ có thể tập trung mô tả 1 số bộ phận, phòng ban có sự thể hiện rõ nét nhất nội dung kiểm soát nội bộ của công ty
* Ban kiểm soát: bao gồm 3 thành viên do Đại hội đồng cổ đông bầu ra với đa số phiếu bằng hình thức bỏ phiếu trực tiếp:
- Trưởng ban kiểm soát: ông Nguyễn Hồng Tuấn là cử nhân Luật, MBA sở hữu 1.150 cổ phần
- Uỷ viên kiểm soát:
+Bà Trần Thị Bích là cử nhân tài chính kế toán, sở hữu 1.610 cổ phần * Hệ thống kế toán:
Công ty cố phần chứng khoán Bảo Việt đang áp dụng hình thức kế toán tập trung. Theo hình thức này, toàn bộ công tác kế toán được thực hiện tập trung tại phòng kế toán của công ty.
Bộ máy kế toán của công ty bao gồm 10 nhân viên có trình độ chuyên môn về tài chính, kế toán và được bố trí thành các bộ phận như sơ đồ sau:
* Bộ phận kiểm toán nội bộ:
Trước đây, BVSC cũng có tổ chức phòng kiểm toán nội bộ song do hoạt động không hiệu quả, không có phương hướng, kế hoạch hoạt động rõ ràng dẫn tới trùng lặp với vai trò, chức năng của 1 số bộ phận khác nên đã ngừng hoạt động.