Nghiên cứu sự hấp phụ các phân tử nhỏ lên các phân tử lớn dna protein

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HOC KHO A HỌC T ự NHIÊN Tên đề tài: NGHIÊN CỨU S ự HẤP PHỤ CÁC PHÂN TỬ NHỎ LÊN CÁC PHÂN TỬ LỚN DNA, PROTEIN MÃ SỐ: QT- 07- 24 CHỦ TRÌ ĐỂ TÀI: NCS Nguyễn Hữu Tho C Á C CÁN BÔ T H A M GI A: PGS.TS Lẽ K i m Long T h s Nguyẻn Xuân Viết ' 1-JUOc GIA HÀ NỘI PUNG TAr/ ÍHÕNG TIN THƯ ViẼN J )I/ HÀ NỘI - 2007 N il BÁO CÁO TÓM TẮT a Tên đề tài: Nghiên cứu hấp phụ phân tư nhó lên phân tư lớn D N A , P r o te i n b C h ủ trì đề tài: NCS Nguyễn Hữu Thọ c Các cán th a m gia: PGS.TS Lê Kim Long Th.s Nguyễn Xuân Viết d Mục tiêu nội dung nghiên cứu: M ục tiêu: Nghiên cứu gắn kết phối tử nhỏ lên phân tử lớn, c c y ế u t ố ả n h h n g đ ế n k h ả n ă n g g ắ n k ế t , từ đ ó x c đ ị n h đ ợ c vị trí p h â n tử lớn m p h n tử n h ỏ g ắ n lên Đ n h g i đ ợ c k h ' n ă n g g án kết c ú a c c p h â n tử n hỏ X c đ ị n h c ấ u trú c đ m h ì n h t h n h s a u g ắn kết, c ũ n g n h tí n h t o n đ ợ c đ ộ d i liên k ế t h i đ r ô t r o n g c c đ m Nội dung: - Sử d ụ n g lực l ợ n g tử, tí n h to n tr ự c ti ế p t n g t c c ú a p h ố i tử với đại ph ân tử Bằng vi ệ c t h ê m subroutine đê nâng cấp phần mềm S Q U A R E D t h n h p h ầ n m ề m S Q D N A S Q D O C K c h o c c n g h i ê n c ứ u vể D N A p ro te i n - Sử d ụ n g p h ầ n m ề m S Q D N A c h o n g h i ê n c ứ u g ắ n k ế t c c p h ố i tử n h ó lên c h u ỗ i p h â n t D N A - Sử d ụ n g p h ầ n m ề m S Q D O C K c h o n g h i ê n c ứ u g ắ n k ế t c c p h ố i tử lên ph â n tử p r o t e i n - X c đ ị n h c ấ u t r ú c đ m h ì n h t h n h sau g ắ n kết t ì m vị trí g n k ế t tốt n h ấ t p r o te i n m p h â n tử n h ỏ c ó t h ế g ắ n kết e Các kết đạt được: Đã nâng cấp phần mềm SQUARED, thu hai phần m ềm SQ D N A S Q D O C K c h o n g h i ê n c ứ u c c p h â n tử s i n h h ọ c ( D N A v p r o t e i n ) V i c h u ỗ i D N A t r o n g n g h i ê n c ứ u , g ắ n k ế t p h ụ t h u ộ c v ào: đ ộ p h â n cực c ủ a p h ố i tử k í c h th c p hô i tử, s ố l ợ n g n g h i ê n tử c ó t h ể t o li ê n kết hiđ r ỏ Bèn c n h đ ó , k h ẳ n g đ ị n h c c b a z k h c n h a u , vị trí c u a b a z k h c n h a u c ó n h h n g đ ế n k h n ă n g g ắ n kết c ủ a p h ố i tử lê n D N A V i p h a n tư p i o t e i n , x a c đ in h đ ợ c vị trí m p h ố i t ứ o a n k ế t lốt n h t c u trúc c ủ a d m h ì n h t h n h s a u g ắ n kết f Tình hình kinh phí đề tài: T ổ n g kinh phí cấp : 0.000.000đ Đ ã chi : 20.000.000đ KHO A Q U Ả N LÝ V G S T S N g u y ẻ n Văn Nội C H Ủ TRÌ Đ Ề TÀI NCS Nguyễn Hữu Thọ C Q U A N CH Ủ TRÌ ĐỀ TÀI HIỄU TrtƯỎN* SUMMARY REPORT OF THE SCIENTIFIC RESEARCH SUBJECT a Title of subject: T h e a d s o r p t i o n i n v e s t i g a t e o f the s m a l l m o l e c u l e s o n the DNA and the Proteins Code No: QT 07-24 b H ead o f subject: B.Sc Nguyen Huu Tho c P articip an ts: Asso.Prof.Dr Le Kim Long and M.Sc Nguyen Xuan Viet d Aim and contents of the subject: Aim: Study on the docking of ligands on macromolecules, the factors effect on the ab i li t y o f th e d o c k i n g , f r o m th a t f i n d i n g the p l a c e s in the- m o l e c u l e w h er e the l i g a n d c o u l d d o c k on S p e c i f y i n g th e c l u s t e r s t r u c t u r e s w h i c h w e re cr e a te d a f te r th e docking happends, therefore, calculating th e length of h y d r o g e n b o n d s in t h e s e cl u st er s Contents: - Using quatum forces for calculating directly ligand-m acrom olecule int er ac ti o n By a d d i n g s o m e s u b r o u t i n e s f o r u p g a d i n g Q U A R E D s o f t w a r e lo S Q D N A a n d S Q D O C K s o f t w a r e fo r D N A a n d p r o t e i n r e s e a r c h - U s i n g S Q D N A s o f t w a r e for the r e s e a r c h , th a t a p p l y f o r l i g a n d o n D N A m o l e c u le - U s i n g S Q D O C K s o f t w a r e f o r the r e s e a r c h , th a t a p p l y f o r l i g a n d o n p r o t e i n molecule - S p e c i f y i n g th e s t r u c t u r e s o f c l u s t e r s w h i c h w e r e c r e a t e d a f t e r t h e d o c k i n g , f i n d i n g the p l a c e s w h e r e the l i g a n d c o u l d d o c k on f o r b es t e The obtained results: U p g a d i n g S Q U A R E D s o f t w a r e in to S Q D N A a n d S Q D O C K s o f t w a r e w h i c h c o u l d c o n v e n i e n t l y be u s e d f o r th e r e s e a r c h s a b o u t b i o l o g i c a l m olecules W i t h th e D N A , th e d o c k i n g is d e p e n d e d o n p o l a r i z a t i o n , size oi l i g a n d a n d the q u a n t i t y the a t o m s w h i c h c o u l d h a v e t h e h y d r o e e n bond, t h e r e f o r e , a f f i r m i n g th a t the d i f f e r e n t b a s e s h a v e d i f f e r e n t abilites o f docking W ith th e p r o t e i n m o l e c u l e , s p e c i f y i n g th e p l a c e fo r b e s t \\ h ie h l m a m l c o u l d d o c k o n a n d the s tr u c t u re o f c l u st e rs MỤC LỤC MỞ Đ Ầ U P H Ư Ơ N G PH Á P N G H IÊ N c ứ u T Ó N G QUAN VÈ ĐỐI T Ư Ợ N G N G H I Ê N c ứ u Phân tử D N A Phân t P r o t e i n C S Ờ LÝ T H U Y É T Ph on g trình S c h r o d i n g e r Các p h o n g ph áp gần giải ph n g trình Schrod inge r Phư ơng ph áp động lực phân tử bán lượng t 18 K É T Q UẢ VÀ T H Ả O L U Ậ N 25 Gắn kết Cacbon Mo no Oxìt D i N A 25 Gắn kết 11:0 DNA 29 Gan kết cúa Urê D N A 31 Ga n kết Urê P r o t e i n 34 K É T L U Ậ N 3K T À I L I Ệ U T H A M K H Ả O 39 A MỞ ĐẢU Trong sinh vật luôn xảy trinh kết hợp phân tách cua phân tứ, q trình sinh hố đế tri tồn cua sinh vật D N A Protein nh ữ n g đại phân tử thể, có vai trị vơ quan trọng với sống, thể khả kết hợp VỚI phân tử khác nh phân tách chúng Q u trình gắn kết (docking) phân tư nho (phôi tu ligand) lên đại phân tử D N A hay Protein nhữ ng trinh sinh hoá thể sinh vật [11, 12], nhà khoa học giới rảt quan tâm Quá trình găn kết mức độ sở phân tử băt đâu băng trình phối tử tiên lại gần đại phân tử gắn kết vào vị trí thích hợp (active site) đại phân tứ Xác định “ vị trí thích h ợ p ” đâu đại phân tứ, nghiên cứu cấu trúc phức hinh thành phôi tử găn kèt lên dại phân tử [17] mục đích nghiên cứu đê tài Trong n hữ ng thập ký gân đặc biệt nh ữ n g năm gân đây, cơng nghệ máy tính, tin học phát triên cách nh anh ch ón g kỳ diệu, đù đáp ứng yêu cáu toán lớn, ph ứ c tạp mà trước kh ng thê thực Song sorm với phát triển cứa cô n g nghệ máy tính, ngơn ngữ lập trình (Pascal, C+ +, Fortran, Visual basic ) liên tục tiên, ngày gân gũi, thân thiện dề sư dụng Fortran ngơn n g ữ lập trình câp cao, nhà kh o a học ưa chu ộ ng sứ dụng rộng rãi, đặc biệt nơhiên cứu vê mơ phóng Hiện có nhiều phần sư dụng mơ phong, tính toán: Mo nte Carlo, M D, G am es s , Fhi, M o p a c dược vièt bă ng ngơn ngữ Fortran với mà ngn (sources) c u n g cấp miễn phí Với nguỏn tài nguyên sẵn có đó, với nhu cầu cấp thiết cua thời đại nghiên cứu gán kết (docking), chọn nghiên cứu đề tài ' N g h i ê n c ứ u s ự h ấ p p h ụ p h â n t n h ỏ lên p h â n t lớ n D N A , P ro te in " B án g việc cai tiến, nâng cấp mã nguồn m hai phần m ề m M D 4 G am es s , đồn.e thời thêm su br outine cân thiết, thuật toán n h ằm áp dụng; lên đối tư ợ n o la phối tử nho mìn kêt lên dại phân tử N h ữn g nghiên cứu trước vê docking sư dụn g tương tác cư học phân tư - M M ( M ol ec u la r Mechanics) Uu điểm cua mẫu học phân tư la kha tính toan nhanh thích h ợ p với nhữ ng hệ có số ngu yc n tư lớn T u y nhìrna kết qua thu dược từ mẫu M M chi m a n g tinh gân đứng có nhừng giới hạn định sư dụng đê nghiên cứu b ứ c tranh chi tiết trình gắn kết, đặc biệt cần phai kháo sát trinh di chuyê n electron “phối tử với D N A Protein” Đê kết gắn kết xác hơn, tương tác lượng tử tính đến Tuy có ưu điểm tính xác cao nh n g p hư ơng pháp lượng tư lại đòi hoi chi phí thời gian tính tốn lớn khó khăn áp dụng hệ lớn phân tư D NA Protein M ộ t nh ữ n g xu hư ớn g gần đê giai nhữ ng khó khăn gặp phải nghiên cứu docki ng sử dụng gân đá m nguyên tứ (cluster) Y tướng ph ơn g p h p gần đ ú ng đá m ng u yê n tử là: T n g tác phối tư nguyên tử gần (của D N A Protein) sử dụng tính tốn lượng tử, tương tác phối tứ n h ữ n g ngu yên tử lại -ngun tử xa- đại phán tử tính tốn bàng học phân tứ T hư ớc đo cua độ bền phức phối tử phân tử lón hình thành, lượng cua hệ “phơi tứ - đại phân tứ ” đạt giá trị cực tiểu Hiện thê giới ch ưa có tính tốn sư dụn g trực tiẽp tính tốn lưựng tử vào nghiên cứu gãn kêt phôi tứ đại phân tư T h e o n h ữ n g phân m è m tính tốn docking nay, lượng tính có sai sơ kh oan g 15% so vứi hàng rào lượng tạo đá m găn kêt, nên nhiệm vụ cua đê tài m o n g muôn sư dụng ý tướng “đá m găn kêt” tính tốn trực tiêp tương tác lượng tử tr one nghiên cứu gan kết Nghiên cứu găn kêt phôi tử lên D N A Protein, cân tiên hành tiến hai phần inêm M D 4 G am es s, ghép nôi hai phân m ề m ch o tính tốn tương tác xa tương tác gân Ph ơn g pháp sứ dựng đề tài đê ngh iên cứu tìm cảu trúc vị trí đ m hình thành phân tư D N A Protein p h n g pháp hồi phục dộng lực phân tử bán lượng tử Với p hư ơn g ph áp gần đ ú n g đ m ngu yên tư, két họp voi kỹ thuật lưới (grid), kỹ thuật ng uy ên tứ H thay (cascaduer), sư d ụ n ẹ ngôn ngừ lập trinh F O R T R A N ghép nòi hai phần m ề m M D 4 va G A M E S S [7] nhầm nàng cấp phần m è m S Q U A R E D [5] (vẫn sư d ụ n u đê nghiên cửu phán ứng pha khí) tạo phàn mề m S Q D N A sư dụng dè nghiên cứu sư ưấn kct phối tư nho c ho dổi tượng phân tư D NA Tiếp tục nâng cấp phân m ề m S Q D N A thành phần m e m S Q D O C K sư dụng đẻ nghiên cứu gần kốt phối tứ nho lèn phàn tư Protein Các nghiên cửu với cac phối tư dư ợc chọn nhăm kiê m chửng tính đấn hai phần m ề m thu được, nên tính toan tron tỉ dè tài tập trung giải thích tính chất định tính ảnh hườn g đèn trình aăn kêt Tr on g đ ề tài này, khảo sát q trình gắn kết phơi tư nho chọn trên, lên đối tượng đoạn mạc h đơn D N A bao gồm 10 bazo nitơ Đoạ n D N A cắt từ phân tử D N A , với m o n g muốn có mơ hinh đê nghiên cứu, nên cấu trúc đoạn D N A khôn g phải cấu trúc thực tế, khô ng tồn riêng lẻ Chuỗi DNA có mức độ ph ứ c tạp vừa phải, ch ứa bazơ nitơ vị trí ngẫu nhiên, phù hợp với mơ hình thử ngh iệm cho trình khảo sát găn kèt Phân tư Protein chọn đế nghiên cứu nhánh A phân tử p t b g ô m 222 axit amin câu tạo nên, file cấu trúc phân tử Protein (3ptb.pdb) lây ngân hàng dừ liệu protein (Protein Data Bank - ptlb) Hiện giới việc xác định vị trí găn kêt (active site) đêu thô ne qua đường thực nghiệ m, chưa có phần m ề m xác định dưực vị trí gắn kết bảng lý thuyết Đề tài nghiên cứu gẳn kết phối tứ lên phân tư lớn đàu tiên thực Việt nam, hướn g nghiên cừu lý thuyế t gãn liên với nghiên cứu thực tiền tương lai N h ữ n g kẻt qua thu cùa đê tài định hướng cho nghiên cứu tìm vị trí găn kẽt đại phân tứ cùa môi loại phôi tư khác Bên c ạn h đó, câu trúc dá m hình thành kha nâ n g gân kẻt cua phôi tư lên dại phân từ khảo sát tính tốn, có mơi liên hệ ràt gân gũi với cư chê hoạt dộng thuôc kh sinh n h kha nhiêm bệ n h CO' thẻ sinh vật Trong đê tài c h ú n g tập trung nghiên cứu ảnh hư ơn g cua n h ó m chức đên kha nănơ gan kết, bàn g cách thay phôi tử ngh iên cứu b n g phối tư khác chứa nh óm chức khác Ket qua đề tài m rộng với mong mn có thê áp dụng cho việc định hướng, đánh giá kha n ã n g điêu trị cua thuốc kháng sinh, cũ ng phát nhữ ng ngu yên nhân gây bệ n h ma sinh vật mac phai [18] Đây bước phát triển Ho lý thuyết áp đụng Hoá dược dế nghiên cửu tác dụng cua thuốc khái m sinh B PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN cứu I TỒNG QUAN VẺ ĐÓI TƯỢNG NGHIÊN c u P h â n t D N A Phân tử D N A đư ợc chọn nghiên cứu có hình dán g hình 1, chuỗi cắt từ mạ ch xoán kép D N A [13], gồ m 10 bazơ nitơ theo chiều ’- ’, có thú tự: A - T - G - C - A - G - T - C - A - G , g m 319 nguyên tử, Trong đó: A: Adenine; T: T h y m in e ; G: Guanine; C: Cytosine Các b a z nitơ liên kết với mạch phân tử D N A thông qua axit Nucleic, axit Nucleic nơi vó'i bới gơc P Câu trúc axit nucleic bazơ nitư dược trình b ày hình Việc chọn chuỗi D N A gô m bazơ nitư theo thú tự cách ngẫu nhiên, A de ni n e Guanine chọn lân c h ún g hai đầu mạch phân tử D N A , nên có thê khơng mang tính tơng qt cho q trình nghiên cứu gắn kết H ì n h C hi đ o n D N A ã c s d u n 0ọ tro n g khao sát — (a) (C) H ì n h Cấu trúc b a zơ n itơ chuỗi D NA (từ trải s a n g p i: b a z nitơ - axit nucleic- nhóm P 4) (Cl): Thymine, (b): Cytosine, (c): A denine, (d): G uanine P h â n t P r o t e i n Chuồi Protein de m nghiên cứu nhánh A phân tử 3ptb c ấ u trúc phàn tử 3ptb file 3ptb.pdb lấy từ ngân hàng dừ liệu protein (Protein D at a Bank: pdb), tổng cộng gôm 3220 nguyên tử tạo nên từ 222 amino ax.it nối với thông q u a liên kết peptit (C-N) W J 'x ■s X i r Hinh dáng phân tử chi hình c ấ u ' -N' ' V s -, * trúc không gian phân tử protein phức tạp phân tử D N A (soắn, cu ộ n ) , nhóm hoạt động protein am ino axit,chính ( phương pháp nghiên cửu cho protein có sơ * s 1 H ìn h P hân tư Protein điềm khác so với D N A [ 19, 20], s d ụ n g tro n g kha o sát II C O S Ở LÝ T H U Y É T [ , 3] P h u o n g t r ì n h S c h r o d i n g e r Phương trinh Schro ding er ph ươ ng trình quan trọng cư ban cua hoá học lượng tứ, trạng thái d ng có dạng: hk|/ = E.i|/ (2.1) Trong đó: i-i tốn tử Hamilton yự hàm sóng tồn phần m ô tả trạng thái cua hệ E lượng Giãi (2.1) thu nghiệm, hàm sóng vl; , thay vl; vào p h n g trình (2.1) thu dược tìiá trị năne; lư ợn g E a Tốn tứ Hamilton Xét hệ có nhiêu e nhiêu hạt nhân, p h n g trình S ch r o d in g er Cũ d n ” = ( 2 ) Vứi H / tốn tứ Hamilton tồn phàn cua hệ Xét với hệ đơn vị ngu yên tu ta có: N i V I - ằ p -l Ml H " ẳ N ^ ” * - ằ A M ẳ p=l A_l N M Ẻ pA p -i M - ^ P ’4 pt| \ \í A=ì li • A Ẻ I R T p chí H ó a học, T 45 (4), Tr - 483, 2007 KHẢO SÁT CẤU TRÚC ĐÁM HÌNH THÀNH KHI GAN k ế t H20 LÊN CÁC BAZƠ NITƠ TRONG CHUỒl DNA BẰNG PHƯƠNG PHÁP HÓI PHỤC BÁN LƯỢNG TỬ Đ ế n T ò a s o n - - 0 N G U Y Ễ N H Ũ U T H Ọ , Đ Ả N G Ú N G VÂN T r u n g t m ứ n ẹ c l u n g t i n t r o n g h o ú h ọ c Đ ụ i h ọ c Q n ô c Ị> ia H N ộ i SUMMARY T h e b y p a p e r h v d r o g e n v e r y d e a l s S c n i i - Q i u m t u m b o n d s lỊo o c l e x t e n d e d w i t h c a l c u l a t e d a g r e e m e n t t o s t u d y i n g R e l a x a t i o n s t u d y w i t h d i f f e r e n t a n d lilt' o n t h e m e t h o d t h e p l a c e s r e f e r e n c e s l i g a n d s a b i l i t y T h e i n I t o f ( l o c k i n g s t r u c t u r a l i \ H , o n d u s t e r s n i l r u t > c n h u s c IỊI p r o v i n g /licit f l i c (Hips n i i r o ụ c n U'fj'f b a s e d e f i n e d - w h e r e 1 , I \ x m n p \ T h e i h ’c k c i l s u i t a b l e l [ ) A U 'li^ ih s I A - SY C IS2 ) D Z = S Z U S ) - S Z M S 2) DR2 = D X 'D X + D Y * D Y + D Z 'D Z IF ( D R L T D R M I N I D R M I N = D i e E N D DO EN D DU IF ( D R M I N L T R M I N O R D R M I N G T R M A X ) G U T O M.(I W R I T E d w , *) I X G R I D I Y G R I D I Z G R I D L N P IX) E N D D(.) E N D DC) I V- K Ế T Q U Ả T Í N H T O Á N C h u ỗ i D N A d ợ c đ ậ t troni! h ộ p m ỏ pliịiiiỉ c ỏ tí nh cliãì t u ầ n h o n K í c h ill c h ộ p : x ( - 0 , 0 ) >1-10 19X0 , ) , z ( - ) ( h ì n h 1) n l i ó m hoại d ộ n l c c b u z n i t c ó s ố n g u y ê n lứ x c đ ị n h ( A d e n i n e : A 14 n g u y ê n tử; T h y m i n e : T 14 n g u v ẽ n (ứ: G u a n i n e : Cì 15 h 20 !> fị* # DNA n g u y ê n tử; C y t o s i n e : c 12 n e u y ẽ n lử) c ộ n g t h e m n g u y ê n t ứ H t h a y t h ế l o r a d m K h i p h â n tứ H ^ o l i ế p c n hãl kỳ m ộ t đ m n o , n ă n g l ợ n g d ợ c tínli t o n K h o n g c c h R,J ( k h o a n g c c h l ợ n g tử) d ợc c h ọ n , Ả , c c t h a m s ô c ủ a p h n g tr ì n h (5 ) c h ọ n / = v i ỈU V■ k h ố i l ợ n n n g h ị c h d o Ị.I = 2, K h i H ; t i ế p c án mộ t d m v > ( R mm < R ụ ) c c I h a n i sỏ n y đ ợ c c h ọ n 0,1 0.3 lực lúc n y đ c t í nh t h e o l ợ n g t ứ với c c n c u y ẽ n t t r o n " (hun, J t* ị} * Ưng với m ộ t n h ó m xú c dịnl i ironiỉ t | u irình hỏi p h ụ c c c g i trị n ă n g l ợ n d ợ c tí nh, m ỏ i iziá trị n ã i m krợiiii « ' ứ n g với m ộ t c â u t r ú c d m c u t r ú c b e n nliât c ó ” i.i In n ă n g l ợ n g c ự c ti ếu H ì n h d n g c ủ a d ỏ 111; iKiny lượm: ui a m * : * ‘ dấn phụ thuộc vào sổ hước hổi phục đéu có dạnc hình k //ìn/í / : C h u ỗ i D N A t r o n g h ộ p m ỏ 2u K h i n ă n g l ợ n g d ợ c s p \ ế [ ) t h e o t h ứ tư g i a m d n , d o d i l i ên k é t H - t r o n g p h â n tử n c p h u t h u ộ c llieo sú b ước h i p h ụ c c ó h ì n h d n g n h h ì n h 2b H ì n h : B i ế n t h i ê n n ă n g l ợ n t h e c s ố b c h ổ i p h ụ c (a) B i ế n t h i ẽ n đ ộ d ài l i cn k ết H - t r o n g p h n t ứ n c t h e o s ố b c hổi p h ụ c (b) Khi n ă n g l ợ n g g i m d a n , đ t đ ê n g i trị k h ô n ” d ổ i ( h ì n h a ) la tliá) d a o d ô n g nội p h a n lư cùa H :0 t h ể h i ệ n m ộ t c c h k h r õ ( h ì n h b ), k h i H ị O g a n lẽn D N A , k h o n £ c c h Rd.ii d n d ẽ n giá •rị ổn định C h ứ n g t ỏ t r n g thái “ H : - D N A " d ấ n đ t đ ế n c â n b ă n g T i ế n h n h q u é t t r o n g t o n b ộ k h õ n g g i a n h ộ p m p h ó n i ĩ c h ứ a p h â n t ứ D N A cl ui ng ta ihu n hi ều t h õ n g t i n h n k h i x é t đ è n c â u t r ú c c c d m d ợ c h ì n h i h n h p h n tư n ú c iỉán kci DNA ( hì nh 3) ( C h u ỗ i D N A n g h i ê n c ứ u g m 10 b a z n i t n ố i k ế t với n h a u q u a c c r i h n / Ihco t h ứ lự: A J.G C A jdT A A jG ,) 480 í , JsJi Ấ * V V ỄL z V M ,JÙ a p V V t , (a ) (b) (c) V € & tÙ Vh N> V- h V- L' (e) ft & Sw V' (I) o V >5 L tị t> ( g ) (h) II! / / // ; / ỉ j : C â u I n k c ủ a c c d m h ì n h t hanh H o g ắ n k ẽ t lên c c b a z a niUJ t rori” D N A L - y (a), ( b) , ( c) ứ n g với n h ỏ m A d e n i n e t I ( ( e) ứ n g với n h ó m C v l o s i n c t h ứ I \ / ( , ( g) , (h ) ứntỉ vói n h ó m G u a n i n e t .*■ (i), (j) ứ n e vói n h ỏ m T h y m i n e t h ứ v ~ 1® (J) T c ã u t i n e c u a c a c d ú m ( h ì n h 3) c h o t h y ( hìnl i 3a 3h, c i liên kól li nli õ 1Lr>>i