Tính đa hình và đặc điểm nhân trắc ở các nhóm kiểu gen của đa hình nucleotide đơn rs6548238 gen TMEM18 ở trẻ tiểu học miền bắc việt nam

Tạp chí Khoa học ĐHQGHN: Khoa học Tự nhiên Cơng nghệ, Tập 33, Số (2017) 95-100 Tính đa hình đặc điểm nhân trắc nhóm kiểu gen đa hình nucleotide đơn rs6548238 gen TMEM18 trẻ tiểu học Miền Bắc, Việt Nam Lê Thị Tuyết, Dương Thị Anh Đào* Trường Đại học Sư phạm Hà Nội, 136 Xuân Thủy, Hà Nội, Việt Nam Nhận ngày 16 tháng 12 năm 2016 Chỉnh sửa ngày 16 tháng 02 năm 2017; Chấp nhận đăng ngày 24 tháng 03 năm 2017 Tóm tắt Ở người, protein TMEM18 (Transmembrane protein 18) có vai trị q trình di cư tế bào tiền thần kinh qua nhân tố tiết u thần kinh đệm Sự biểu mạnh gen TMEM18 làm tăng trình di cư tế bào tiền thần kinh Đa hình đơn nucleotide (SNP) rs6548238 nằm vùng điều hòa gần gen TMEM18, SNP kết thay nucleotide T cho C mạch ADN Mối liên quan SNP rs6548238 với bệnh tật người nghiên cứu rộng rãi nước phát triển Mục tiêu nghiên cứu xác định tần số alen tỷ lệ kiểu gen SNP rs6548238 trẻ có tình trạng dinh dưỡng bình thường, đồng thời xác định số đặc điểm nhân trắc trẻ nhóm kiểu gen khác Nghiên cứu tiến hành 478 trẻ số trường tiểu học Hà Nội, thành phố Thái Nguyên thành phố Hải Dương Tình trạng dinh dưỡng trẻ xác định theo tiêu chuẩn WHO 2007 IOTF 2000 Kết cho thấy: alen C SNP rs6548238 alen có tần số cao quần thể (tần số = 0,952) tỷ lệ kiểu gen alen quần thể nghiên cứu tuân theo quy luật cân Hardy Weinberg (P = 0,059) Khi phân tích số nhân trắc nhóm kiểu gen cho thấy: số BMI có xu hướng khác biệt nhóm kiểu gen (P = 0,082), trẻ có kiểu gen C/C có số BMI trung bình cao (15,5), trẻ dị hợp C/T (15,1) trẻ đồng hợp T/T có số BMI thấp (14,4) Từ khóa: Gen TMEM18, rs6548238, trẻ em, miền Bắc Mở đầu người vào năm 2009 qua kết Zhao cs [3] nghiên cứu 4.951 trẻ Willer cs [4] nghiên cứu 32.387 người béo phì 59.082 người bình thường Từ đến có nhiều nghiên cứu mối liên quan gen TMEM18 với bệnh tật người Theo sở liệu HuGE Navigator [5], tính đến tháng 5/2016 có 30 bệnh báo cáo liên quan đến gen TMEM18, đó, số lượng báo cáo mối liên quan với việc tăng cân hay giảm cân thể nhiều với khoảng 80 báo cáo Ở người, gen TMEM18 (Transmembrane protein 18) nằm nhiễm sắc thể (NST) số 2, mã hóa cho protein xun màng TMEM18 có vai trị quan trọng di cư tế bào gốc thần kinh [1] TMEM18 biểu nhiều quan, mạnh vùng đồi tuyến yên [2] TMEM18 lần chứng minh locus quan trọng liên quan đến béo phì _  Tác giả liên hệ ĐT: 84-988081161 Email: phamquangtuan@hus.edu.vn 95 96 L.T Tuyết, D.T.A Đào / Tạp chí Khoa học ĐHQGHN: Khoa học Tự nhiên Công nghệ, Tập 33, Số (2017) 95-100 Rs6548238 đa hình đơn nuclêotit (SNP) nằm gần TMEM18, ảnh hưởng đến trình phiên mã gen TMEM18 ảnh hưởng đến kết hợp nhân tố phiên mã [6] SNP SNP gen TMEM18 phát liên quan đến béo phì vào năm 2009 nghiên cứu Zhao cs [3] SNP có số lượng nghiên cứu liên quan đến tăng cân, béo phì nhiều năm Các nghiên cứu ảnh hưởng SNP rs6548238 đến bệnh người đến chủ yếu thực đối tượng người Châu Âu người da trắng Tuy nhiên, mức độ ảnh hưởng đến bệnh lại không giống độ tuổi, giới tính quần thể người [5] Gần đây, thành công việc xây dựng quy trình xác định kiểu gen SNP rs6538238 gen TMEM18 điều kiện phịng thí nghiệm Việt Nam [7] Do đó, mục tiêu nghiên cứu áp dụng quy trình xây dựng để phân tích kiểu gen 478 trẻ tiểu học có tình trạng dinh dưỡng bình thường, từ xác định tần số alen, kiểu gen SNP quần thể trẻ em Việt Nam, xác định đặc điểm nhân trắc trẻ nhóm kiểu gen Đối tượng phương pháp nghiên cứu 2.1 Đối tượng nghiên cứu Đối tượng nghiên cứu 478 trẻ em tiểu học - 11 tuổi có tình trạng dinh dưỡng bình thường (nay gọi tắt bình thường) Hà Nội, Hải Dương Thái Nguyên Đây đối tượng chọn theo kết điều tra sàng lọc trường tiểu học thuộc Hà Nội, thành phố Hải Dương thành phố Thái Nguyên, lấy từ đề tài Bộ Giáo dục Đào tạo mã số B2014-17-47 (thông tin thu thập vào năm 2014) Đề tài Hội đồng Đạo đức Viện Dinh dưỡng Hội đồng Y đức viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương thông qua Bố mẹ trẻ tham gia nghiên cứu cung cấp đầy đủ thông tin mục đích nghiên cứu có giấy đồng ý tham gia nghiên cứu 2.2 Thu thập số liệu Các số nhân trắc gồm tuổi, chiều cao, cân nặng, chu vi vịng eo, chu vi vịng hơng, đo theo phương pháp thường quy Viện Dinh dưỡng Quốc gia Chiều cao đứng đo thước đo chiều cao đứng gỗ (độ xác 0,1cm), kết tính cm Cân nặng đo cân điện tử SECA 890 (Unicef) với độ xác 100g, kết tính kg Vịng eo, vịng hơng đo thước dây, kết tính cm Trẻ lấy ml máu tĩnh mạch vào buổi sáng sau nhịn đói Kỹ thuật viên lấy máu chuyên viên lấy máu bệnh viện Medlatec, bệnh viện Đa khoa Hải Dương Khoa Hóa Sinh, Đại học Y Thái Nguyên Máu bảo quản ống có tráng dung dịch chống đơng EDTA (ethylene diamin tetraacetic acid), sau chia vào ống eppendorf 1,5 ml bảo quản tủ lạnh -800C 2.3 Tiêu chuẩn xác định đối tượng nghiên cứu - Tiêu chuẩn xác định trẻ có tình trạng dinh dưỡng bình thường: trẻ xác định bình thường có tình trạng dinh dưỡng mức bình thường thoả mãn hai tiêu chuẩn Tổ chức Y tế giới (World Health Organization, WHO) năm 2007 Tổ chức hành động béo phì quốc tế (The Internatinal Obesity Task Force, IOTF) năm 2000 [8] Theo tiêu chuẩn WHO 2007 sử dụng Z-score BMI theo tuổi giới: ngưỡng từ -2SD đến +1SD [9] Tiêu chuẩn IOTF 2000 đưa ngưỡng xác định tình trạng dinh dưỡng cho trẻ từ 2-18 tuổi, tương đương với ngưỡng tình trạng bình thường béo phì sử dụng cho người lớn (18,5≤BMI