Luận án tiến sĩ sinh học nguồn lợi cá trong các hệ sinh thái ở vùng biển ven bờ quảng nam đà nẵng

i LỜI CÁM ƠN Để hoàn thành luận án xin cảm ơn giúp đỡ tạo điều kiện Ban lãnh đạo Viện Hải dương học Tôi xin chân thành cảm ơn hướng dẫn tận tình hai thầy PGS.TS Võ Sĩ Tuấn TS Nguyễn Văn Long, định hướng nghiên cứu, giúp đỡ tận tâm thời học tập động viên tơi suốt q trình thực luận án Xin cám ơn lãnh đạo Sở Khoa học Công nghệ Thành phố Đà Nẵng, lãnh đạo Đại học Đà Nẵng cấp kinh phí cho tơi thực đề tài hỗ trợ cho trình thực luận án Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn tới GS.TS Nguyễn Ngọc Lâm tạo điều kiện ln động viên để tơi hồn thành chương trình nghiên cứu sinh Tôi xin chân thành cảm ơn TS Võ Văn Quang chủ nhiệm đề tài VAST06.05/1415 tạo điều kiện để tham gia nội dung điều tra nguồn giống cá mú Quảng Nam Đà Nẵng, Tiến sĩ Jean-Dominique Durand, Centre pour la biodiversité marine, l’ exploitation et la conservation (MARBEC)-France, giúp đỡ giải mã trình tự gen cá Dìa TS Nguyễn Thị Thu Thủy hướng dẫn tơi phân tích kết giải mã trình tự gen Hồn thành cơng trình xin chân thành cảm ơn KS Hứa Thái Tuyến, Thạc sĩ Phạm Bá Trung, Thạc sĩ Lê Thị Thu Thảo đồng nghiệp phòng Nguồn lợi Thủy sinh vật biển, phịng Động vật có xương sống biển, phòng Sinh vật phù du biển phòng chuyên mơn thuộc Viện Hải dương học đóng góp ý kiến, giúp đỡ nhiệt tình trình thực luận án Cảm ơn gia đình động viên tơi suốt thời gian thực luận án Nha Trang, tháng năm 2017 Nguyễn Thị Tƣờng Vi ii LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan công trình nghiên cứu riêng tơi, kết nghiên cứu trình bày luận án trung thực, khách quan chưa để bảo vệ học vị Cơng trình kết nghiên cứu tác giả trực tiếp tham gia thực với cộng tác đồng nghiệp đồng ý cho phép sử dụng luận án Tôi xin cam đoan giúp đỡ cho việc thực luận án cám ơn, thơng tin trích dẫn luận án rõ nguồn gốc Tác giả Nguyễn Thị Tƣờng Vi iv MỤC LỤC DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT vii DANH MỤC CÁC BẢNG vii DANH MỤC CÁC HÌNH x MỞ ĐẦU ĐIỂM MỚI CỦA LUẬN ÁN CHƢƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Tình hình nghiên cứu nguồn lợi cá 1.1.1 Trên giới 1.1.1.1 Nguồn lợi trạng khai thác 1.1.1.2 Liên kết sinh thái 11 1.1.2 Ở Việt Nam 15 + Biển Cù Lao Chàm 19 + Cửa sông Thu Bồn 20 + Biển Đà Nẵng 22 1.2 Đặc điểm khí hậu, thủy văn, địa hình trầm tích vùng biển ven bờ Quảng Nam Đà Nẵng 23 1.2.1 Khí hậu 23 1.2.2 Đặc điểm thủy văn 24 1.2.3 Đặc điểm địa hình trầm tích biển 25 1.2.3.1 Đặc điểm địa hình đáy biển 25 1.2.3.2 Đặc điểm trầm tích tầng mặt đáy biển 26 CHƢƠNG TÀI LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 29 2.1 ĐỐI TƢỢNG, PHẠM VI VÀ THỜI GIAN NGHIÊN CỨU 29 2.1.1 Đối tƣợng nghiên cứu 29 2.1.2 Phạm vi nghiên cứu 29 2.1.3 Thời gian thực 30 2.2 PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 30 2.2.1 Nghiên cứu đặc trƣng hệ sinh thái nguồn lợi cá liên quan 30 v 2.2.1.1 Đặc điểm sinh cư (habitat) 30 2.2.1.2 Thành phần loài cá 31 2.2.1.3 Đặc trưng nguồn lợi cá 34 2.2.2 Phân tích so sánh đặc trƣng nguồn lợi cá hệ sinh thái 39 2.2.2.1 Phân tích số đa dạng sinh học 39 2.2.2.2 Phân tích đặc tính sinh thái 40 2.2.2.3 Đặc trưng nguồn lợi 41 2.2.3 Nghiên cứu liên kết sinh thái 42 2.2.3.1 Thu mẫu nghiên cứu cấu trúc kích thước cá Dìa cơng (Siganus guttatus) 42 2.2.3.2 Thu mẫu phân tích ADN 44 2.2.4 Tài liệu trạng khai thác 46 Chƣơng KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN 47 3.1 ĐẶC TRƢNG CƠ BẢN CỦA CÁC HỆ SINH THÁI VÀ NGUỒN LỢI CÁ LIÊN QUAN 47 3.1.1 Đà Nẵng 47 3.1.1.1 Đặc điểm sinh cư 47 3.1.1.2 Thành phần loài cá 48 3.1.1.3 Đặc trưng nguồn lợi cá 51 3.1.2 Cù Lao Chàm 57 3.1.2.1 Đặc điểm sinh cư 57 3.1.2.2 Thành phần loài cá 60 3.1.2.3 Đặc trưng nguồn lợi cá 61 3.1.3 Cửa sông Thu Bồn 65 3.1.3.1 Đặc điểm sinh cư 65 3.1.3.2 Thành phần loài cá 67 3.1.3.3 Đặc trưng nguồn lợi cá 70 3.2 PHÂN TÍCH VÀ SO SÁNH ĐẶC TRƢNG NGUỒN LỢI CÁ GIỮA CÁC HỆ SINH THÁI 75 3.2.1 Tính chất thành phần loài 75 3.2.1.1 Thành phần loài cá ba khu vực 75 3.2.1.2 Đặc trưng thành phần độ giàu có lồi khu vực 77 vi 3.2.1.3 Đặc tính thích nghi theo độ mặn mơi trường sống 79 3.2.2 Đặc trƣng nguồn lợi 82 3.2.2.1 Thành phần nguồn lợi 82 3.2.2.2 Nguồn giống nguồn lợi 84 3.2.2.3 Kích thước khai thác số nguồn lợi cá liên quan đến sinh cư ven bờ 86 3.3 LIÊN KẾT SINH THÁI CỦA QUẦN THỂ CÁ DÌA CƠNG (Siganus guttatus) TRONG CÁC SINH CƢ VEN BỜ 89 3.3.1 Cấu trúc kích thƣớc 89 3.3.2 Quan hệ di truyền quần thể cá Dìa công hệ sinh thái 94 3.3.3 Liên kết sinh thái cá Dìa cơng sinh cƣ ven bờ 97 3.4 PHÂN TÍCH CÁC TÁC ĐỘNG VÀ BẤT CẬP TRONG KHAI THÁC VÀ QUẢN LÝ NGHỀ CÁ HIỆN NAY 101 3.4.1 Hiện trạng khai thác nguồn lợi cá 101 3.4.1.1 Năng lực tàu thuyền cấu ngành nghề khai thác 101 3.4.1.2 Xu thay đổi sản lượng thủy sản năm gần đây103 3.4.2 Các tác động nguồn lợi 105 3.4.3 Các bất cập công tác quản lý nghề cá 106 3.4.3.1 Những kết đạt công tác quản lý nghề cá 106 3.4.3.2 Các bất cập hoạt động khai thác quản lý nghề cá 108 3.5 ĐỀ XUẤT CÁC GIẢI PHÁP QUẢN LÝ VÀ SỬ DỤNG HỢP LÝ NGUỒN LỢI CÁ LIÊN QUAN ĐẾN CÁC HỆ SINH THÁI 110 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 115 KẾT LUẬN 115 KIẾN NGHỊ 116 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH ĐÃ CƠNG BỐ CỦA TÁC GIẢ CĨ LIÊN QUAN ĐẾN ĐỀ TÀI LUẬN ÁN 117 TÀI LIỆU THAM KHẢO 118 vii DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT ADN (hay ADN) : Axit đêoxyribonucleic CLC : Cù Lao Chàm COI : Vùng 5’ cytochrome oxidase I (COI) vị trí tiêu chuẩn mã di truyền CSTB : Cửa sông Thu Bồn cs : Cộng FL (Fork length) : Chiều dài thân từ mút đầu tới chẻ đuôi KBTB : Khu bảo tồn biển Nxb : Nhà xuất NTB : Nam Trung Bộ NE (North East) : Đông Bắc NCS : Nghiên cứu sinh NSTB : Năng suất trung bình PCA : Phân tích thành phần (Principal component analysis) TL (Total length) : Chiều dài toàn thân (từ mút đầu đến hết chiều dài đuôi) SW (South West) : Tây Nam Taxon : Đơn vị phân loại VĐN : Vịnh Đà Nẵng Ecological Connectivity: Liên kết sinh thái viii DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 2.1 Công trình nghiên cứu tác giả đặc điểm sinh cư vùng biển ven bờ Đà Nẵng, Cù Lao Chàm cửa sông Thu Bồn từ năm 2004-2009 30 Bảng 2.2 Cơng trình nghiên cứu thành phần lồi cá vùng biển Đà Nẵng, Cù Lao Chàm từ năm 1997-2010 31 Bảng 2.3 Thời gian địa điểm thu mẫu bổ sung danh lục thành phần loài cá 33 Bảng 2.4 Địa điểm thời gian tổ chức tham vấn cộng đồng 36 Bảng 2.5 Địa điểm thời gian tổ chức đợt khảo sát thu mẫu nguồn lợi 39 Bảng 2.6 Số lượng cá thể cá Dìa cơng (Siganus guttatus) thu mẫu nghiên cứu cấu trúc kích thước 43 Bảng 2.7 Địa điểm, số trạm, số mẫu thời gian tổ chức thực hoạt động thu mẫu 45 Bảng 2.8 Nguồn số liệu ngành nghề khai thác hải sản sản lượng hàng năm từ quan quản lý chuyên ngành địa phương 46 Bảng 3.1 Cấu trúc theo bậc taxon cá vùng biển Đà Nẵng 49 Bảng 3.2 Thành phần nguồn lợi vùng biển ven bờ Đà Nẵng 52 Bảng 3.3 Ước tính sản lượng doanh thu nguồn lợi vùng biển ven bờ ĐN năm 2011 53 Bảng 3.4 Danh sách thành phần loài cá liên quan rạn san hô bắt gặp vùng ven bờ Đà Nẵng 56 Bảng 3.5 Thành phần loài cá giống khai thác ven bờ Đà Nẵng 56 Bảng 3.6 Diện tích phân bố sinh cư vùng biển Đà Nẵng Cù Lao Chàm 59 Bảng 3.7 Cấu trúc theo bậc taxon cá vùng biển Cù Lao Chàm 60 Bảng 3.8 Thành phần nguồn lợi vùng biển Cù Lao Chàm 63 ix Bảng 3.9 Mùa vụ, ước tính sản lượng doanh thu nguồn lợi vùng biển CLC năm 2011 63 Bảng 3.10 Cấu trúc theo bậc taxon cá vùng cửa sông Thu Bồn 69 Bảng 3.11 Thành phần nguồn lợi vùng cửa sơng Thu Bồn 71 Bảng 3.12 Các loại nghề suất, mùa vụ khai thác nguồn lợi vùng cửa sơng Thu Bồn năm 2011 71 Bảng 3.13 Thành phần nguồn lợi cá giống khai thác vùng cửa sông Thu Bồn 73 Bảng 3.14 Sản lượng, doanh thu, mùa vụ khai thác nguồn lợi giống cửa sông Thu Bồn 73 Bảng 3.15: Cấu trúc theo bậc taxon thành phần loài cá khu vực nghiên cứu 76 Bảng 3.16 Các họ cá rạn san hơ có số lượng chiếm ưu khu vực nghiên cứu 78 Bảng 3.17 Độ giàu có lồi theo bậc họ khu vực 78 Bảng 3.18 Số lượng loài cá chung riêng cho khu vực 79 Bảng 3.19 Các nhóm nguồn lợi khu vực nghiên cứu 82 Bảng 3.20 Thành phần, sản lượng doanh thu nguồn giống cá vùng biển Đà Nẵng cửa sông Thu Bồn 84 Bảng 3.21 Tỉ lệ % loài cá Mú khai thác ba khu vực nghiên cứu 87 Bảng 3.22 Tóm tắt kích thước đàn cá Dìa cơng (Siganus guttatus) ba khu vực nghiên cứu từ tháng 07/2014 đến tháng 06/2015 90 Bảng 3.23 Tần số kiểu gien COI ba địa điểm thu mẫu tham số đa dạng nucleotide, số kiểu gien, đa dạng kiểu gien số nucleotide thay đổi quần đàn 95 Bảng 3.24 Mức độ khác quần đàn dựa tần số kiểu gien gien COI (Số ngoặc P-value “exact test”) 96 Bảng 3.25 Khoảng cách di truyền kiểu gien COI tìm thấy mẫu thu nghiên cứu 96 x DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 1.1 Bản đồ địa hình đáy biển từ Đà Nẵng-Thăng Bình (Quảng Nam) (Nguồn: Đề tài KH06.08-Lê Phước Trình, 2002) 27 Hình 1.2 Sơ đồ phân bố trầm tích tầng mặt từ Đà Nẵng-Thăng Bình (Nguồn: Đề tài KH06.08-Lê Phước Trình, 2002) 28 Hình 2.1 Sơ đồ phạm vi vùng biển nghiên cứu 29 Hình 2.2 Vị trí điểm thu mẫu cá phân tích tính đa dạng lồi vùng cửa sông Thu Bồn 32 Hình 2.3 Trạm vị thu mẫu cá giống vùng biển Đà Nẵng 37 Hình 2.4 Sơ đồ trạm vị khảo sát, thu mẫu nguồn giống cá 38 Hình 2.5 Sơ đồ trạm vị khảo sát, thu mẫu cá Dìa cơng vùng cửa sơng TB 42 Hình 3.1 Kích thước trung bình cá Hố hột Trichiurus lepturus khai thác nghề giã cào lưới rùng Đà Nẵng 54 Hình 3.2 Kích thước cá Dìa cana khai thác nghề lưới bén vùng biển Đà Nẵng 54 Hình 3.3 Chiều dài thân trung bình (mm) giống lồi cá liên quan đến rạn san hô vùng biển Đà Nẵng 57 Hình 3.4 Kích thước số lồi cá liên quan rạn san hô khai thác vùng biển CLC 64 Hình 3.5 Sơ đồ vùng phân bố sinh cư quan trọng vùng biển ven bờ Quảng Nam-Đà Nẵng 68 Hình 3.7 Tính thích nghi độ mặn nhóm cá khu vực 80 Hình 3.8 Tính thích nghi theo mơi trường sống nhóm cá thuộc khu vực 81 Hình 3.9 Sơ đồ vùng phân bố nguồn giống cá mú, cá Dìa cơng cá hồng hạ lưu sông Thu Bồn theo kết tham vấn cộng đồng 85 xi Hình 3.10 Phân bố bãi giống cá Dìa cơng (S guttatus) thảm cỏ biển Gị Hí 86 Hình 3.11 Chiều dài tồn thân trung bình số loài thuộc họ cá Mú ba khu vực nghiên cứu 88 Hình 3.12 Kích thước trung bình theo tháng cá Dìa cơng S guttatus khu vực 91 Hình 3.13 Cấu trúc nhóm kích thước theo tháng cá Dìa cơng khai thác ba vùng biển: Cù Lao Chàm, cửa sông Thu Bồn Đà Nẵng 93 Hình 3.14 Quan hệ tiến hóa loài thuộc giống Siganus dựa chuỗi ADN phần gien COI (có tham khảo chuỗi COI khu vực khác để xây dựng quan hệ tiến hóa) 98 Hình 3.15 Số lượng tàu cá qua năm 2012-2015 ba khu vực 101 Hình 3.16 Cơ cấu ngành nghề khai thác cá khu vực 102 Hình 3.17 Sản lượng khai thác thủy sản từ năm 2010-2015 khu vực nghiên cứu 104 Hình 3.18 Khu trì nguồn giống cá Dìa cơng vùng cửa sơng Thu Bồn 114 126 [79] Allen, G R., R Steen, P Humann and N Deloach (2003), Reef Fish Identification Tropical Pacific, New World Publications US, Printed by Star Standard Industries Pte Ltd Singapore, 457 p [80] Anderson, E D (1998), "The History of Fisheries Management and Scientific Advice - the ICNAF/NAFO History from the End of World War II to the Present” Journal of Northwest Atlantic Fishery Science, 23: 75-94 [81] Ayson, F G and T J Lam (1993), "Thyroxine injection of female rabbitfish (Siganus guttatus) broodstock: changes in thyroid hormone levels in plasma, eggs, and yolk-sac larvae, and its effect on larval growth and survival” Aquaculture, 109 (1): 83-93 [82] Ayson, F G., O S Reyes and E G T D Jesus-Ayson (2014), Seed production of rabbitfish Siganus guttatus, Aquaculture Extension Manual No 59 Southeast Asian Fisheries Development Center Aquaculture Department, 18 p [83] Berkström, C., T Jörgensen and M Hellström (2013), "Ecological connectivity and niche differentiation between two closely related fish species in the mangrove-seagrass-coral reef continuum” Mar Ecol Prog Ser., 477: 201-215 [84] Bernardi, G., S J Holbrook and R J Schmitt (2001), "Gene flow at three spatial scales in a coral reef fish, the three-spot dascyllus, Dascyllus trimaculatus” Marine Biology, 138: 457-465 [85] Bina, M (2006), Gene Mapping, Discovery, and Expression: Methods and Protocols Methods in Molecular Biology Humana Press, Totowa, New Jersey, 334 p [86] Bradbury, I R., S Hubert, B Higgins, S Bowman, T Borza, I G Paterson, P V Snelgrove, C J Morris, R S Gregory, D Hardie, J A Hutchings, D E Ruzzante, C T Taggart and P Bentzen (2013), "Genomic islands of divergence and their consequences for the resolution of spatial structure in an exploited marine fish” Evolutionary Applications, 6: 450-461 [87] Bray, R N., A C Miller and G G Geesey (1981), "The Fish Connection: A Trophic Link Between Planktonic and Rocky Reef Communities?” Science, 214 (4517): 204-205 127 [88] Burke, L., L Selig and M Spalding (2002), Reef at Risk in Southeast Asia, World Resource Institute, 72 p [89] Campbell, S J., T Kartawijaya and E K Sabarini (2011), "Connectivity in reef fish assemblages between seagrass and coral reef habitats” Aquatic Biology, 13 (1): 65-77 [90] Carpenter, K E and V H Niem, (Eds), (1999), The living marine resources of the Western Central Pacific, Bony fishes (Mugilidae to Carangidae), Vol 4, part 2, FAO, Rome: 2069-2790 [91] Carpenter, K E and V H Niem, (Eds), (1999), The living marine resources of the Western Central Pacific Batoid fishes, chimaeras and bony fishes (Elopidae to Linophrynidae), FAO species identification guide for fishery purposes, Vol 3, Part 1, FAO, Rome: 1397-2068 [92] Carpenter, K E and V H Niem, (Eds), (2001), The living marine resources of the Western Central Pacific Bony fishes (Labridae to Latimeriidae), Vol 6, Part 4, FAO, Rome: 3381-4218 [93] Carpenter, K E and V H Niem, (Eds), (2001), The living marine resources of the Western Central Pacific Bony fishes (Menidae to Pomacentridae), FAO species identification guide for fishery purposes, Vol 5, Part 3, FAO, Rome: 2791-3380 [94] Chen, C A., M C Ablan, J W Mcmanus, J Bell, V S Tuan, A S Cabanban and K T Shao (2004), "Population structure and genetic variability of six bar wrasse (Thallasoma hardwicki) in Northern South Sea revealed by mitochondrial control region sequences” Mar Biotechnol., 6: 312-326 [95] Christensen, V T., L.R Garces, G.T Silvestre and D Pauly (2003), "Fisheries Impact on the South China Sea Large Marine Ecosystem: A Preliminary Analysis using Spatially-Explicit Methodology" Assessment, Management and Future Directions for Coastal Fisheries in Asian Countries (G Silvestre, L Garces, I Stobutzki, M Ahmed, R.A Valmonte-Santos, C Luna, L LachicaAliño, P Munro, V Christensen and D Pauly eds.), WorldFish Center Conference Proceedings: 51-62 128 [96] Christie, M R., B N Tissot, M A Albins, J P Beets, Y Jia, D M Ortiz, S E Thompson and M A Hixon (2010), "Larval Connectivity in an Effective Network of Marine Protected Areas” PLoS ONE, (12): e15715 [97] Clark, R., M E Monaco, R S Appeldoorn and B Roque (2005), "Fish habitat utilization in a Puerto Rico coral reef ecosystem” 56th Gulf and Caribbean Fisheries Institute: 467-485 [98] Clarke, K R and R N Gorley (2006), PRIMER v6: User Manual/Tutorial Routines In Multivariate Ecological Research, Plymouth Marine Laboratory, 192 p [99] Craig, M T., Y Sadovy De Mitcheson and P C Heemstra (2012), Groupers of the World: A Field and Market Guide, CRC Press, 356 p [100] Cushing, D H (1971), "Upwelling and the Production of Fish" Advances in Marine Biology (S Russell Frederick and Yonge Maurice eds.), Academic Press: 255-334 [101] Dalzell, P and D Pauly (1990), "Assessment of the fish resources of southeast Asia, with emphasis of the Banda and Arafura seas” Netherlands Journal of Sea Research, 25 (4): 641-650 [102] Dibattista, J D., C Wilcox, M T Craig, L A Rocha and B W Bowen (2011), "Phylogeography of the Pacific Blueline Surgeonfish, Acanthurus nigroris, reveals high genetic connectivity and a cryptic endemic species in the Hawaiian archipelago” Journal of Marine Biology, 2011: 1-17 [103] Durand, J D., K N Shen, W J Chen, B W Jamandre, H Blel, K Diop, M Nirchio, F J Garcia De León, A K Whitfield, C W Chang and P Borsa (2012), "Systematics of the grey mullets (Teleostei: Mugiliformes: Mugilidae): molecular phylogenetic evidence challenges two centuries of morphologybased taxonomy” Molecular Phylogenetics and Evolution, 64: 73-92 [104] Duray, M N (1998), Biology and culture of Siganids Aquaculture Dept., Southeast Asian Fisheries Development Center (SEAFDEC) Tigbauan, Iloilo, Philippines, 54 p 129 [105] Dwiponggo, A (1987), "Indonesia's marine fisheries resources Indonesian marine capture fisheries” ICLARM Studies and Review (C Bailey, A Dwiponggo and F Marahudin eds.): 10-63 [106] Engelhard, G H (2008), "One hundred and twenty years of change in fishing power of English North Sea trawlers" Advances in fisheries science: 50 years on from Beverton and Holt (A Payne, J Cotter and T Potter eds.), Blackwell Publishing Ltd, Oxford, UK.: 1-25 [107] Eschmeyer, W N., (Editor) (1998), Catalog of fishes Special Publication, Vol 1-3, California Academy of Sciences, San Francisco, 2905 p [108] Excoffier, L., P E Smouse and J M Quattro (1992), "Analysis of molecular variance inferred from metric distances among DNA haplotypes: application to human mitochondrial DNA restriction data” Genetics, 131: 479-491 [109] FAO (2011), Review of the State of World Marine Fishery Resource FAO Fisheries and Aquaculture Technical Paper, No 569 Rome, 334p [110] FAO (2014), The State of World Fisheries and Aquaculture 2014 Rome, 223 p [111] FAO Fisheries Department (2003), The ecosystem approach to fisheries FAO Technical Guidelines for Responsible Fisheries, No 4, Suppl 2, Rome, 112 p [112] Froese, R and D Pauly, (Eds.) (2004), FishBase 2004: A Global Information System on Fishes, DVD-ROMs World Fish Center in collaboration with the Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO) and many other partners, and with support from the European Commission (EC) Penang, Malaysia [113] Grainger, R J R and S M Garcia (1996), Chronicles of marine fishery landings (1950–1994): trend analysis and fisheries potential FAO Fisheries Technical Paper 359, Roma, 51 p [114] Hara, S., M N Duray, M Parazo and Y Taki (1986), "Year-round spawning and seed production of the rabbitfish, Siganus guttatus” Aquaculture, 59 (3–4): 259-272 [115] Hara, S., H Kohno and Y Taki (1986), "Spawning behavior and early life history of the rabbitfish, Siganus guttatus, in the laboratory” Aquaculture, 59 (3–4): 273-285 130 [116] Heemstra, P C and J E Randall (1993), FAO species catalogue Groupers of the world (Family Serranidae, Subfamily Epinephelinae) An annotated and illustrated catalogue of the grouper, rockcod, hind, coral grouper and lyretail species known to date FAO Fisheries Synopsis, Vol 16., FAO, Rome, 522 figs, 531 colour plates, 382 p [117] Helfman, G S (2007), "Chapt 12: Coral Reefs, Fishes, and Fisheries: Exploitation in Fragile Ecosystems” Fish Conservation: A Guide to Understanding and Restoring Global Aquatic Biodiversity and Fishery Resources (Gene S Helfman ed.): 334-364 [118] Helfman, G S., J L Meyer and W N Mcfarland (1982), "The ontogeny of twilight migration patterns in grunts (Pisces: Haemulidae)” Animal Behaviour, 30 (2): 317-326 [119] Hixon, M A (2011), "60 Years of Coral Reef Fish Ecology: Past, Present, Future” Bulletin of Marine Science, 87 (4): 727-765 [120] Hobbie, J E (2000), “Chapt 1: Estuarine Science: The Key to Progress in Coastal Ecological”, In: Estuarine Science – A synthetic approach to research and practice (J E Hobbie ed.), Island Press, Washington, D.C., p 1-16 [121] Honda, K., Y Nakamura, M Nakaoka, W H Uy and M D Fortes (2013), "Habitat Use by Fishes in Coral Reefs, Seagrass Beds and Mangrove Habitats in the Philippines” PLoS ONE, (8): e65735 [122] Iwamoto, K., C.-W Chang, A Takemura and H Imai (2012), "Genetically structured population and demographic history of the goldlined spinefoot Siganus guttatus in the north Western Pacific” Fisheries Science, 78: 249-257 [123] Jackson, J B C., M X Kirby, W H Berger, K A Bjorndal, L W Botsford, B J Bourque, R H Bradbury, R Cooke, J Erlandson, J A Estes, T P Hughes, S Kidwell, C B Lange, H S Lenihan, J M Pandolfi, C H Peterson, R S Steneck, M J Tegner and R R Warner (2001), "Historical Overfishing and the Recent Collapse of Coastal Ecosystems” Science, 293 (5530): 629-637 [124] Jakobsen, T (1987), "Coastal cod in northern Norway” Fisheries Research, (2): 223-234 131 [125] Johannes, R (1978), "Reproductive strategies of coastal marine fishes in the tropics” Environmental Biology of Fishes, (1): 65-84 [126] Juario, J V., M N Duray, V M Duray, J F Nacario and J M E Almendras (1985), "Breeding and larval rearing of the rabbitfish, Siganus guttatus (Bloch)” Aquaculture, 44 (2): 91-101 [127] Juario, J V., M N Duray, V M Dwray, J F Nacario and J M E Almendras (1985), "Breeding and larval rearing of the rabbitfish, Siganus guttatus (Bloch)” Aquaculture, 44: 91-101 [128] Kaiser, M J., M J Attrill, S Jenning, D.N Thomas, D K A Barnes, A S Brierley, N V.C Polunin, D G Raffaelli and P J Le B Williams (2005), Marine Ecology: Processes, systems and impact, Oxford, United Kingdom, 501p [129] Kimura, S and K Matsuura (2003), Fishes of Bitung, Northern tip of Sulawesi, Indonesia, Ocean Research Institute, the University of Tokyo, iv+244 p [130] Kuiter, R H and D Helmut ( 2007), World Atlas of Marine Fishes, IkanUnterwasserarchiv, Germany, 728 p [131] Kuiter, R H and T Tonozuka (2001), Pictorial guide to Indonesian reef fishes: Jawfishes - Sunfishes, Opistognathidae – Molidae Part 3, Zoonetics, Australia: 623-893 [132] Kuiter, R H and T Tonozuka (2001), Pictorial guide to Indonesian reef fishes Eels- Snappers, Muraenidae – Lutjanidae Part Zoonetics, Australia, 302 p [133] Larson, W A., L W Seeb, M V Everett, R K Waples, W D Emplin and J E Seeb (2014), "Genotyping by sequencing resolves shallow population structure to inform conservation of Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha)” Evolutionary Applications, 7: 355-369 [134] Lau, P P F and L W H Li (2000), Identification guide to fishes in the live seafood trade of the Asia-Pacific region WWF Hong Kong and Agriculture, Fisheries and Conservation Department, Hong Kong, 137 p [135] Legendre, P and L Legendre (1998), Numerical Ecology Developments in Environmental Modelling, Amsterdam, 853 p Second English edition, Elsevier Science, 132 [136] Leis, J M and D S Rennis (1983), The larvae of Indo - Pacific coral Reef Fishes South Wales University and University of Hawaii Press, 269p [137] Leis, J M and T Trnski (1989), The Larva of Indo - Pacific shore fishes New South Wales University press, 850 p [138] Lepš, J and P Šmilauer (2003), Multivariate analysis of ecological data using CANOCO Cambridge University Press, New York, 269 p [139] Leu, M Y., C H Liou and L S Fang (2005), "Embryonic and larval development of the malabar grouper, Epinephelus malabaricus (Pisces: Serranidae)” Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom, 85 (05): 1249-1254 [140] Martinho, F., H N Cabral, U M Azeiteiro and M A Pardal (2012), "Estuarine nurseries for marine fish: Connecting recruitment variability with sustainable fisheries management” Marine environmental quality, 23 (4): 414433 [141] Matsuura, K and S Kimura (2005), Fishes of Libong Island, West coast Southern Thailand Ocean Research Institute, University of Tokyo, vii+78 p [142] Matsuura, K., O K Sumadhiharga and K Tsukamoto (2000), Field Guide to Lombok Island: Indentification Guide to Marine Organisms in Seagrass Beds of Lombok Island, Indonesia, Ocean Research Institute, University of Tokyo, viii+449 pages, plate [143] Meyer, J L and E T Schultz (1985), "Migrating haemulid fishes as a source of nutrients and organic matter on coral reefs” Limnology and Oceanography, 30 (1): 146-156 [144] Meyer, J L., E T Schultz and G S Helfman (1983), "Fish Schools: An Asset to Corals” Science, 220 (4601): 1047-1049 [145] Monaco, M E., A Friedlander, S D Hile, S J Pittman and R H Boulon (2008), "The coupling of St John, US Virgin Islands marine protected areas based on reef fish habitat affinities and movements across management boundaries” Proceedings of the 11th International Coral Reef Symposium, Ft Lauderdale, Florida, 2: 1029-1032 133 [146] Moore, J S., V Bourret, M Dionne, I R Bradbury, P O'reilly, M Kent, G Chaput and L Bernatchez (2014), "Conservation genomics of anadromous Atlantic salmon across its North American range: outlier loci identify the same patterns of population structure as neutral loci” Molecular Ecology, 23: 56805697 [147] Mora, C., S Adrefouet, M J Costello, C Kranenburg, A Rollo, J Vernon, K J Gaston and R A Myers (2006), "Coral Reefs and the Global Network of Marine Protected Areas” Science, 312 (5781): 1750-1751 [148] Mukai, T., S Nakamura and M Nishida (2009), "Genetic population structure of a reef goby, Bathygobius cocosensis, in the northwestern Pacific” Ichthyology Research, 56: 380-387 [149] Mullis, K B., F Faloona, S Scharf, R Saiki, G Horn and H Erlich (1986), "Specific enzymatic amplification of DNA in vitro: the polymerase chain reaction” Cold Spring Harbor Symposium on Quantitative Biology, 51: 263273 [150] Mumby, P J., J Flower, I Chollett, S J Box, Y.-M Bozec, C Fitzsimmons, J Forster, D Gill, R Griffith-Mumby, H A Oxenford, A M Peterson, S M Stead, R A Turner, P Townsley, P J H V Beukering, F Booker, H J Brocke, N Cabañillas-Terán, S W J Canty, J P Carricart-Ganivet, J Charlery, C Dryden, F C V Duyl, S Enríquez, J D Haan, R Iglesias-Prieto, E V Kennedy, R Mahon, B Mueller, S P Newman, M M Nugues, J C Núñez, L Nurse, R Osinga, C B Paris, D Petersen, N V C Polunin, C Sánchez, S Schep, J R Stevens, H Vallès, M J A Vermeij, P M Visser, E Whittingham and S M Williams (2014), Coral Reef Fisheries Management Towards Reef Resilience and Sustainable Livelihoods: A handbook for Caribbean coral reef managers (Peter J Mumby, Jason Flower, Iliana Chollett, Stephen J Box, Yves-Marie Bozec, Clare Fitzsimmons, Johanna Forster, David Gill, Rosanna Griffith-Mumby, Hazel A Oxenford, Angelie M Peterson, Selina M Stead, Rachel A Turner, Philip Townsley, Pieter J H van Beukering, Francesca Booker, Hannah J Brocke, Nancy Cabañillas-Terán, Steven W J Canty, Juan P Carricart-Ganivet, John Charlery, Charlie Dryden, Fleur C van 134 Duyl, Susana Enríquez, Joost den Haan, Roberto Iglesias-Prieto, Emma V Kennedy, Robin Mahon, Benjamin Mueller, Steven P Newman, Maggy M Nugues, Jorge Cortés Núñez, Leonard Nurse, Ronald Osinga, Claire B Paris, Dirk Petersen, Nicholas V C Polunin, Cristina Sánchez, Stijn Schep, Jamie R Stevens, Henri Vallès, Mark J A Vermeij, Petra M Visser, Emma Whittingham and Stacey M Williams eds.), University of Exeter, Exeter: 64-93 [151] Nagelkerken, I (2009), Ecological Connectivity among Tropical Coastal Ecosystems Springer, 615 p [152] Nagelkerken, I., M Dorenbosch, W C E P Verberk, E C D L Morinière and G V D Velde (2000), "Importance of shallow-water biotopes of a Caribbean bay for juvenile coral reef fishes: patterns in biotope association, community structure and spatial distribution” Marine Ecology Progress Series, 202: 175-192 [153] Nagelkerken, I., G Van Der Velde, M W Gorissen, G J Meijer, T Van't Hof and C Den Hartog (2000), "Importance of Mangroves, Seagrass Beds and the Shallow Coral Reef as a Nursery for Important Coral Reef Fishes, Using a Visual Census Technique” Estuarine, Coastal and Shelf Science, 51 (1): 31-44 [154] Nakabo, T., (Ed.) (2002), Fishes of Japan with pictorial keys to the species English edition, Tokai Universty Press, 1750 p [155] Nelson, J S (2006), Fishes of the World, 4nd edition, John Wiley & Sons, New York, 601 p [156] Newton, K., I M Côté, G M Pilling, S Jennings and N K Dulvy (2007), "Current and Future Sustainability of Island Coral Reef Fisheries” Current Biology, 17 (7): 655-658 [157] Nguyen Phi Dinh (1995), "The biological characteristics of marine fishes in Vietnam waters (Summary of the main studed results of the Institute of Oceanography)” Collection of Marine Research Works, VI: 135-145 [158] Nguyen, T T T (2008), "Population structure in the highly fragmented range of Tor douronensis (Cyprinidae) in Sarawak, Malaysia revealed by microsatellite ADN markers” Freshwater Biology, 53: 924-934 135 [159] Nguyen, T T T., B Ingram, S Sungan, G Gooley, S Y Sim, D Tinggi and S S De Silva (2006), "Mitochondrial ADN diversity of broodstock of two indigenous mahseer species, Tor tambroides and T douronensis (Cyprinidae) cultured in Sarawak, Malaysia” Aquaculture, 253: 259-269 [160] Nguyen Van Long and Vo Si Tuan (2014), "Establishment and management of fisheries refugia in Phu Quoc Marine Protected Area, Vietnam” Journal of the Marine Biological Association of India, 56 (1): 41-45 [161] Nguyen, V L., S T Vo, X B Hoang & K H Phan (2006), "Conservation of marine biodiversity: a tool for sustainable management in Cu Lao Cham Islands, Quang Nam province” Proceedings of 10th International Coral Reef Symposium, Okinawa, Japan: 1249-1258 [162] Ogden, J C and P R Ehrlich (1977), "The behavior of heterotypic resting schools of juvenile grunts (Pomadasyidae)” Marine Biology, 42 (3): 273-280 [163] Ogden, J C and E H Gladfelter, (Eds.) (1983), Coral Reefs, Seagrass Beds, and Mangroves: Their Interaction in the Coastal Zones of the Caribbean UNESCO Report in Marine Science 23, Paris, France, 133 p [164] Parrish, J D (1989), "Fish communities of interacting shallow-water habitats in tropical oceanic regions” Marine Ecology Progress Series, 58 (1): 143-160 [165] Pauly, D., V Christensen, J Dalsgaard, R Froese and F Torres (1998), "Fishing Down Marine Food Webs” Science, 279 (5352): 860-863 [166] Pauly, D., R Watson and J Alder (2005), "Global trends in world fisheries: impacts on marine ecosystems and food security” Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 360 (1453): 5-12 [167] Pittman, S J., C Caldow, S D Hile and M E Monaco (2007), "Using seascape types to explain the spatial patterns of fish in the mangroves of SW Puerto Rico” Marine Ecology Progress Series, 348: 273-284 [168] Pittman, S J., J D Christensen, C Caldow, C Menza and M E Monaco (2007), "Predictive mapping of fish species richness across shallow-water seascapes in the Caribbean” Ecological Modelling, 204 (1–2): 9-21 136 [169] Pittman, S J., C A Mcalpine and K M Pittman (2004), "Linking fish and prawns to their environment: a hierarchical landscape approach” Marine Ecology Progress Series, 283: 233-254 [170] Pomeroy, R S (2012), "Managing overcapacity in small-scale fisheries in Southeast Asia” Marine Policy, 36 (2): 520-527 [171] Rahman, M S., A Takemura and K Takano (2000), "Correlation between plasma steroid hormones and vitellogenin profiles and lunar periodicity in the female golden rabbitfish, Siganus guttatus (Bloch)” Comparative Biochemistry and Physiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology, 127 (1): 113-122 [172] Randall, J E., G R Allen and R C Steene (1990), Fishes of the Great Barrier Reef and Coral Sea University of Hawaii Press Honolulu, 507 p [173] Rollefsen, G (1965), "Norwegian Fisheries Research” FiskDir Skr Ser HaoUnders., 14 (1): 1-36 [174] Rooker, J R and G D Dennis (1991), "Diel, Lunar and Seasonal Changes in a Mangrove Fish Assemblage off Southwestern Puerto Rico” Bulletin of Marine Science, 49 (3): 684-698 [175] Russ, G and A Alcala (1989), "Effects of intense fishing pressure on an assemblage of coral reef fishes” Marine Ecology Progress Series, 56 pp 1327 [176] Sanchirico, J N and J E Wilen (2007), "Global Marine fishery resources: status and prospectus” International Journal of Global Environmental Issues, 7: 106-118 [177] Scheiber, H N (1986), "Pacific Ocean Resources, Science, and Law of the Sea: Wilbert M Chapman and the Pacific Fisheries, 1945-70” Ecology Law Quarterly, 13 (3): 381-534 [178] Sfetcu, N (2014), Fish & Fishing, Great Northern, 472 p [179] Sheaves, M (2005), "Nature and consequences of biological connectivity in mangrove systems” Marine Ecology Progress Series, 302: 293-305 [180] Sheaves, M (2009), "Consequences of ecological connectivity: the coastal ecosystem mosaic” Marine Ecology Progress Series, 391: 107-115 137 [181] Smith, T D (2002), “Chapter A History of Fisheries and their Science and Management”, In: Handbook of Fish Biology and Fisheries: Fisheries (Paul J B Hart and John D Reynolds eds.), Blackwell Science: 61-83 [182] So, N., G E Maes and F a M Volckaert (2005), "High genetic diversity in cryptic populations of the migratory sutchi catfish Pangasianodon hypophthalmus in the Mekong River” Heredity, 96 (2): 166-174 [183] Sparre, P and S C Venema (1998), Introduction to Tropical Fish Stock Assessment - Part 1: Manual FAO Fisheries Technical Paper 306/1 Rev 407 p [184] Staples, D and S Funge-Smith (2009), Ecosystem approach to fisheries and aquaculture: Implementing the FAO Code of Conduct for Responsible Fisheries, FAO Regional Office for Asia and the Pacific, Bangkok, Thailand, RAP Publication 2009/11 48 p [185] Strehlow, H V (2006), Integrated Natural Resources Management of Coastal Fisheries: The Case of Nha Phu Lagoon, Vietnam, Doctor Rerum Agriculturarum Thesis, der Humboldt-Universität zu Berlin, Berlin, 286 p [186] Strydom, N A and B D D'hotman (2005), "Estuary-dependence of larval fishes in a non-estuary associated South African surf zone: evidence for continuity of surf assemblages” Estuarine, Coastal and Shelf Science, 63 (1– 2): 101-108 [187] Susilo, E S., L Harnadi and A Takemura (2009), "Tropical monsoon environments and the reproductive cycle of the orange-spotted spinefoot Siganus guttatus” Marine Biology Research, (2): 179-185 [188] Tamura, K., G Stecher, D Peterson, A Filipski and S Kumar (2013), "MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0” Molecular Biology and Evolution, 30: 2725-2729 [189] Ter Braak, C J F and P Smilauer (2002), CANOCO Reference Manual and CanoDraw for Windows User’s Guide: Software for Canonical Community Ordination (version 4.5) Microcomputer Power, Ithaca, New York, 500 p [190] UNEP (2007), Procedure for Establishing a Regional System of Fisheries Refugia in the South China Sea and Gulf of Thailand in the context of the 138 UNEP/GEF project entitled: “Reversing Environmental Degradation Trends in the South China Sea and Gulf of Thailand” South China Sea Knowledge Document, 4: 15p [191] Visram, S., M C Yang, R M Pillay, S Said, O Henriksson, M Grahn and C A Chen (2010), "Genetic connectivity and historical demography of the blue barred parrotfish (Scarus ghobban) in the western Indian Ocean” Marine Biology, 157: 1475-1487 [192] Vo, S T., J C Pernetta and C J Paterson (2013), "Lessons learned in coastal habitat and land-based pollution management in the South China Sea” Ocean & Coastal Management, 85, Part B: 230-243 [193] Walters, J S., J Maragos, S Siar and A T White (1998), "Participatory coastal resource assessment: A handbook for community workers and coastal resource managers” Coastal Resource Management Project and Silliman University, Cebu City, Philippines, 113 p [194] Ward, R D and P M Grewe (1994), "Appraisal of molecular genetic techniques in fisheries” Review of Fish Biology and Fisheries, 4: 300-325 [195] Watson, R and D Pauly (2001), "Systematic distortions in world fisheries catch trends” Nature, 414 (6863): 534-536 [196] Woodland, D (2001), "Siganidae rabbitfishes (Spinefoots) Perciformes: Acanthuroidei, (Labridae to Latimeriidae), estuarine crocodiles, sea turtles, sea snakes and marine mammals” Food and Agriculture Organization of the United Nations, Bony fishes part (K.E Carpenter and V Niem eds.): 36273650 [197] Woodland, D J (1990), Revision of the fish family Siganidae with descriptions of two new species and comments on distribution and biology, Indo-Pacific Fishes, Vol.19, Bishop Museum, Honolulu, Hawaii, U.S.A., 136 p [198] Yasook, N (2008), "Assessing the Abundance of Demersal Fishery Resources in Southeast Asian Waters” Fish for the People, (2): 18-22 Tài liệu tiếng Pháp [199] Chevey, P (1932), Poissons des campagnes du “de Lanessan” (1925-1929), Ire Partie, l’Institut Océanographique, Saigon, 155 p 139 [200] Krempf, A (1926), "Rapport sur le fonctionnement du Service Océanographique des Pêches de L’Indochine pendant l’année 1924-1925” Note Service Océanographique des pêches de I'Indochiue station maritime de Cauda, Province de Nha trang, No pp 38-50 [201] Krempf, A (1926), "Rapport sur le fonctionnement du Service Océanographique des Pêches de L’Indochine pendant l’année 1925-1926” Note Service Océanographique des pêches de I'Indochiue station maritime de Cauda, Province de Nha trang, No pp 51-68 [202] Krempf, A (1927), "Rapport sur le fonctionnement du Service Océanographique des Pêches de L’Indochine pendant l’année 1926-1927” Note Service Océanographique des pêches de I'Indochiue station maritime de Cauda, Province de Nha trang, No pp 69-86 [203] Krempf, A (1928), "Rapport sur le fonctionnement du Service Océanographique des Pêches de L’Indochine pendant l’année 1927-1928” Note Service Océanographique des pêches de I'Indochiue station maritime de Cauda, Province de Nha trang, No 11 pp 1-32 [204] Krempf, A (1929), Rapport sur le fonctionnement du Service Océanographique des Pêches de l’Indochine pendant l’année 1928-1929, Note Service Océanographique des pêches de l'Indochiue station maritime de Cauda, No 13, Province de Nha trang, 1-42 p [205] Krempf, A (1930), Rapport sur le fonctionnement du Service Océanographique des Pêches de l’Indochine pendant l’année 1929-1930, Note Service Océanographique des pêches de l'Indochiue station maritime de Cauda, No 15, Province de Nha trang, 1-47 p [206] Pellegrin, L D J (1905), "Mission Permanente Franỗaise en Indo-Chine Poissons de la Baie D'along (Tonkin)” Bulletin de la Société Zoologique, Séance du Mai pp 82-88 Tài liệu tiếng Trung [207] 沈世杰, (1993), 台湾鱼类志 台北: 中国台湾国立台湾大学动物学系,960 片 Tài liệu Website 140 [208] Froese, R and D Pauly, (Eds.) (2016), FishBase World Wide Web electronic publication Available at: http:/fishbase.org/ (1/2016)