Nghiên cứu mối liên quan giữa tỷ lệ methyl hóa gen sfrp2, rnf180 với lâm sàng, mô bệnh học ở bệnh nhân ung thư biểu mô dạ dày

BỘGIÁODỤCVÀĐÀO TẠO BỘQUỐCPHỊNG HỌCVIỆNQNY NGUYỄNMINHPHÚC NGHIÊNCỨUMỐILIÊN QUAN GIỮATỶ LỆMETHYLHĨAGENSFRP2, RNF180 VỚILÂMSÀNG, MƠBỆNH HỌC ỞBỆNHNHÂNUNGTHƢBIỂUMƠDẠDÀY LUẬNÁNTIẾNSĨYHỌC HÀNỘI–2021 LỜICAMĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng Các sốliệu, kết nêu luận án trung thực chưa cơng bố trongbấtkỳcơngtrìnhnghiêncứunàokhác TÁCGIẢLUẬNÁN NCS.NguyễnMinhPhúc Lờicảmơn Với tất chân thành kính trọng, tơi xin chân thành cảm ơn:Đảngủy, BanGiámđốc HọcviệnQny PhịngĐàotạoSauđạihọc-HọcviệnQny Ban chủ nhiệm thầy, cán bộ, viên chức Bộ mơn Nội Tiêu hóa,phịng chẩn đốn Sinh học phân tử - môn Sinh học Di truyền Y học Học việnQuâny Ban Giám đốc, Phòng Kế hoạch tổng hợp, Trung tâm phẫu thuật Tiêu hóa,khoaGiảiphẫubệnh-BệnhviệnQuân y103 Đãtạomọiđiềukiệnthuậnlợichotơitrongsuốtthờigian họctập Đặc biệt, tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến PGS.TS Nguyễn Thúy Vinh,PGS.TS Trần Văn Khoa tận tâm, tận tình, trực tiếp hướng dẫn dìu dắt tơitrongsuốtqtrìnhhọc tập,nghiêncứuvàhồnthànhluậnán Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến Đảng ủy, Ban Giám hiệu, Bộ mơn NộiTrườngĐại họcY DượcTháiBìnhđãtạomọi điềukiệnđểtơihồnthànhluậnán Xin cảm ơn toàn thể bệnh nhân nghiên cứu hợp tác giúp đỡtơitrongqtrìnhthựchiệnnghiêncứu Cuối cùng, tơi chân thành ghi nhớ tình cảm yêu thương bố mẹ haibên, vợ hai con, em bạn hữu sát cánh động viên giúp đỡtôitrongsuốtthờigian học tập,nghiêncứuvàhồnthànhluận án Xingửiđếntấtcảmọingườilịngbiếtơncủa tơi! Tác giả luậnán Nguyễn MinhPhúc MỤCLỤC Trang phụ bìaLờicam đoanLời cảm ơnMụclục Danh mục chữ viết tắtDanhmục bảng Danh mục biểu đồDanhmụchìnhản h ĐẶTVẤN ĐỀ CHƢƠNG1.TỔNGQUANTÀI LIỆU 1.1 Dịchtễ,cácyếutốnguy cơungthƣdạdày .3 1.1.1 Dịchtễungthưdạdày 1.1.2 Các yếutốnguycơ ung thưdạdày 1.2 Bệnhsinhung thƣdạdày 10 1.2.1 Cơ chếgâybệnhcủaH.pylori 10 1.2.2 Sinhhọc phântửtrongungthưbiểumơdạdày 11 1.3 Chẩnđốnung thƣdạdày 14 1.3.1 Lâmsàng .14 1.3.2 Cậnlâmsàng 15 1.3.3 Giảiphẫubệnh .18 1.4 Methyl hóaADN 23 1.4.1 Kháiniệmgen 23 1.4.2 CpGvà Promoter 24 1.4.3 Methyl hóaADN 24 1.5 Mộtsố phƣơngpháppháthiệnmethyl hóa 27 1.5.1 Phươngphápgiảitrìnhtựbisulfit .27 1.5.2 PhươngphápPCRmethylđặchiệu (MSP) 27 1.6 Cấutrúc vàchứcnăngcủagenSFRP2,RNF180 29 1.6.1 GenSFRP2 29 1.6.2 GenRNF180 32 1.7 NghiêncứuvềtìnhtrạngmethylhóaADNtrongungthƣ .34 1.7.1 NghiêncứuvềmethylhóagenSFRP2,RNF180trong ung thưbiểumơ dạdàytrên thếgiới.……………………… 34 1.7.2 Nghiên cứuvềtìnhtrạngmethyl hóamộtsốgen ởViệt Nam 37 CHƢƠNG2.ĐỐITƢỢNGVÀPHƢƠNGPHÁPNGHIÊNCỨU 39 2.1 Đối tƣợng nghiêncứu .39 2.1.1 Nhómnghiêncứu 39 2.1.2 Nhómchứng 39 2.2 Phƣơng phápnghiêncứu 40 2.2.1 Thiếtkếnghiêncứu: .40 2.2.2 Cỡ mẫunghiêncứu .40 2.3 Quy trìnhnghiên cứu 40 2.3.1 Nhómnghiêncứu 40 2.3.2 Nhómchứng 41 2.4 Hóachất,vậttƣ,trangthiếtbịsửdụngtrongnghiêncứu .42 2.4.1 Hóachất,vậttư,thiếtbịdùngchonộisoidạdày 42 2.4.2 Hóa chất,vậttư,thiếtbịdùngcho xétnghiệmmơbệnhhọc 42 2.4.3 Hóachất,vật tư,thiếtbịdùngcho xétnghiệmmethyl hóa 44 2.5 Quy trìnhkỹthuật thực hiệntrongnghiêncứu… .46 2.5.1 Nộisoi dạdày,lấymẫu sinh thiết chẩnđốn mơ bệnhhọc, methylhóa 46 2.5.2 Xửlýmô,nhuộmtiêubản,đọckếtquảmôbệnhhọc 47 2.5.3 Xét nghiệmmethyl hóabằng kỹthuật PCRđặchiệumethyl .49 2.6 Chỉtiêu nghiêncứu .50 2.6.1 Nhómungthưbiểumơdạdày 50 2.6.2 Nhómviêmdạdàymạn tính 51 2.7 Tiêuchuẩn đánh giá 52 2.7.1 Chẩnđoánthiếumáu 52 2.7.2 Vịtrígiảiphẫutrongdạdày 52 2.7.3 Hìnhảnhnộisoiviêmniêmmạcdạdày .52 2.7.4 Hình ảnhnộisoiungthưbiểumơ dạdàytiếntriển 53 2.7.5 Chẩnđốnmơbệnhhọc 53 2.7.6 Xét nghiệmmethylhóagenSFRP2,RNF180 56 2.8 Xửlýsốliệu 57 2.9 Sơđồ nghiên cứu 58 2.10 Vấn đềyđức .58 CHƢƠNG3.KẾTQUẢNGHIÊNCỨU .59 3.1 Đặc điểmchung 59 3.1.1 Đặc điểmvềgiớitính .59 3.1.2 Đặc điểmvềtuổi 59 3.2 Đặcđiểmlâmsàng,mơbệnhhọcnhómungthƣbiểumơdạdày tỷ lệ methyl hóagenSFRP2,RNF180 61 3.2.1 Đặc điểmlâmsàng 61 3.2.2 Đặcđiểmtổnthươngungthưbiểumôdạdày .63 3.2.3 Đặc điểmmôbệnhhọc 64 3.2.4 TỷlệmethylhóagenSFRP2,RNF180 .67 3.3 Liênquangiữatỷlệmethyl hóagenSFRP2,RNF180với lâmsàng,mơbệnhhọc 76 3.3.1 Liênquan giữatỷlệmethylhóagenSFRP2vớilâmsàng, nội soivà môbệnhhọc 76 3.3.2 Liênquan giữamethyl hóagenRNF180vớilâmsàng,nộisoi vàmơ bệnhhọc .79 3.3.3 Liênquangiữađồngmethyl hóa2genvớilâmsàng,nộis o i vàmơ bệnhhọc .83 CHƢƠNG4.BÀNLUẬN 87 4.1 Đặcđiểmlâmsàng,nộisoi,mơbệnhhọcnhómungthƣbiểumơ dạdàyvà tỷlệmethyl hóagenSFRP2,RNF180 87 4.1.1 Đặcđiểmvềgiớitính 87 4.1.2 Đặc điểmvềtuổi 88 4.1.3 Đặcđiểmlâmsàng 91 4.1.4 Đặc điểmtổnthươngtrênnộisoidạdày 98 4.1.5 Đặcđiểmmôbệnhhọc 100 4.1.6 Đặcđiểmvềgiai đoạn ungthư 108 4.1.7 Tỷlệmethyl hóagenSFRP2,RNF180 110 4.2 Liênquangiữatỷlệmethyl hóagenSFRP2,RNF180với lâmsàng,mơbệnh học .113 4.2.1 Liênquan giữamethyl hóagenSFRP2,RNF180vớigiớitính 113 4.2.2 LiênquangiữamethylhóagenSFRP2,RNF180với tuổi 114 4.2.3 LiênquangiữamethylhóagenSFRP2,RNF180với vịtríungthư 116 4.2.4 LiênquangiữamethylhóagenSFRP2,RNF180với dạngtổn thương 116 4.2.5 LiênquangiữamethylhóagenSFRP2,RNF180với thểmơbệnhhọc 117 4.2.6 LiênquanmethylhóagenSFRP2,RNF180vớigiaiđoạn TNMtheophân loạiAJCC(2010) 119 4.2.7 Liênquan giữamethylhóagenSFRP2,RNF180vớigiaiđoạn ungthưtheophânloạiAJCC(2010) 122 HANCHẾCỦA ĐỀTÀI .123 KẾTLUẬN 124 KIẾNNGHỊ 126 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH CƠNG BỐ KẾT QUẢNGHIÊNCỨUCỦAĐỀTÀI LUẬNÁN TÀILIỆUTHAMKHẢO DANH SÁCH BỆNH NHÂN NGHIÊN CỨUPHỤLỤC DANHMỤCCÁCCHỮ,KÝ HIỆU VIẾTTẮTTRONGLUẬNÁN TT Phầnviết tắt Phầnviết đầy đủ ADN AcideDesoxyribonucleic AJCC AmericanJointCommitteeonCancer (ỦybanHợpnhấtHoa Kỳvề Ungthư) APC Adenomatouspolyposisofthecolon ASIR AgeStandardisedInsidenceRate (Tỷlệmắcbệnh chuẩn hóatheo tuổi) ASMR AgeStandardisedMortalityRate (Tỷlệtửvongchuẩnhóa theotuổi) BMI BodyMass Index (Chỉsốkhối cơthể) BMP-2 BoneMorphogeneticp r o t e i n Bp Basepair BRCA1 Breastcancertype1susceptibility (gennhạycảmvớiungthưvú) 10 BS Bisulfit 11 CACNA2D3 Calcium Voltage-Gated Channel SubunitAlpha2delta3 12 CagA CytotoxinAssociatedgeneA (Yếu tốgâyđộc tếbào) 13 CDH1 Cadherin1 14 CDX2 CaudalTypeHomebox2 15 CI ConfidenceInterval(Khoảngtincậy) 16 COX-2 Cyclooxygenase-2gene Auxiiary TT Phầnviết tắt Phầnviết đầy đủ 17 CRD/FZ CysteineRichDomain/FrizzledDomain 18 CS Cộngsự 19 CTNNB1 Cateninbeta1 20 DAPK1 Death-associatedproreinkinase1 21 DNMT DNAmethylatransferase 22 DSR Dịsản ruột 23 EBV Epstein-BarrVirus 24 FDA FoodandDrugAdministration (Hiệphội thựcphẩmvà thuốcHoaKỳ) 25 GSTP1 GlutathioneS-transferasepi1 26 HDGC HereditaryDiffuseGastricCancer (Ungthưdạ dàylantỏaditruyền) 27 H&E HematoxylinvàEosin 28 HR HazardRatio (Chỉsốnguycơ) 29 IARC InternationalAgencyforResearchonCancer (TổchứcnghiêncứuungthưQuốctế) 30 IGFBP7 Insulinlikegrowthfactorbindingprotein7 31 IGF InsulinlikeGrowthFactor (YếutốtăngtrưởnggiốngInsulin) 32 IL Interleukin 33 JGCA JapaneseGastricCancerAssociation (HiệphộiungthưdạdàyNhậtBản) 34 LDL-Cholesterol LowDensityLipoproteincholesterol (Cholesteroltỷtrọngthấp)