2.4.1Các hạn chế chung của PFSense
Lỗi do xung đột pakages
Trong quá trình nghiên cứu, do cơ chế cho phép cài thêm các ứng dụng đóng gói chạy trên nền hệ điều hành FreeBSD nên đôi lúc gây ra lỗi hệ thống do xung đột dẫn tới firewall không thể hoạt động ổn định. Mặt khác PFSense và FreeBSD là những hệ thống mã nguồn mở do đó việc phát triển các gói ứng dụng tích hợp không đƣợc kiểm duyệt và test kỹ càng nhƣ các sản phẩm thƣơng mại khác.
Hạn chế về cấu hình mặc định
Cấu hình thông thƣờng của hệ thống khi mới cài đặt chỉ đáp ứng cho mô hình mạng hoạt động cho khoảng 500 ngƣời dùng. Trong trƣờng hợp ứng dụng đƣợc triển khai với số lƣợng ngƣời dùng lớn hơn buộc phải can thiệp vào file cấu hình nhằm thay đổi các tham số sử dụng tài nguyên của hệ thống để đáp ứng nhu cầu này. Tuy nhiên việc thay đổi các tham số sử dụng tài nguyên thƣờng
xuất phát từ kinh nghiệm thực tế mà không có những chỉ dẫn cụ thể trong tài liệu do PFSense phát hành.
Thiếu tính ổn định của tính năng sao lƣu dự phòng
Với hệ thống đã nâng cấp hoặc cài đặt thêm gói việc backup và restore toàn bộ cấu hình sang một hệ thống mới đòi hỏi nhiều thời gian hơn và hoạt động cũng không thực sự ổn định so với việc sự mới và backup restore trên cùng một hệ thống, phiên bản.
Do là phần mềm mã nguồn mở đƣợc công đồng phát triển nên các lỗi hệ thống xuất hiện thƣờng mất nhiều thời gian để giải quyết do tùy thuộc vào hoạt động phi lợi nhuận của cộng đồng. (Có thể khắc phục bằng cách mua gói hỗ trợ trả phí theo năm để khắc phục vấn đề này).
Không tƣơng thích với các phần cứng mới
Không tƣơng thích với các thiết bị phần cứng mới do phải chờ PFSense đƣợc cộng đồng xây dựng lại trên phiên bản FreeBSD mới hơn.