Đang tải... (xem toàn văn)
i ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ THÔNG TIN VÀ TRUYỀN THÔNG Ngô Thế Hoàng Nghiên cứu chuẩn HL7 V2 8 và xây dựng ứng dụng hỗ trợ thu thập thông tin phục vụ công tác Y tế dự phòng tỉnh Thái[.]
i ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ THƠNG TIN VÀ TRUYỀN THƠNG Ngơ Thế Hồng Nghiên cứu chuẩn HL7 V2.8 xây dựng ứng dụng hỗ trợ thu thập thông tin phục vụ công tác Y tế dự phòng tỉnh Thái Nguyên THÁI NGUYÊN, 2020 ii LỜI CAM ĐOAN Tên tơi là: Ngơ Thế Hồng Sinh ngày: 07/3/1983 Học viên lớp cao học CHK16A - Trường Đại học Công nghệ Thông tin & Truyền thông - Đại học Thái Nguyên Hiện công tác tại: Trung tâm Kiểm soát bệnh tật tỉnh Thái Nguyên Xin cam đoan: Đề tài “Nghiên cứu chuẩn HL7 V2.8 xây dựng ứng dụng hỗ trợ thu thập thông tin phục vụ cơng tác Y tế dự phịng tỉnh Thái Ngun” TS Nguyễn Hải Minh hướng dẫn cơng trình nghiên cứu riêng Tất tài liệu tham khảo có nguồn gốc, xuất xứ rõ ràng Tơi xin cam đoan tất nội dung luận văn nội dung đề cương thông tin trích dẫn luận văn ghi rõ nguồn gốc Nếu sai tơi hồn tồn chịu trách nhiệm trước hội đồng khoa học trước pháp luật Thái Nguyên, ngày tháng năm 2020 Tác giả luận văn Ngô Thế Hoàng iii LỜI CẢM ƠN Sau thời gian nghiên cứu làm việc nghiêm túc, động viên, giúp đỡ hướng dẫn tận tình Thầy giáo hướng dẫn TS Nguyễn Hải Minh, luận văn với Đề tài “Nghiên cứu chuẩn HL7 V2.8 xây dựng ứng dụng hỗ trợ thu thập thông tin phục vụ cơng tác Y tế dự phịng tỉnh Thái Ngun” Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến: Thầy giáo hướng dẫn TS Nguyễn Hải Minh tận tình dẫn, giúp đỡ tơi hồn thành luận văn Phịng đào tạo Sau đại học Trường Đại học Cơng nghệ Thông tin Truyền thông giúp đỡ trình học tập thực luận văn Trung tâm Kiểm soát bệnh tật tỉnh Thái Nguyên nơi công tác tạo điều kiện tối đa cho tơi thực khóa học Tơi xin chân thành cảm ơn bạn bè, đồng nghiệp gia đình động viên, khích lệ, tạo điều kiện giúp đỡ tơi suốt q trình học tập, thực hoàn thành luận văn Thái Nguyên, ngày tháng năm 2020 Tác giả luận văn Ngơ Thế Hồng iv MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN iii MỤC LỤC iv DANH MỤC HÌNH ẢNH vii DANH MỤC BẢNG BIỂU viii LỜI MỞ ĐÂU .1 CHƯƠNG TỔNG QUAN VỀ CHUẨN TIN HỌC Y TẾ .2 1.1 Giới thiệu chung 1.2 Chuẩn Logical Observation Identifiers Names and Codes (LOINC) 1.3 Chuẩn International Classification of Diseases, Tenth Revision (ICD 10) .6 1.4 Chuẩn Digital Imaging and Communications in Medicine (DICOM) 1.5 Chuẩn Clinical Document Architecture (CDA) 12 CHƯƠNG CHUẨN HL7 V2.8 15 2.1 Khái niệm .15 2.2 Môi trường truyền thông 15 2.3 Khung tin 16 2.3.1 Các tin 16 2.3.2 Phân đoạn nhóm phân đoạn liệu .16 2.3.3 Các trường liệu 16 2.4 Quy tắc xây dựng tin .21 2.4.1 Mã giả dành cho việc xây dựng tin 21 2.4.2 Quy tắc cho hệ thống tiếp nhận 24 2.5 Các quy tắc xử lý tin .24 2.5.1 Khởi tạo tin .25 2.5.2 Bản tin phản hồi sử dụng quy tắc xử lý 26 2.6 Các giao thức HL7 .28 2.6.1 Giao thức số thứ tự 28 2.6.2 Phân đoạn liệu tin nối tiếp 30 v 2.6.3 Giao thức khối/nhóm HL7 32 2.6.4 Giao thức cho việc diễn giải phân đoạn nhóm phân đoạn lặp lại tin cập nhật .35 2.6.5 Giao thức để xử lý trường liệu lặp lại tin cập nhật 36 2.7 Các tin điều khiển 37 2.7.1 Phản hồi thông thường 37 2.7.2 Phản hồi thông thường, trả lỗi 38 2.7.3 Bản tin sử dụng số thứ tự: Giao thức 38 2.7.4 Bản tin phân mảnh 38 2.7.5 Bản tin phản hồi sử dụng phương thức xử lý 41 2.7.6 Bản tin phản hồi sử dụng phương thức phản hồi nâng cao 41 CHƯƠNG XÂY DỰNG MƠ HÌNH THU THẬP THƠNG TIN Y HỌC HỖ TRỢ CƠNG TÁC Y TẾ DỰ PHỊNG TỈNH THÁI NGUN 43 3.1 Chức năng, nhiệm vụ trung tâm kiểm sốt bệnh tật tình Thái Nguyên 43 3.2 Quy trình yêu cầu trao đổi, cung cấp thông tin từ sở khám chữa bệnh cho Trung tâm kiểm soát bệnh tật 45 3.3 Quy trình trao đổi thơng tin hệ thống 45 3.4 Quy trình gửi nhận thông tin HSBA thông qua hệ thống quản lý tin HL7 48 3.5 Quy trình phân quyền truy cập, xem thông tin HSBA hệ thống HL7 ENGINE bệnh viện .52 3.6 Quy trình gửi thơng tin HSBA đến bệnh viện HIS 54 3.7 Quy trình gửi liệu phục vụ báo cáo thống kê 55 3.8 Giao tiếp HL7 Engine Bệnh viện HL7 Engine Trung tâm kiểm soát bệnh tật Tỉnh 56 3.8.1 Chuẩn thông điệp HL7 v2.8 56 3.8.2 Quy trình trao đổi thông tin hệ thống HL7 ENGINE .65 3.9 Thuật tốn đóng gói tin HL7 từ phía người gửi 69 3.9.1 Sơ đồ giải thuật đóng gói tin HL7 .Error! Bookmark not defined 3.9.2 Cài đặt Module sinh tin HL7 69 vi 3.9.3 Thuật tốn trích rút thơng tin từ tin HL7 phía người nhận 71 3.10 Giao thức trao đổi thông tin người gửi người nhận 72 TÀI LIỆU THAM KHẢO 76 NHẬN XÉT CỦA GIÁO VIÊN HƯỚNG DẪN 77 vii DANH MỤC HÌNH ẢNH Hình 1.1: Cách quản lý thư mục chuẩn LOINC Hình 1.2: Tổ chức thư mục theo chuẩn LOINC Hình 1.3: Cấu trúc ảnh DICOM 11 Hình 2.1: Biểu đồ quy tắc truyền tin 22 Hình 2.2: Biểu đồ quy tắc truyền trường liệu xuất .23 Hính 3.1 Sơ đồ trao đổi thông tin TTKSBT với Bệnh viện 45 Hình 3.2: Quy trình thu thập thơng tin tạo lập tin HL7 từ hệ thống HIS 46 Hình 3.3 Quy trình gửi nhận thơng tin HSBA thông qua hệ thống quản lý tin HL7 50 Hình 3.4 Quy trình xác thực thơng tin hệ thống 53 Hình 3.5: Quy trình gửi thơng tin HSBA từ HL7 Engine Bệnh viện đến HIS 54 Hình 3.6 Sơ đồ gửi/ nhận thông tin từ TTKSBT Bệnh viện 55 Hình 3.7: Quy trình gửi nhận HSBA qua giao thức HL7 v2.8 65 Hình 3.8: Quy trình trao đổi liệu danh mục 67 Hình 3.9: Giải thuật đống gỏi tin HL7 Error! Bookmark not defined Hình 3.10: Giải thuật chèn thành phần giá trị lặp tin HL7 Error! Bookmark not defined viii DANH MỤC BẢNG BIỂU Bảng 1: So sánh mã chẩn đoán Bảng 3.1: Các segment thông tin thông điệp HL7 56 Bảng 3.2: Các trường thông tin MSH 58 Bảng 3.4: Các trường thông tin đợt điều trị bệnh viện (PV1) 60 Bảng 3.5: Các trường thông tin TXA Error! Bookmark not defined Bảng 3.6: Các trường thông tin OBX Error! Bookmark not defined Bảng 3.7: Các trường thông tin MSA .64 Bảng 3.8: Các trường thông tin ERR 64 Bảng 3.9: Các trường thông tin VTQ Error! Bookmark not defined Bảng 3.10: Các trường thông tin QAK Error! Bookmark not defined Bảng 3.11: Các trường thông tin RDF Error! Bookmark not defined Bảng 3.12: Các trường thông tin RDT Error! Bookmark not defined Bảng 3.13: Cấu trúc thông tin thông điệp truy vấn trả lời .67 Bảng 3.14: Các loại tài liệu trao đổi qua hệ thống HL7 ENGINE 68 LỜI MỞ ĐÂU Công nghệ thông tin (CNTT) dần chứng tỏ tầm ảnh hưởng lớn đến mặt đời sống xã hội cách mạng Công nghiệp 4.0 diễn mạnh mẽ nhiều quốc gia Đối với ngành y tế, thấy CNTT ngày đóng vai trị quan trọng, khơng cho q trình cải cách hành cơng tác quản lý, điều hành mà cịn đỡ đầu cho việc triển khai ứng dụng kỹ thuật cao, hỗ trợ chẩn đốn, điều trị cơng tác xây dựng kế hoạch, công tác tác thống kê dự phịng… Xuất phát từ tình hình thực tiễn, lần thực luận văn em lựa chọn định hướng nghiên cứu chuẩn HL7 2.8 - phiên tổ chức chuẩn tin học Y tế giới; Từ đề xuất xây dựng thử nghiệm mơ hình thu thập liệu trực tuyến từ trung tâm y tế tỉnh Trung tâm Kiểm sốt bệnh tật nhằm có thơng tin đủ, xác, kịp thời để làm tốt nhiệm vụ chun mơn cơng tác Y tế dự phịng tỉnh 2 CHƯƠNG TỔNG QUAN VỀ CHUẨN TIN HỌC Y TẾ 1.1 Giới thiệu chung Trên giới, vấn đề chuẩn hóa thơng tin, chuẩn hóa giao thức trao đổi thơng tin chuẩn hóa danh mục danh mục chẩn đoán bệnh, danh mục xét nghiệm, thủ thuật XQ trao y tế đặt từ lâu Với mục tiêu kiện tồn hệ thống Cơng nghệ Thơng tin (CNTT) hỗ trợ cơng tác chăm sóc sức khỏe nhằm mang lại lợi ích thiết thực cho người bệnh Với tốc độ phát triển nhanh ngành CNTT, ứng dụng CNTT y tế có thay đổi chất Những ứng dụng hỗ trợ bệnh viện sở khám chữa bệnh tháo gỡ khó khăn việc trao đổi liệu, như: Hệ thống Thông tin trao đổi thông tin nội bộ, trao đổi liệu với hệ thống thơng tin nước ngồi Ngun nhân khó khăn việc khơng thống áp dụng danh mục tham chiếu, liệu không thống nhất, đồng thời chưa thực có giao thức chung trao đổi liệu thông tin y tế Tại Việt Nam, với nhận thức sâu sắc vấn đề kiện toàn hệ thống công nghệ thông tin y tế, nâng cao chất lượng chăm sóc sức khỏe người dân, Bộ Y tế có nỗ lực việc đưa định hướng, hướng dẫn, định nhằm nâng cao chất lượng chăm sóc sức khỏe người dân thông qua việc ban hành văn bản, định có tính chất định hướng cụ thể Trong phần sau đây, chúng tơi phân tích tập trung vào hai mảng: danh mục chuẩn hóa chuẩn cơng nghệ thơng tin áp dụng việc trao đổi thông tin y tế Các danh mục chuẩn hóa đề cập đến như: địa bàn hành chính, bệnh viện, nơi khám, chữa bệnh ban đầu, phẫu thuật - thủ thuật,… từ điển liệu trợ giúp đắc lực cho việc trao đổi thông tin thông qua việc áp dụng chuẩn truyền thông lĩnh vực y tế 1.2 Chuẩn Logical Observation Identifiers Names and Codes (LOINC) Chuẩn LOINC tạo định danh phổ quát dựa cho chuẩn ASTM E1238, HL7, CEN TC251, tin báo cáo giám sát chuẩn DICOM, chuẩn danh mục mã hóa thơng tin quản lý phịng xét nghiệm, hay hệ thống lưu trữ thông tin bệnh nhân… Theo cách tiếp cận xây dựng ứng dụng, định danh quy định bới chuẩn LOINC sử dụng với vai trò giá trị danh mục cho trường “Observation Identifier” tin ORU HL7, phân đoạn OBX sử dụng trường tương ứng chuẩn HL7 Khi sử dụng chuẩn LOINC tin HL7, việc nhận biết mã thơng qua hệ thống mã ký hiệu bắt đầu “LN” Để thuận tiện cho trình trao đổi liệu, định danh yêu cầu tên đầy đủ tạo chuẩn tắc cho người sử dụng quản lý xét nghiệm, thủ thuật mà đồng thời có mối liên kết ngữ nghĩa với tên chuẩn CSDL LOINC hồ sơ tổng quát, chuẩn hóa tên phần lớn xét nghiệm chuẩn mã số sử dụng hoạt động phịng thí nghiệm Do vậy, thuật ngữ sử dụng hoạt động phịng thí nghiệm ánh xạ sang tên định danh chứa CSDL LOINC Đối với trường hợp hệ thống quản lý cần liệu giá trị tham chiếu mà khơng có CSDL LOINC, người sử dụng gán cho chúng giá trị mã, tên LOINC Tuy nhiên cần ý, nên tạo giá trị mã, tên LOINC tuân theo nguyên tắc: dòng tương ứng với phương pháp đo nghiệm riêng Danh mục mã dùng phịng thí nghiệm LOINC cập nhật thường xuyên dự án LOINC CSDL LOINC, cập nhật chứa hầu hết thuật ngữ cập nhật đến thời điểm Về bản, LOINC bao gồm thuật ngữ chia thành lĩnh vực: Các thuật ngữ dùng phịng thí nghiệm (Laboratory Categories) Các thuật ngữ dùng lâm sàng (Clinical Categories) Các Claims Attachments theo HIPAA chứa thông tin bổ trợ cho hoạt động khám, chữa bệnh Trong lĩnh vực, LOINC lại tổ chức thành nhiều chun mơn nhỏ hình sau Hình 1.1: Cách quản lý thư mục chuẩn LOINC Ngoài ra, LOINC tổ chức theo phận chun mơn phịng thí nghiệm đến tận mức chun mơn sâu sau: Hình 1.2: Tổ chức thư mục theo chuẩn LOINC Mặc dù vậy, LOINC khơng bao gồm thuộc tính sau đây: + Phương tiện xét nghiệm + Chi tiết mẫu, nơi thu thập + Độ ưu tiên hay thứ tự thực xét nghiệm + Người kiểm tra kết + Kích thước mẫu + Địa điểm xét nghiệm Lợi ích áp dụng thống danh mục mã dùng phịng thí nghiệm LOINC Có thể nhận thấy, đối tượng sử dụng danh mục mã dùng phịng thí nghiệm LOINC phịng thí nghiệm đơn vị cung cấp dịch vụ khám chữa bệnh Các bệnh viện sở khám, chữa bệnh lưu trữ danh sách mã dùng phịng thí nghiệm LOINC phục vụ cho việc quản lý phòng xét nghiệm trao đổi liệu kết với phận, đơn vị khác Nếu áp dụng LOINC với HL7, việc trao đổi liệu yêu cầu, kết xét nghiệm mở rộng khơng phận nội đơn vị mà cịn mở rộng phạm vi trao đổi với bệnh viện, sở khám, chữa bệnh khác sử dụng LOINC với HL7 Các quy tắc cập nhật danh mục mã dùng phịng thí nghiệm LOINC Hiện nay, việc cập nhật danh sách mã dùng phịng thí nghiệm LOINC LOINC PROJECT, dựa cập nhật từ phòng xét nghiệm đơn vị khám, chữa bệnh cung cấp Như vậy, thấy rằng, nguồn liệu danh mục mã dùng phịng thí nghiệm LOINC xuất phát từ LOINC PROJECT Để áp dụng danh mục mã dùng phịng thí nghiệm LOINC cho ngành y tế, Bộ Y tế phối hợp với LOINC PROJECT việc cung cấp liệu thơng qua hình thức hợp tác thông tin cử cán theo dõi cập nhật LOINC PROJECT thường xuyên Để cập nhật thay đổi cho LOINC, Regenstrief Institute đơn vị tiếp nhận đóng góp việc bổ sung, cập nhật cho danh mục LOINC Để làm rõ nội dung cập nhật vào CSDL LOINC, Regenstrief Institute đưa trường hợp gửi cập nhật: + Trường hợp (a) loại xét nghiệm hoàn toàn mới, chẳng hạn như, DNA sequencing (b) sử dụng mã LOINC theo cách khác với qui định + Bổ sung biến thể xét nghiệm mà CDSL LOINC có 1.3 Chuẩn International Classification of Diseases, Tenth Revision (ICD 10) ICD-10 (Danh mục mã bệnh) Đại hội đồng Y tế Thế giới thông qua lần thứ 43 vào tháng 5/1990 thức Tổ chức y tế giới (WHO) ban hành năm 1994 Các quốc gia khác bắt đầu thông qua mã ICD-10 vào năm 1994, Mỹ thông qua phần mã ICD-10 vào năm 1999 cho mặt bệnh báo cáo tử vong ICD-10 danh mục chẩn đoán phân loại quốc tế tiêu chuẩn cho tất bệnh học nói chung mặt bệnh lâm sàng nói riêng ICD-10 sử dụng để phân loại bệnh vấn đề sức khỏe lưu lại nhiều loại hồ sơ sức khỏe hồ sơ bệnh án thông thường, hồ sơ bệnh án điện tử, phiếu khám bệnh hay giấy chứng tử Phiên Bản thứ Mười (ICD-10) chứa liệu lớn nhiều bệnh chi tiết ICD-9 nước phát triển sử dụng toàn giới Dưới bảo trợ WHO, phiên ICD-10 hỗ trợ thúc đẩy việc thu thập, phân loại, xử lý, báo cáo thống kê số liệu tình hình bệnh tật tử vong nước giới Các lần sửa đổi ICD triển khai định kỳ để việc phân loại bệnh phản ánh rõ nét tiến khoa học y tế Bảng 1.1: So sánh mã chẩn đoán ĐẶC ĐIỂM ICD-9-CM ICD-10-CM Chiều dài mảng 3-5 ký tự 3-7 ký tự Số mã có sẵn Xấp xỉ 13.000 mã Xấp xỉ 68.000 mã Cấu tạo mã (dạng số Số = chữ an pha hay Số = chữ an pha hay chữ an pha) dạng số Số = dạng số Số 2-5 = Dạng số Số 3-7 = chữ an pha hay dạng số Khơng gian có sẵn cho Hạn chế Linh động mã Chi tiết tổng thể Chưa cụ thể Rất chi tiết (Cho phép miêu tả tích hợp vào trạng thái bệnh tật, biểu mã bệnh, bệnh học/nguyên nhân gây bệnh, biến chứng bệnh, chi tiết vị trí phẫu thuật, di chứng, mức độ suy yếu chức năng, tác nhân sinh hoá học, giai đoạn/thời kỳ, liên quan đến hạch bạch huyết, thuận bên định vị, quy trình hay cấy ghép có liên quan, số tuổi có liên quan, hay liên quan đến khớp xương) Sự thuận bên Không xác định bên Thường xác định bên phải đối phải đối lập với bên với bên trái trái Mã mẫu2 813.15, chỗ gẫy xương S52123C, chỗ gãy xương mở đầu xương thay đầu xương quay quay không xác định, ban đầu gặp phải với chỗ gãy xương mở loại IIIA, IIIB hay IIIC Tình hình áp dụng chuẩn ICD Việt Nam Phân loại bệnh tật lần thứ 10 (ICD-10) Tổ chức Y tế Thế giới WHO ban hành từ năm 1994 Bộ Y tế Việt Nam thức quy định việc thống kê bệnh tật bệnh viện làm quen với Bảng phân loại với ký tự: Chương bệnh, nhóm bệnh bệnh Tài liệu ICD-10 Bộ Y tế xuất năm 2000 với tham gia biên dịch, hiệu chỉnh nhiều giáo sư, bác sĩ thuộc nhiều chuyên khoa khác nhau, bước đầu giúp cho bệnh viện có Bảng phân loại bệnh tật tiếng Việt tiếng Anh phục vụ công tác khám chữa bệnh, nghiên cứu khoa học hòa nhập với phân loại bệnh tật giới Với Bảng phân loại quốc tế bệnh tật Việt – Anh lần thứ 10 Bộ Y tế ban hành đến tài liệu sử dụng thực tế mang tính ứng dụng cao ngành Y tế Việt Nam Lợi ích áp dụng chuẩn mã bệnh ICD 10 Ứng dụng chuẩn ICD, đặc biệt với phiên 10 phiên tương lai, hỗ trợ đắc lực cho công tác quản lý, điều hành, nghiên cứu khoa học chia sẻ thông tin, phục vụ đối tượng hoạt động khám chữa bệnh (cơ sở y tế, người bệnh, quản lý nhà nước…) Các lợi ích việc phân loại chi tiết bệnh theo mã bệnh: Một là, xử lý xác thống vấn đề thống kê tình hình phát triển bệnh tật số liệu nghiên cứu phục vụ cho cơng tác phịng chữa bệnh; Hai là, Căn vào việc định danh xác mặt bệnh, sở pháp lý sở khoa học để xây dựng phác đồ điều trị, sở y tế dễ dàng việc định cung cấp dịch vụ khám chữa bệnh tương ứng với mã bệnh tật; Ba là: Việc quy chuẩn chi tiết hóa định danh bệnh tật cịn giúp cho việc quản lý chi phí khám chữa bệnh, đặc biệt với tổ chức phụ trách việc chi trả bảo hiểm y tế, toán khoản chi phí khám chữa bệnh; Bốn là: Với nước phát triển, việc áp dụng chuẩn hóa mặt bệnh tật giới, giúp gia tăng hội hội nhập cộng đồng khoa học y tế giới, tiếp thu phát triển ứng dụng công nghệ y tế 1.4 Chuẩn Digital Imaging and Communications in Medicine (DICOM) DICOM hệ thống tiêu chuẩn ứng dụng rộng rãi y tế DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) hệ thống tiêu chuẩn công nghiệp phát triển nhằm đáp ứng nhu cầu của nhà sản xuất người sử dụng việc kết nối, lưu trữ, trao đổi, in ấn ảnh y tế mà không phụ thuộc vào nhà sản xuất Chuẩn DICOM làm cho thiết bị đòi hỏi quy chuẩn tương tác dễ dàng Cụ thể: - Gửi ngữ nghĩa lệnh liệu kết hợp Đối với thiết bị tương tác, phải có chuẩn thiết bị cần tương tác với lệnh kết hợp liệu, không thông tin mà cịn truyền thiết bị - Gửi ngữ nghĩa dịch vụ tập tin, định dạng ảnh thư mục thông tin cần thiết cho thông tin liên lạc độc lập 10 - Rõ ràng việc định nghĩa yêu cầu quy chuẩn hình thức thực thi (implementions) chuẩn Cụ thể, phát biểu quy chuẩn (Conformance Statement) phải rõ thông tin đầy đủ để xác định hàm tương tác mong đợi với thiết bị khác có địi hỏi quy chuẩn (conformance) - Hoạt động dễ dàng môi trường mạng - Có cấu trúc để cung cấp giới thiệu dịch vụ mới, dễ dàng việc hỗ trợ ứng dụng máy y khoa tương lai Định dạng ảnh DICOM Định dạng ảnh DICOM quy định mục 10 Hiện DICOM định dạng ảnh dùng phổ biến y tế Một file ảnh DICOM ngồi liệu hình ảnh, cịn chứa thơng tin khác thơng tin bệnh nhân, loại máy tạo ảnh… Đó khác biệt định dạng ảnh DICOM so với định dạng ảnh khác Một file theo định dạng DICOM thường có phần mở rộng dcm - Phần tiêu đề (header) Phần tiêu đề chứa tồn thơng tin bệnh nhân, thiết bị tạo ảnh thông tin quy định mã hóa liệu: Phương pháp mã hóa, giải mã thông tin liên quan Cấu trúc tiêu đề sau: Đầu tiên 128 byte File Preamble (offset), chương trình đọc file DICOM bỏ qua nội dung chứa 128 byte Tiếp theo byte chứa chuỗi ‘DICM’ Tiếp theo thông tin file (File Meta Elements) Các thơng tin tổ chức thành nhóm, nhóm lại gồm nhiều phần tử: 11 Hình 1.3: Cấu trúc ảnh DICOM - Dữ liệu ảnh (Data Set) Phần chứa thơng tin hình ảnh Các yếu tố DICOM yêu cầu phụ thuộc vào loại hình ảnh, liệt kê phần tiêu chuẩn DICOM Ví dụ, phương thức hình ảnh "MR (xem nhóm: yếu tố 0008:0060), cần phải có yếu tố để mơ tả thời gian MRI echo Sự vắng mặt thơng tin hình ảnh hành vi vi phạm tiêu chuẩn DICOM Trong thực tế, hầu hết phần mềm đọc định dạng DICOM (bao gồm MRIcro ezDICOM) không kiểm tra diện hầu hết yếu tố này, giải nén có thơng tin tiêu đề mơ tả kích thước hình ảnh Các tiêu chuẩn trước NEMA cho DICOM, có cấu trúc tương tự với nhiều yếu tố tương tự Sự khác biệt định dạng NEMA khơng có liệu 128-byte bù đắp đệm ký tự DICM Ngoài ra, NEMA khơng xác định rõ ràng muilti-frame (3D) hình ảnh, yếu tố 0028,0008 khơng có mặt Đặc biệt quan trọng nhóm: yếu tố 0002:0010 Điều xác định "Xác định cú pháp chuyển giao Giá trị thể cấu trúc liệu 12 hình ảnh, tiết lộ cho dù liệu nén Lưu ý số phần mềm xem ảnh DICOM view liệu khơng nén ngun Hình ảnh DICOM nén hai chương trình nén liệu phổ biến JPEG (nơi mà số thông tin tần số cao bị mất) chương trình khơng giảm chất lượng JPEG nhìn thấy bên ngồi hình ảnh y tế (Huffman lossless JPEG hiệu thuật toán JPEG-LS) Các mã mô tả phần tiêu chuẩn DICOM Lưu ý báo cáo kỹ thuật nén (nếu có), UID Cú pháp chuyển giao báo cáo thứ tự byte liệu thơ Các máy tính khác lưu trữ giá trị số nguyên khác nhau, gọi 'về cuối lớn' 'ít cuối' Hãy xem xét số nguyên 16-bit với giá trị 257 byte quan trọng lưu trữ giá trị 01 (= 255), byte quan trọng lưu trữ với giá trị 02 Một số máy tính lưu giá trị 01:02, người khác lưu trữ 02:01 Do đó, cho liệu với 8-bit cho mẫu, phần mềm xem DICOM cần trao đổi byte thứ tự liệu để phù hợp với trật tự sử dụng máy tính bạn 1.5 Chuẩn Clinical Document Architecture (CDA) Chuẩn tài liệu lâm sàng - HL7 Clinical Document Architecture (CDA) chuẩn tài liệu có cấu trúc Thơng qua chuẩn tài liệu này, rõ cho quan quản lý, sở y tế, nhà thiết kế phần mềm, phần cứng tính cấu trúc "Stucture" tính ngữ nghĩa "Semantic" tài liệu lâm sàng Với mục đích hỗ trợ việc trao đổi thơng tin sở y tế, tổ chức quan liên quan thuận tiện xác môi trường truyền thông đa dạng phong phú Mục đích thiết kế chuẩn tài liệu CDA Mục đích: o Đưa quy định việc trao đổi thơng tin chăm sóc sức khỏe o Mang lại hiệu việc triển khai hệ thống mang tính liên thơng, có trao đổi chia sẻ thông tin hệ thống khác phạm vi lớn o Việc mở hiển thị nội dung tài liệu CDA không bị giới hạn khác công nghệ phần mềm sử dụng nơi gửi nơi nhận ... đoan: Đề tài ? ?Nghiên cứu chuẩn HL7 V2. 8 x? ?y dựng ứng dụng hỗ trợ thu thập thông tin phục vụ cơng tác Y tế dự phịng tỉnh Thái Nguyên? ?? TS Nguyễn Hải Minh hướng dẫn công trình nghiên cứu riêng tơi... ? ?Nghiên cứu chuẩn HL7 V2. 8 x? ?y dựng ứng dụng hỗ trợ thu thập thông tin phục vụ cơng tác Y tế dự phịng tỉnh Thái Ngun” Tơi xin b? ?y tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến: Th? ?y giáo hướng dẫn TS Nguyễn Hải Minh... CHƯƠNG X? ?Y DỰNG MƠ HÌNH THU THẬP THƠNG TIN Y HỌC HỖ TRỢ CƠNG TÁC Y TẾ DỰ PHỊNG TỈNH THÁI NGUYÊN 43 3.1 Chức năng, nhiệm vụ trung tâm kiểm soát bệnh tật tình Thái Nguyên 43 3.2 Quy trình y? ?u