Đang tải... (xem toàn văn)
Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.
GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG * PHAN TÂN DÂN MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ, YẾU TỐ LIÊN QUAN VÀ CĂN NGUYÊN VI RÚT CỦA VỤ DỊCH COVID-19 TẠI NHÀ MÁY POYUN, TỈNH HẢI DƯƠNG, NĂM 2021 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC HÀ NỘI - 2024 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG * PHAN TÂN DÂN MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ, YẾU TỐ LIÊN QUAN VÀ CĂN NGUYÊN VI RÚT CỦA VỤ DỊCH COVID-19 TẠI NHÀ MÁY POYUN, TỈNH HẢI DƯƠNG, NĂM 2021 Ngành : Dịch tễ học Mã số : 72 01 17 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS.TS Phạm Ngọc Hùng GS.TS Lê Thị Quỳnh Mai HÀ NỘI - 2024 LỜI CAM ĐOAN Tôi, Phan Tân Dân, Nghiên cứu sinh khóa 40, Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương, chuyên ngành Dịch tễ học, xin cam đoan: Đây cơng trình nghiên cứu thân trực tiếp thực hướng dẫn Thày, Cơ hướng dẫn; Cơng trình khơng trùng lặp với nghiên cứu khác công bố Việt Nam; Các số liệu thơng tin nghiên cứu hồn tồn xác, trung thực khách quan, xác nhận chấp thuận sở nghiên cứu Tôi xin hoàn toàn chịu trách nhiệm trước pháp luật cam kết này./ Hà Nội, ngày 22 tháng 02 năm 2024 Người viết cam đoan Phan Tân Dân LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành Luận án Tiến sỹ, trước hết tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc GS.TS Lê Thị Quỳnh Mai PGS.TS Phạm Ngọc Hùng, người Thày ln tận tình bảo, giúp đỡ, cho lời khuyên quý báu thời gian thực đề tài Nghiên cứu sinh, tiếp thêm động lực để tiến bước đường nghiên cứu khoa học Tôi xin cảm ơn Thày, Cô cán nhân viên Khoa Kiểm sốt Bệnh truyền nhiễm, Khoa Vi rút, Phịng Đào tạo Sau đại học/Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương, nhóm nghiên cứu Đại học Nagasaky Việt Nam nhiệt tình giúp đỡ tơi thời gian học tập thực nghiên cứu Viện Xin trân trọng biết ơn Thủ trưởng Cục Quân y, huy cán Phòng Y học dự phòng/Cục Quân y, huy, cán nhân viên Viện y học dự phịng Qn đội phía Nam/Cục Qn y tạo điều kiện thời gian để yên tâm học tập thực đề tài Tôi xin gửi lời cảm ơn tới cán bộ, công nhân Nhà máy POYUN (khu cơng nghiệp Cộng Hịa, thành phố Chí Linh, tỉnh Hải Dương) tham gia nghiên cứu; xin cảm ơn cán bộ, nhân viên y tế thuộc CDC tỉnh Hải Dương, Trung tâm Y tế thành phố Chí Linh, Đại học Y Hà Nội, Đại học kỹ thuật y tế Hải Dương hỗ trợ kịp thời, hiệu trình triển khai nghiên cứu thực địa phịng thí nghiệm Cuối cùng, tơi xin bày tỏ lòng biết ơn tới bố, mẹ hai bên gia đình, biết ơn vợ, con, em trai anh chị - người bên cạnh, động viên, hỗ trợ giúp đỡ để yên tâm công tác, học tập, nghiên cứu hoàn thành Luận án! NCS Phan Tân Dân MỤC LỤC ĐẶT VẤN ĐỀ Chương - TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan bệnh COVID-19 1.1.1 Tác nhân gây bệnh 1.1.2 Phương thức lây truyền 1.1.3 Khối cảm thụ 1.1.4 Lâm sàng 1.1.5 Điều trị dự phòng 1.1.6 Yếu tố liên quan đến lây nhiễm COVID-19 nơi sản xuất 1.1.7 Tình hình dịch bệnh giới Việt Nam 12 1.2 Một số đặc điểm vi rút học SARS-CoV-2 21 1.2.1 Đặc điểm sinh học phân tử vi rút SARS-CoV-2 21 1.2.2 Tổng quan đặc điểm huyết học SARS-CoV-2 29 1.3 Thông tin chung nhà máy POYUN .35 Chương - PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 38 2.1 Mô tả đặc điểm dịch tễ yếu tố liên quan tình trạng lây nhiễm COVID-19 nhà máy POYUN .38 2.1.1 Thiết kế nghiên cứu .38 2.1.2 Thời gian, địa điểm nghiên cứu 38 2.1.3 Đối tượng nghiên cứu 38 2.1.4 Cỡ mẫu phương pháp chọn mẫu 39 2.1.5 Các số, biến số nghiên cứu 41 2.1.6 Thu thập thông tin 46 2.1.7 Nhập phân tích số liệu 46 2.2 Phân tích số đặc điểm vi rút SARS-CoV-2 gây vụ dịch 48 2.2.1 Thiết kế nghiên cứu .48 2.2.2 Cỡ mẫu, phương pháp chọn mẫu 48 2.2.3 Đối tượng nghiên cứu 48 2.2.4 Thời gian, địa điểm nghiên cứu 49 2.2.5 Các số, biến số nghiên cứu 49 2.2.6 Quy trình nghiên cứu 50 2.2.7 Nhập phân tích số liệu 51 2.3 Các xét nghiệm sử dụng nghiên cứu 52 2.3.1 Xét nghiệm SARS-CoV-2 Realtime RT-PCR 52 2.3.2 Xét nghiệm giải trình tự gen hệ (NGS) 53 2.3.3 Kỹ thuật ELISA phát kháng thể IgG .53 2.4 Đạo đức nghiên cứu 55 2.4.1 Thời điểm đáp ứng chống dịch 55 2.4.2 Thời điểm tiến hành nghiên cứu huyết học 55 Chương 3- KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 57 3.1 Đặc điểm chung đối tượng nghiên cứu .57 3.2 Đặc điểm dịch tễ học vụ dịch COVID-19 59 3.2.1 Phân bố ca bệnh theo yếu tố người, không gian, thời gian 59 3.2.2 Một số đặc điểm lâm sàng ca bệnh COVID-19 64 3.2.3 Các yếu tố liên quan đến tăng nguy lây lan vụ dịch 67 3.3 Đặc điểm vi rút SARS-CoV-2 gây vụ dịch COVID-19 72 3.3.1 Một số đặc điểm sinh học phân tử 72 3.3.2 Đáp ứng kháng thể kháng SARS-CoV-2 nhà máy POYUN 76 Chương 4- BÀN LUẬN .85 4.1 Một số đặc điểm dịch tễ học số yếu tố liên quan đến lây nhiễm SARS-CoV-2 vụ dịch nhà máy POYUN 85 4.1.1 Tỉ suất công, hệ số lây nhiễm 85 4.1.2 Một số đặc điểm lâm sàng .89 4.1.3 Các yếu tố liên quan đến tăng nguy lây lan vụ dịch 92 4.2 Đặc điểm vi rút SARS-CoV-2 gây dịch nhà máy POYUN .97 4.2.1 Đặc điểm sinh học phân tử vi rút gây vụ dịch 97 4.2.2 Đặc điểm đáp ứng kháng thể IgG công nhân POYUN 102 4.3 Tính số hạn chế nghiên cứu 110 4.3.1 Tính nghiên cứu 110 4.3.2 Một số hạn chế nghiên cứu 113 KẾT LUẬN 116 KHUYẾN NGHỊ 118 PHỤ LỤC DANH MỤC VIẾT TẮT Chữ viết tắt Tiếng Anh ATSH Tiếng Việt An toàn sinh học ELISA Enzym-linked Immunosorbent Assay Phản ứng hấp phụ liên kết gắn enzym IHR International Health Regulation Điều lệ y tế Quốc tế ICU Intensive Care Unit Khoa điều trị tích cực MERS-CoV Middle East Respiratory Syndrom-Coronavirus Vi rút corona gây hội chứng viêm đường hô hấp cấp Trung Đông PHEIC Public Health Emergency International Concerns Tình trạng Y tế khẩn cấp sức khỏe cộng đồng toàn cầu RBD Receptor Binding Domand Vùng liên kết thụ cảm thể SARS-CoV Severe Acute Respiratory Syndrom-Coronavirus Vi rút corona gây hội chứng viêm đường hô hấp cấp SARS-CoV-2 Severe Acute Respiratory Syndrom-Coronavirus Vi rút corona gây bệnh viêm đường hô hấp cấp tính WHO World Health Organization Tổ chức Y tế giới USCDC The United States Center for The US Center for Disease Control and Prevention Trung tâm phòng ngừa kiểm sốt bệnh tật Hoa Kỳ VĐHHC Viêm đường hơ hấp cấp tính VOC Variants of Concern Biến thể lo ngại VOHC Variants of High Consequence Biến thể gây hậu nghiêm trọng VOI Variants of Interest Biến thể quan tâm Variants of Monitor Vệ sinh dịch tễ Trung ương Biến thể cần theo dõi VSDTTƯ VUM DANH MỤC BẢNG Trang Bảng 1.1 Các protein không cấu trúc vi rút SARS-CoV-2 23 Bảng 2.1 Các số, biến số sử dụng nghiên cứu 41 Bảng 3.1 Đặc điểm chung đối tượng nghiên cứu 57 Bảng 3.2 Phân bố ca bệnh theo số đặc trưng mẫu nghiên cứu 59 Bảng 3.3 Một số đặc điểm lâm sàng ca bệnh COVID-19 64 Bảng 3.4 Liên quan tình trạng mắc COVID-19 với triệu 65 chứng lâm sàng (phân tích đơn biến) Bảng 3.5 Yếu tố nhân chủng học liên quan tới nguy lây nhiễm 67 SARS-CoV-2 (phân tích đơn biến) Bảng 3.6 Các yếu tố môi trường làm việc liên quan tới nguy lây 68 nhiễm SARS-CoV-2 (phân tích đơn biến) Bảng 3.7 Các yếu tố liên quan đến nguy lây nhiễm nơi sinh sống 69 đối tượng nghiên cứu (phân tích đơn biến) Bảng 3.8 Các yếu tố liên quan đến lịch sử tiếp xúc, biểu lâm sàng 70 đối tượng nghiên cứu (phân tích đơn biến) Bảng 3.9 Các yếu tố liên quan đến tăng nguy lây nhiễm SARS- 71 CoV-2 phân tích hồi quy đa biến logistic Bảng 3.10 Danh sách mẫu giải trình tự gen vi rút SARS-CoV-2 72 Bảng 3.11 Tỉ lệ đối tượng có đáp ứng kháng thể IgG lần xét nghiệm 76 thứ Bảng 3.12 Chi tiết trường hợp có đáp ứng kháng thể IgG 77 Bảng 3.13 Tỉ lệ có đáp ứng kháng thể IgG lần xét nghiệm thứ 78 Bảng 3.14 Tỉ lệ phát kháng thể IgG theo nhóm nguy nhà 79 máy POYUN Bảng 3.15 Tỉ lệ phát kháng thể IgG nhóm nguy gia 81 đình, cộng đồng Bảng 3.16 Tình trạng đáp ứng kháng thể IgG theo nhóm nguy 82 khác Bảng 3.17 Đáp ứng kháng thể IgG người mắc COVID-19 83 Bảng 3.18 Đáp ứng kháng thể IgG theo thời gian nhóm đối tượng 84 có kết Realtime RT-PCR (+) với SARS-CoV-2 Bảng 4.1 Hệ số lây nhiễm chủng Alpha (B.1.1.7) số quốc 88 gia giới Bảng 4.2 Một số chủng vi rút SARS-CoV-2 lưu hành Việt Nam tính đến tháng 3/2021 98