Vai trò của vi rút HPV và các biến thể của nó trong ung thư cổ tử cung tại Bệnh viện Phụ sản Trung ương

MỤC LỤC

ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU

Chúng tôi lựa chọn những bệnh nhân điều trị tại Khoa Phụ ung thư, được chẩn đoán mắc UTCTC và đồng thời những bệnh nhân này cũng có kết quả xét nghiệm HPV dương tính với máy Cobas 4800. Tất cả các lọ mẫu bệnh phẩm tế bào CTC sau khi đã làm xét nghiệm Cobas 4800 (của những bệnh nhân trên) ở Bệnh viện Phụ sản Trung ương sẽ được thu thập được đóng gói và vận chuyển tới khoa vi sinh Bệnh viện Bệnh nhiệt đới Trung ương để tiến hành xét nghiệm. Test Cobas HPV là một công cụ quan trọng trong chẩn đoán và sàng lọc vi rút HPV, đặc biệt trong việc phát hiện các loại HPV nguy cơ cao như HPV 16 và HPV 18, có mối liên quan mạnh đến ung thư cổ tử cung.

Chúng tôi áp dụng phương pháp giải trình tự gen bằng máy giải trình tự gen ABI 3130/3100 là một hệ thống tự động được sản xuất bởi Applied Biosystems, một công ty chuyên về công nghệ di truyền và sinh học phân tử. Quá trình giải trình tự Sanger sử dụng phản ứng PCR để tạo ra một chuỗi các đoạn DNA có chiều dài khác nhau, và sau đó sử dụng phương pháp điện di để phân tích và xác định trình tự của các đoạn này. - Chẩn đoán hình ảnh bổ sung: Trong một số trường hợp, các xét nghiệm hình ảnh bổ sung như chụp X-quang, chụp cắt lớp vi tính (CT scan) hoặc cộng hưởng từ (MRI) có thể được sử dụng để đánh giá giai đoạn của ung thư cổ tử cung và xác định xem có xâm lấn sang các cơ quan khác không.

HPV nguy cơ cao: HPV (Human Papillomavirus) là một loại vi rút gây nên sự bất thường tế bào và có thể dẫn đến những vấn đề nghiêm trọng như ung thư cổ tử cung, âm đạo, xương chậu và hầu họng. Đối với các biến số định lượng, các phân tích thống kê được thực hiện bao gồm mô tả tần suất, độ phân tán và độ tập trung của số liệu, tính giá trị trung bình và độ lệch chuẩn, kiểm định phân bố theo phân phối chuẩn bằng test Kolmogorov-Smirnov, và kiểm định giá trị trung bình giữa các nhóm bằng kiểm định Student t-test. Tất cả những bệnh nhân tham gia vào nghiên cứu sẽ được thông báo, giải thớch rừ yờu cầu mục đớch của nghiờn cứu và họ tự nguyện tham gia và cú thể bỏ nghiên cứu bất cứ thời điểm nào.

Điều này đảm bảo rằng việc tham gia nghiên cứu không ảnh hưởng đến tình hình kinh tế của bệnh nhân và họ không phải gánh chịu bất kỳ chi phí nào liên quan đến các xét nghiệm này.

Bảng 2.2. Các biến số, chỉ số nghiên cứu  STT  Tên
Bảng 2.2. Các biến số, chỉ số nghiên cứu STT Tên

KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU

HPV 16

Như vậy, cùng thực hiện trên cùng đối tượng người Việt Nam, nhưng khác ở thời điểm nghiên cứu thì thấy rằng nghiên cứu của chúng tôi với nghiên cứu của Phạm Thị Thu Trang có sự chênh lệch về phân bố các sublineage (nghiên cứu này không tìm thấy sublineage B và C), tỷ lệ đột biến T350G cũng khác nhau (6,7% so với 18,2%), số đột biến ở hai gen E6 và E7 cũng khác nhau (11-16 và 6 - 9).107 Ngoài ra, so sánh với các nghiên cứu trên thế giới giữa chúng có sự khác biệt về tỷ lệ và chủng loại đột biến ở các gen E6, E7 và L1, riêng với đột biến T350G thì tỷ lệ có sự chênh lệch lớn giữa các nghiên cứu. Với số liệu của tác giả Totaro và cộng sự vẫn tìm thấy một tỷ lệ lớn đột biến (44%) ở người nhiễm HPV nhưng chưa tiến triển thành UTCTC, điều này cho thấy rằng độc lực của những chủng HPV 16 có mang đột biến T350 có thực sự thúc đây tiến trình UTCTC nhanh hơn hay không. Đây mới chỉ là những nghiên cứu ban đầu, do vậy cần những nghiên cứu sâu hơn và quy mô lớn hơn để đánh giá toàn diện về độc lực của HPV16 có mang đột biến T350G.110 Ngoài ra từ kết quả của nghiên cứu này chúng tôi cũng thấy rằng trên các đối tượng bệnh nhân khác nhau, ở các vùng địa lý khác nhau, thực hiện ở thời điểm khác nhau thì cho kết quả về mức độ đột biến và loại đột biến HPV cũng khác nhau.

Các yếu tố giúp một tỷ lệ nhỏ nhiễm HPV18 tiến triển thành UTCTC vẫn chưa được hiểu rừ, nhưng cỏc nghiờn cứu đó chỉ ra vai trò của biến thể di truyền HPV18.84,111 Dựa trên các kiểu phát sinh phổ biến của các nucleotide đơn đa hình (SNPs) trong vùng gen của vi rút L1, các biến thể HPV18 ban đầu được phân loại là người châu Âu (E), người Mỹ gốc châu Á (AA) hoặc người châu Phi (AFR). Tuy nhiờn, chưa cú bằng chứng rừ ràng rằng cỏc lineage B/C cú nhiều khả năng gây ung thư hơn ở Châu Phi hoặc lineage A đó có khả năng gây ung thư cao hơn ở Châu Âu.112 Tuy nhiên, sự xuất hiện ở mức cao đáng kể của lineage A1 ở bệnh nhân UTCTC tại Đông Á và Thái Bình Dương. Các protein gây ung thư có thể làm tăng biểu hiện của các gen liên quan đến tổng hợp DNA và điều phối cảm ứng chu kỳ tế bào, do đó làm tăng vòng đời sản xuất của HPV.87,113 Protein E6 gây ra sự tăng sinh tế bào bằng cách tương tác với nhiều protein của tế bào có liên quan đến việc ức chế khối u, bao gồm cả p53.

Kết quả nghiên cứu của chúng tôi, biến thể thường xuyên nhất là đột biến im lặng C287G, kết quả này phù hợp với nghiên cứu của Chang và cộng sự ở Đài Loan, đã báo cáo biến thể nucleotide giống hệt nhau và gợi ý rằng biến thể C thành G ở vị trí 287 có thể là một đột biến phổ biến trên toàn thế giới.81 Vì biến thể phổ biến này là một đột biến im lặng nên nó có thể được sử dụng như một dấu ấn sinh học để theo dừi và nghiờn cứu sự lõy truyền của vi rút.Protein E7 tương tác với một chất ức chế khối u tế bào khác, pRb, và phá vỡ chức năng bình thường của nó trong việc điều chỉnh chu kỳ tế bào, do đó kích thích biểu hiện của nhiều bản phiên mã do E2F điều chỉnh. Thực tế, vùng E7 của HPV- 16 và HPV-18 được bảo tồn cao, ngụ ý rằng nó mã hóa chức năng biến đổi chính và các vùng được bảo tồn rất quan trọng đối với các hoạt động biến đổi của từng protein gây ung thư của vi rút này.113-115 Một nghiên cứu gần đây của Todorovic và các cộng sự cho thấy rằng sự thay thế N92S có thể có ý nghĩa chức năng.116 Sự thay đổi này được dự đoán là sẽ làm tăng tiếp xúc trên bề mặt của vùng CR3 của protein E7 và tương ứng với đột biến ở HPV-16 (P92A) dẫn đến giảm khả năng dime hóa của E7 cũng như tăng khả năng biến đổi. Đây là nghiên cứu đầu tiên ở Việt Nam nghiên cứu cả ba gen E6, E7 và L1 trên 180 mẫu bệnh phẩm từ bệnh nhân mắc UTCTC và tiến hành so sánh với tình trạng người bệnh, các chỉ số lâm sàng, cận lâm sàng để tìm các yếu tố liên quan giữa genotype, lineage và sublineage của HPV với các yếu tố lâm sàng, cận lâm sàng của UTCTC.

- Việc xác định mối tương quan chính xác giữa trình tự gen và các giai đoạn bệnh cũng có thể bị ảnh hưởng do sự biến đổi không nhất quán, vai trò của từng tuýp HPV, dòng di truyền và đột biến, vì cần phải có đầy đủ dữ liệu gen với thông tin lâm sàng và cận lâm sàng của bệnh nhân, đòi hỏi quy mô và nguồn lực phù hợp.

BỆNH ÁN NGHIÊN CỨU

KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ GEN BẰNG MÁY ABI 3130/3100

- Phân tích và xác định trình tự: Sau khi phản ứng giải trình tự hoàn thành, máy giải trình tự ABI 3130/3100 sẽ tiến hành phân tích các đoạn DNA hoặc RNA đã được giải trình tự. Quá trình này sử dụng phương pháp điện di, trong đó các đoạn DNA hoặc RNA được chạy qua một màng gel điện di và được phân tách dựa trên kích thước và điện tích của chúng. Các tín hiệu fluorescent được ghi lại và chuyển đổi thành dạng số để tạo thành chuỗi trình tự.

- Phân tích dữ liệu: Kết quả từ quá trình giải trình tự được thu thập và xử lý bởi phần mềm phân tích dữ liệu đi kèm. Phần mềm này sẽ phân tích các dữ liệu số thu được từ máy giải trình tự và xác định trình tự của các đoạn DNA hoặc RNA. Máy giải trình tự gen ABI 3130/3100 có khả năng đáng tin cậy và cung cấp kết quả chính xác trong việc xác định trình tự gen.

Nó được sử dụng rộng rãi trong nhiều lĩnh vực như nghiên cứu di truyền, phân tích gen, phát hiện biến dị genetic, và nhiều ứng dụng khác trong lĩnh vực sinh học phân tử.

QUY TRÌNH XÁC ĐỊNH GENOTYPE CỦA 12 TUÝP NGUY CƠ CAO

HPV56seq 807F CCAAAGAGGACCTGCGTGTT HPV56seq 884R TACTTGATGCGCAGAGTGGG HPV56seq 828T TACAACAGCTGCTTATGG HPV68-FP ACAACAGCGTCACACAATTCAGT HPV68-RP CAGTTCTACGTTCCGCAGGTT. HPV51 392 Probe CATGAAATAGCGGGACGTTGGACG HPV53 FP AACGGTTTCACAAAATTTCACATATG HPV53 RP TGATTCAGTTGCTGTTGTGTGTCT HPV53 Probe ACCGGGTCGTGCCTGACATGC HPV66 433 F GTCCGTTAACACCGGAGGAA HPV66 495 R CCCGGTCCATGCATATGC HPV 66454 Probe. Genotype của mẫu được xác định dựa vào tín hiệu huỳnh quang của từng phản ứng PCR tương ứng.