Định danh vùng gene 16s dna chủng vi khuẩn lam có khả năng gây độc tố ở hồ dầu tiếng​

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ TP HỒ CHÍ MINH ĐỒ ÁN TỐT NGHIỆP ĐỊNH DANH VÙNG GENE 16S DNA CHỦNG VI KHUẨN LAM CÓ KHẢ NĂNG GÂY ĐỘC TỐ Ở HỒ DẦU TIẾNG Ngành: Công Nghệ Sinh Học Chuyên ngành: Công Nghệ Sinh Học Giảng viên hướng dẫn : TS Hoàng Quốc Khánh HVCH Ngô Đức Duy Sinh viên thực MSSV: 1311101028 : Khưu Văn Quang Lớp: 13DSH06 TP Hồ Chí Minh, 2017 LỜI CAM ĐOAN Người thực đề tài xin cam đoan nội dung đồ án tốt nghiệp người thực đề tài làm Viện Sinh Học Nhiệt Đới TP.HCM, hướng dẫn TS.Hồng Quốc Khánh HVCH.Ngơ Đức Duy Các số liệu kết nghiên cứu đồ án trung thực, không chép từ báo cáo công bố trước Nội dung luận văn có tham khảo sử dụng tài liệu, thông tin đăng tải tác phẩm, tạp chí khoa học trang web theo danh mục tài liệu đồ án Nếu sai người thực đề tài xin chịu hoàn toàn trách nhiệm kỷ luật khoa nhà trường đề Sinh viên thực Khưu Văn Quang LỜI CẢM ƠN Trong thời gian làm đồ án tốt nghiệp Viện Sinh Học Nhiệt Đới TPHCM, hướng dẫn tận tình Thầy Cơ, anh chị bạn, em hoàn thành tốt báo cáo Em xin chân thành cảm ơn đến: Thầy Ngô Đức Duy phòng vi sinh ứng dụng, Viện Sinh Học Nhiệt Đới TPHCM tận tình hướng dẫn, bảo giúp đỡ em suốt thời gian thực đồ án tốt nghiệp Thầy Hoàng Quốc Khánh thầy Nguyễn Hồng Dũng phịng vi sinh ứng dụng, Viện Sinh Học Nhiệt Đới TPHCM giúp đỡ tạo điều kiện cho em làm đồ án tốt nghiệp đây, nhiệt tình hướng dẫn hỗ trợ để em thực tốt đồ án tốt nghiệp Chị Lê Quỳnh Loan bên cạnh giúp đỡ, chia kiến thức, kinh nghiệm tất anh chị, bạn nghiên cứu phòng Vi Sinh, Viện Sinh Học Nhiệt Đới TP.HCM nhiệt tình giúp đỡ dạy cho em nhiều điều suốt trình nghiên cứu Tồn thể Thầy Cơ khoa CNSH-TP-MT trường Đại Học Cơng Nghệ Thành Phố Hồ Chí Minh người tận tâm dạy dỗ truyền đạt kiến thức cho em ngày hôm Các bạn lớp 13SH06 quan tâm, giúp đỡ chia thứ với suốt quãng đường thời sinh viên Cuối cùng, xin cảm ơn Ba Mẹ ni nấng, chăm sóc, dạy dỗ cho ăn học thành người có ích cho xã hội Sinh Viên Thực Hiện Khưu Văn Quang MỤC LỤC MỤC LỤC DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT DANH MỤC HÌNH ẢNH DANH MỤC CÁC BẢNG MỞ ĐẦU…………………………………………………… …………………1 CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan tin sinh học 1.1.1 Sự đời tin sinh học 1.1.2 Khái niệm Tin sinh học 1.1.3 Vai trò xu hướng phát triển tin sinh học 1.1.4 Cây phát sinh loài 1.1.5 Công cụ cách tiến hành 1.1.6 Đánh giá kết 1.2 Tổng quan định danh sinh học phân tử 1.2.1 Các phương pháp ly trích thu nhận DNA tổng số 1.2.2 Phương pháp PCR ứng dụng 11 1.3 Tổng quan vi khuẩn lam 13 1.3.1 Giới thiệu vi khuẩn lam 13 1.3.2 Hình thái cấu trúc tế bào 14 1.3.3 Phân loại vi khuẩn lam 15 1.3.4 Hiện tượng nở hoa vi khuẩn lam 16 1.3.5 Độc tố microcystins 17 1.3.6 Hai hợp chất gây mùi geosmin 2-methylisoborneol .20 1.3.7 Tình hình nghiên cứu vi khuẩn lam độc tố vi khuẩn lam 21 CHƢƠNG 2: VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 25 2.1 Thời gian địa điểm 25 i 2.2 Vật liệu, thiết bị hóa chất 25 2.2.1 Dụng cụ thiết bị 25 2.2.2 Nguồn mẫu 25 2.2.3 Hóa chất 25 2.3 Phương pháp thu mẫu 27 2.3.1 Phương pháp phân lập 27 2.3.2 Phương pháp nuôi tăng sinh khối thu sinh khối vi khuẩn lam 27 2.3.3 Định danh chủng vi khuẩn lam sinh học phân tử 28 Thành phần chu trình nhiệt phản ứng PCR: 32 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ BIỆN LUẬN 35 3.1 Kết ly trích thu nhận DNA gene hình thái vi khuẩn lam 35 3.2 Kết đo nồng độ DNA gene sau ly trích thu nhận 36 3.3 Kết khuếch đại đoạn gen 16S DNA kỹ thuật PCR 37 3.3.1 PCR với cặp mồi CYA371F, 373R 37 3.3.2 PCR với cặp mồi CYA-F, CYA-R 38 3.4 Kết tinh sản phẩm PCR chủng vi khuẩn lam 39 3.5 Kết giải trình tự vùng gen 16S DNA chủng vi khuẩn lam .39 3.5.1 Mẫu (chủng Microsystis) 39 3.5.2 Mẫu 10 (chủng Anabaena) 40 3.5.3 Mẫu 29 (chủng Cylindropermopsis) 40 3.5.4 Mẫu 31(chủng plantothrix) 41 3.6 Kết so sánh trình tự gen ngân hàng NCBI xây dựng phát sinh loài 41 CHƢƠNG 4: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 44 4.1 Kết luận 44 4.2 Đề nghị 45 TÀI LIỆU THAM KHẢO 46 PHỤ LỤC ii DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT DNA Deoxyribo Nucleic Axit RNA Ribonucleic Acid EDTA Ethylene diamine tetraacetic acid NCBI National Center for Biotechnology Information PCR Polymerase chain reaction UV Ultraviolet TAE Tris acetate ethylenediaminetetraacetic acid MCs Microcystins MIB Methylisoborneol ITB Institute of Tropical Biology CTAB Cetyl Trimetyl Ammonium Bromide Cs Cộng SDS Sodium dodecyl sulfate Bp Base pairs UV Ultra violet iii DANH MỤC HÌNH ẢNH DANH MỤC HÌNH ẢNH Hình 1.1 Vi khuẩn lam nở hoa Hồ Dầu Tiếng 17 Hình 1.2 Cấu trúc hóa học loại độc tố microcystins thường gặp 18 Hình 1.3 Cấu trúc hóa học Geosmin 2-methylisoborneol MIB .21 Hình 2.1 Sinh khối vi khuẩn lam 28 Hình 2.2 Quy trình phản ứng PCR 31 Hình 3.1 Kết thu nhận DNA gene vi khuẩn lam gồm chủng gel agarose 1,5 35 Hình 3.2 Kết điện di gel agarose sản phẩm PCR với cặp mồi CYA371F, 373R 37 Hình 3.3 Kết điện di gel agarose sản phẩm PCR với cặp mồi CYA-F, CYA-R 38 Hình 3.4 Kết điện di gel agarose chủng vi khuẩn lam sau tinh 39 Hình 3.5 Cây phát sinh lồi dựa phân tích trình tự vùng gene 16S DNA chủng Microcystis, Anabaena, Plantothrix, Cylindropermopsis với vi khuẩn lam ngân hàng NCBI…………… ………………………………………….……42 iv DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 2.1 Chu trình nhiệt cặp mồi CYA371F 373R 32 Bảng 2.2.Chu trình nhiệt cặp mồi CYA-F CYA-R 33 Bảng 3.1 Kết đo nồng độ DNA gene sau thu nhận 36 v Đồ Án Tốt Nghiệp MỞ ĐẦU Tính cấp thiết đề tài Việc gia tăng dân số, phát triển ngành công nghiệp, nông nghiệp làm gia tăng nguồn dinh dưỡng (chủ yếu ni tơ phốt pho) đáng kể vào thủy vực Ô nhiễm dinh dưỡng diễn ngày quan trọng thủy vực sông, hồ, đầm nuôi trồng thủy sản kèm với tượng nở hoa nước mà thực chất phát triển mạnh mẽ quần xã thực vật chủ yếu vi khuẩn lam (VKL) Vi khuẩn lam sinh vật xuất trái đất cách hàng tỷ năm tồn ngày Cùng với vi tảo, vi khuẩn lam đóng vai trò quan trọng sinh thái thủy vực cung cấp nguồn lượng sơ cấp cho chuỗi thức ăn thủy vực, đồng thời giải phóng lượng oxy vào khơng khí thơng qua q trình quang hợp Tuy nhiên, bên cạnh đóng góp tích cực tượng tăng trưởng bùng phát hay cịn gọi nở hoa vi khuẩn lam gây nhiều ảnh hưởng xấu lên chất lượng môi trường nước, tài nguyên thủy sản cân hệ sinh thái Trong số lồi nhóm vi sinh có khả sản sinh độc tố Ở nước ta, vi khuẩn lam sinh độc độc tố chúng thường xuất thủy vực nước Chúng có khả sản sinh loại độc tố neurotoxin (độc tố thần kinh) hepatotoxin (độc tố gan) Độc tố nhóm vi sinh tác động nguy hiểm tới sinh vật thủy sinh sức khỏe người Do Tổ chức Y tế giới (WHO) quy định nồng độ giới hạn nước uống không vượt q µg/L Ngồi số chủng cịn sinh hợp chất gây mùi nước Ở Việt Nam ô nhiễm môi trường nước mà chủ yếu ô nhiễm chất hữu cơ, chất dinh dưỡng, kéo theo bùng nổ thực vật nổi, có tảo độc diễn phổ biến tác động hoạt động người lưu vực sông, hồ Tại hồ hồ Ba Bể, hồ Tây, hồ hoàn Kiếm, hồ Dầu Tiếng, hồ Trị An, hồ Núi Cốc Đồ Án Tốt Nghiệp quan sát thấy diện vi khuẩn lam độc chủ yếu loài thuộc Microcystis, Anabaena, Plantothrix, Cylindropermopsis Hồ Dầu Tiếng hồ chứa nước nhân tạo có chức ngăn lũ, cấp nước sinh hoạt, tưới tiêu, rửa mặn, cải thiện chất lượng nước nuôi trồng thủy sản Là nguồn cung cấp trực tiếp gián tiếp nước sinh hoạt tưới tiêu cho hàng triệu dân Tây Ninh, Bình Dương TP.Hồ Chí Minh Hiện nay, nghiên cứu cho thấy thành phần vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng đa dạng tượng nở hoa vấn đề quan trọng mang tính cấp bách Vi khuẩn lam nở hoa độc tố chúng sinh gây ảnh hưởng lớn tới sinh vật thủy sinh, động vật sống xung quanh hồ sức khỏe người Phần lớn nghiên cứu nước ta tập trung vào đánh giá đa dạng nhóm vi sinh thủy vực, đặc điểm hình thái nghiên cứu độc tính thực vật động vật thủy sinh Chưa có nhiều nghiên cứu tập trung định danh vùng gene 16S DNA chủng vi khuẩn lam Và đề tài khảo sát diện chủng vi khuẩn lam có khả gây độc tố hồ Dầu Tiếng Mục đích nghiên cứu Mục đích đề tài định danh vùng gene 16S DNA chủng vi khuẩn lam có khả gây độc tố Hồ Dầu Tiếng Nhiệm vụ nghiên cứu Phân lập số loài vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng Định danh vi khuẩn lam tới chi dựa theo hình thái học sinh học phân tử Khảo sát diện có mặt chủ yếu lồi vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng Phƣơng pháp nghiên cứu Phương pháp thu mẫu, phân lập mẫu nuôi tăng sinh khối, thu sinh khối vi khuẩn lam Đồ Án Tốt Nghiệp 4.2 Đề nghị Qua trình nghiên cứu tìm hiểu thơng tin từ nghiên cứu nước giới loài vi khuẩn lam định danh ngồi chủng vi khuẩn lam cịn có chủng khác như: Gloeotrichia, Desmonostoc Arthronema Vì thời gian cịn hạn chế nên có nhiều phương pháp quy trình mà đồ án chưa tiến hành thử nghiệm hết được, cần có nghiên cứu sau:  Cần xác định mức độ diện nhóm vi khuẩn lam gây bệnh, nhằm có biện phát hạn chế phát triển chúng nguồn nước cấp sinh hoạt cho người dân  Khảo sát khả gây bệnh chủng vi khuẩn lam phân lập  Khảo sát khả gây độc tố chủng 45 Đồ Án Tốt Nghiệp TÀI LIỆU THAM KHẢO  Tiếng việt [1] Dương Đức Tiến, 1996 Phân loại vi khuẩn lam Việt Nam NXB Nông nghiệp Hà Nội [2] Dương Thị Hoàng Oanh, Vũ Ngọc Út Nguyễn Thị Kim Liên, 2011 Nghiên cứu khả xử lý nước thải tảo Spirulina platensis Kỷ yếu Hội nghị Khoa học Thủy sản lần IV Trường Đại học Cần Thơ, trang 15-27 [3] Đào Thanh Sơn, Bùi Bá Trung Đỗ Hồng Lan Chi, 2013 Đa dạng sinh học vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng Hội nghị khoa học toàn quốc sinh thái tài nguyên sinh vật lần V Nxb Nông nghiệp, trang 660-665 [4] Đặng Ngọc Thanh, Hồ Thanh Hải, Dương Đức Tiến, Mai Đình Yên, 2002 Thủy sinh học thủy vực nước nội địa Việt Nam Nxb Khoa học Kỹ thuật, 399 trang [5] Nguyễn Lân Dũng, Nguyễn Đình Quyến Phạm Văn Ty, 2007 Vi sinh vật học Nxb Giáo dục, 519 trang [6] Đặng Đình Kim, Dương Thị Thủy 2014 Vi khuẩn lam độc nước Khoa học tự nhiên công nghệ, Hà Nội [7] Đào Thanh Sơn, Trần Trúc Ly, Phạm Thanh Lưu 2013 Nguy ngộ độc độc tố vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng Tạp chí STINFO số 1&2: 52-53 [8] Đào Thanh Sơn, Lê Thái Hằng, Phạm Thanh Lưu 2013 Ảnh hưởng độc tố vi khuẩn lam từ hồ Dầu Tiếng Tạp chí STINFO số 7: 28-36 [9] Trần Cẩm Xô (chủ biên), Nguyễn Thị Lan (2005), Cơ sở di truyền công nghệ gen, Nhà xuất khoa học kỹ thuật Hà Nội  Tiếng nƣớc [10] Baxevanis, A.D and Ouellette, B.F.F., eds., Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, third edition Wiley, 2005 ISBN 0-471-47878-4 46 Đồ Án Tốt Nghiệp [11] Claverie, J.M and C Notredame, Bioinformatics for Dummies Wiley, 2003 ISBN 0-7645-1696-5 [12] World Health Organization (WHO), 1996 Guidelines for drinking water quality Volume World Health Organization, Geneva [13] Komárek J., Anagnostidis K., 2005 Cyanoprokaryota Teil: Oscillatoriales In Büdel, B., Gärtner, G., Krienitz, L., Schagerl, M (Eds): Süβwasserflora von Mitteleuropa 19/2: 1-759 Gustav Fischer Verlag Jena [14] Komárek J & Anagnostidis K 1999 Susswasserflora von Mitteleuropa,Cyanoprokaryota Teil: Chroococcales Gustav Fischer Verlag Jena 548p [15] Chorus I., J Bartram, 1999 Toxic cyanobacteria in water: A guide to their public health consequences, monitoring and management Published on behalf of WHO, Spon Press, London, 416 pp [16] Dao, T S., G Cronberg, J Nimptsch, L C Do-Hong, C Wiegand, 2010 Toxic cyanobacteria from Tri An Reservoir, Vietnam Nova Hedwigia, 90: 433–448 [17] Sivonen K., Niemela S I., Niemi R M., Lepisto L., Luoma T H & Rasanenl L A 1988 Toxic cyanobacteria (blue-green algae) in Finnish fresh and coastal waters Hydrobiologi 190: 267-275 [18] Suvi Suurnakki, Gonzalo V Gomez-Saez, Anne Rantala-Ylinen, Jouni Jokela, David P Fewer, Kaarina Sivonen 2014 Identification of geosmin and 2-methylisoborneol in cyanobacteria and molecular detection methods for the producers of these compounds Water research 68: 56-66 [19] Thanh-Luu Pham, Thanh-Son Dao, Kazuya Shimizu, Do-Hong Lan-Chi and Motoo Utsumi 2015 Isolation and characterization of microcystinproducing cyanobacteria from Dau Tieng Reservoir, Vietnam Nova Hedwigia 101: 1–2, 3–20 47 Đồ Án Tốt Nghiệp [20] Thanh-Luu Pham, Thanh-Son Dao, Ngoc-Dang Tran, Jorge Nimptsch, Claudia Wiegand and Utsumi Motoo 2016 Influence of environmental factors on cyanobacterial biomass and microcystin concentration in the Dau Tieng Reservoir, a tropical eutrophic water body in Vietnam Ann Limnol - Int J Lim (2016) 1–12 [21] Thanh-Son Dao, Jorge Nimptsch and Claudia Wiegand 2016 Dynamics of cyanobacteria and cyanobacterial toxins and their correlation with environmental parameters in Tri An Reservoir, Vietnam Journal of Water and Health 14.4: 699-712 [22] Duy T N., Paul K S Lam, Glen R Shaw, Des W Connell 2000 Toxicology and risk assessment of freshwater cyanobacterial (bluegreen algal) toxins in water, Rev Environ Contam Toxicol 163: 113 –186 [23] Ena Urbach, Deborah L Robertson, Sallie W Chisholm 1992 Multiple evolutionary origins of prochlorophytes within the cyanobacteria radiation Nature Publishing Group 355: 1-4 [24] Kitching IJ, Forey PL., Humphries CJ., Williams DM 1998 Clasdistics, the theory and practice of parsimony analysis Oxford University Press 228pp Occurrence of the toxic cyanobacterium (blue-green alga) Microcystis aeruginosa in Central China Arch Hydrobiol 114: 21-30 [25] Page, R.D.M., Holmes, E.C 1998 Molecular Evolution Blackwell Publishing 346pp [26] Salemi M., Vandamme A-M 2006 The phylogenetic handbook, a practical approach to DNA and protein phylogeny Cambridge University Press 398pp [27] Ye SQ 2008 Bioinformatics: A Practical Approach CRC Press, Taylor & Francis Group Amber Hotto, Mike Satchwell, Gregory Boyer 2005 Seasonal Production and Molecular Characterization of Microcystins in Oneida Lake, New York, USA Environ Toxicol 20: 243–248.Carmichael, W.W., Yu, M J., He, Z.R, He, J.W and Yu, J-L 1988 48 Đồ Án Tốt Nghiệp [28] Friedrich Jüttner, Susan B Watson 2007 Biochemical and Ecological Control of Geosmin and 2-Methylisoborneol in Source Waters Appl Environ Microbiol 73: 4395-4406 [29] Olga Savichtcheva, Didier Debroas, Rainer Kurmayer, Clement Villar, Jean Philippe Jenny, Fabien Arnaud, Marie Elodie Perga, and Isabelle Domaizon 2011 Quantitative PCR Enumeration of Total/Toxic Planktothrix rubescens and Total Cyanobacteria in Preserved DNA Isolated from Lake Sediments Appl Environ Microbiol Vol 77, No 24: 8744–8753.6 [30] Amber Hotto, Mike Satchwell, Gregory Boyer 2005 Seasonal Production and Molecular Characterization of Microcystins in Oneida Lake, New York, USA Environ Toxicol 20: 243–24 [31] Kurmayer, R., G Christiansen, and I Chorus 2003 The abundance of microcystin-producing genotypes correlates positively with colony size in Microcystis and determines its microcystin net production in Lake Wannsee Appl Environ Microbiol 69:787–795 [32] Cronberg G., H Annadotter, 2006 Manual on aquatic cyanobacteria: A photo guide and a synopsis of their toxicology Kerteminde Tryk A/S, 106 pp [33] Zhou J et al (1996) DNA recovery from soils of diverse composition, Applied and Environmental Microbiology, 62 (2), 316 – 322 [34] Jara C et al (2008) Analysis of several methods for the extration of high quality DNA from acetic acid bacteria in wine and vinegar for characterization by PCR-based methods, International Journal of Food Microbiology, 128 (2), 336 - 341 [35] Zhu H, Qu F, Zhu LH Isolation of genomic DNAs from plants, fungi and bacteria using benzyl chloride Nucleic Acids Res 1993; 21(22), 5279-80 [36] Haruta S (2002) Construction of a stable microbial community with high cellulose – degradation ability, Appl Microbiol Biotechnol, 59 (4), 529 – 534 [37] Tomoyukihori, Shin Haura, Yohiyuki Ueno, Masaharuishii, Yasuo Igarashi (2006) Direct comparinson of singlesstand conformation 49 Đồ Án Tốt Nghiệp polymorphism (SSCP) and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) to characterize a microbial community on the basis of 16S RNA gene fragment, Journal of Microbiological Methods, 66, 165 – 169 [38] Friedrich Jüttner, Susan B Watson 2007 Biochemical and Ecological Control of Geosmin and 2-Methylisoborneol in Source Waters Appl Environ Microbiol 73: 4395-4406  Tài liệu từ Internet [1] https://voer.edu.vn/c/vi-khuan-lam/9b2ffb8d/6b311bf8 [2] https://vi.wikipedia.org/wiki/Tin_sinh_h%E1%BB%8Dc [3]http://tailieu.vn/doc/bai-giang-tin-sinh-hoc-chuong-1-ths-nguyen-thanhluan-1672608.html 50 Đồ Án Tốt Nghiệp PHỤ LỤC A Hình ảnh trang thiết bị phục vụ nghiên cứu Máy li tâm lạnh MIKRO 220R Nguồn EC105 Bể điện di QS-710 Hộp đèn soi UV Uvintec Máy PCR sprint thermo Cycler Đồ Án Tốt Nghiệp B Kết so sánh trình tự 16S DNA lồi vi khuẩn lam với ngân hàng gene NCBI Kết so sánh mẫu với chủng Microcystis aeruginosa LMECYA 147 trình tự đoạn gene 16S DNA Score 1602 bits (867) Query Sbjct 277 Query 61 Sbjct 337 Query 121 Sbjct 397 Query 181 Sbjct 457 Query 241 Sbjct 517 Query 301 Sbjct 577 Query 361 Sbjct 637 Query 421 Đồ Án Tốt Nghiệp Sbjct 697 Query 481 Sbjct 757 Query 541 Sbjct 817 Query 601 Sbjct 877 Query 661 Sbjct 937 Query 721 Sbjct 996 Query 781 Sbjct 1053 Query 841 Sbjct 1111 Kết so sánh mẫu 10 với chủng Anabaena ucrainica CHAB1431 trình tự đoạn gene 16S DNA Score 1624 bits (879) Đồ Án Tốt Nghiệp Query GG || Sbjct 222 GG Query 61 AG || Sbjct 282 AG Query 121 CT || Sbjct 342 CT Query 181 CG || Sbjct 402 CG Query 241 AG || Sbjct 462 AG Query 301 AG || Sbjct 522 AG Query 361 AG || Sbjct 582 AG Query 421 TA || Sbjct 642 TA Query 481 GA || Sbjct 702 GA Query 541 AA || Sbjct 762 AA Đồ Án Tốt Nghiệp Query 601 Sbjct 822 Query 661 Sbjct 882 Query 721 Sbjct 942 Query 781 Sbjct 1000 Query 841 Sbjct 1056 Query 901 Sbjct 1114 Kết so sánh mẫu 29 với chủng Cylindrospermopsis catemaco CHAB148 trình tự đoạn gene 16S DNA Score 1615 bits (874) Query Sbjct 321 Query 61 Sbjct 381 Đồ Án Tốt Nghiệp Query 121 GGC ||| Sbjct 441 GGC Query 181 TGG ||| Sbjct 501 TGG Query 241 AAA ||| Sbjct 561 AAA Query 301 GTA ||| Sbjct 621 GTA Query 361 CAT ||| Sbjct 681 CAT Query 421 CCT ||| Sbjct 741 CCT Query 481 AAC ||| Sbjct 801 AAC Query 541 CGG ||| Sbjct 861 CGG Query 601 CCA ||| Sbjct 921 CCA Query 661 ACA ||| Sbjct 981 ACA Đồ Án Tốt Nghiệp Query 721 Sbjct 1041 Query 781 Sbjct 1100 Query 841 Sbjct 1158 Kết so sánh mẫu 31 với chủng Planktothricoides raciborskii T1-6-2 trình tự đoạn gene 16S DNA Score 1443 bits (781) Query Sbjct 549 Query 62 Sbjct 609 Query 122 AGTAATCCTAACCGTAAACGATGGATACTAAGTGTTGTCTGTATCGACCCAGACAGTGCC | Sbjct 669 181 ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| AGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGTGTTGTCTGTATCGACCCAGACAGTGCC Query 728 182 CCA ||| Sbjct 729 GCA Query 242 AAT ||| Sbjct 789 AAT Đồ Án Tốt Nghiệp Query 302 Sbjct 849 Query 362 Sbjct 909 Query 422 Sbjct 969 Query 482 Sbjct 1029 Query 542 Sbjct 1089 Query 602 Sbjct 1149 Query 662 Sbjct 1209 Query 722 Sbjct 1268 Query 782 Sbjct 1328 ... trung định danh vùng gene 16S DNA chủng vi khuẩn lam Và đề tài khảo sát diện chủng vi khuẩn lam có khả gây độc tố hồ Dầu Tiếng Mục đích nghiên cứu Mục đích đề tài định danh vùng gene 16S DNA chủng. .. 20 Đồ Án Tốt Nghiệp 1.3.7 Tình hình nghiên cứu vi khuẩn lam độc tố vi khuẩn lam 1.3.7.1 Tình hình nghiên cứu vi khuẩn lam độc tố vi khuẩn lam giới Tình hình nghiên cứu vi khuẩn lam độc tố chúng... chủng vi khuẩn lam có khả gây độc tố Hồ Dầu Tiếng Nhiệm vụ nghiên cứu Phân lập số loài vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng Định danh vi khuẩn lam tới chi dựa theo hình thái học sinh học phân tử Khảo sát