Báo cáo khoa học: Structural basis for stereo-speciﬁc catalysis in NAD+-dependent (R )-2-hydroxyglutarate dehydrogenase from Acidaminococcus fermentans pptx

Báo cáo khoa học: Structural basis for the erythro-stereospeciﬁcity of the L-arginine oxygenase VioC in viomycin biosynthesis docx

... substratespeciﬁcity for its native substrate l-arginine, but alsotolerates l-homoarginine and l-canavanine (Fig. 3A,Table 1). These ﬁndings can be explained by the coor-dination of l-arginine in the active ... methylene group in the side chain ofl-arginine, as exempliﬁed by the binding and catalyticturnover of l-homoarginine. Concerning l-canavanineturnover by VioC, the modiﬁed guanidinium group islikely ... substrate. For example, in AsnO, a trans con-former is selected for the v1torsion angle of boundl-asparagine, whereas in VioC, a gauche(–) rotamer isobserved for l-arginine (Table 4). Owing to...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Structural basis for cyclodextrin recognition by Thermoactinomyces vulgaris cyclo⁄maltodextrin-binding protein ppt

... maltodextrin-binding protein (TvuCMBP) complexed with c-cyclodextrin has been deter-mined. Like Escherichia coli maltodextrin-binding protein (EcoMBP) andother bacterial sugar-binding proteins, TvuCMBP ... [8,9]. The malto-dextrin-binding protein from E. coli (EcoMBP) is alsowidely used as a tool for genetic engineering [10] andas a biosensing platform [11,12]. The ATP-binding cas-sette transporters ... critical in determining thespeciﬁcity of TvuCMBP for c-cyclodextrin.AbbreviationsCD, cyclodextrin; EcoMBP, Escherichia coli maltodextrin-binding protein; Mol, molecule; SeMet, selenomethionine;...

Báo cáo khoa học: Structural basis for recognition of Co2+ by RNA aptamers pot

... spectrum. Therefore, in order to gain a glo-bal insight into metal ion–RNA interactions, it is oftennecessary to conduct structural studies of metal ionbinding modes in RNA molecules using biophysicalmethods ... andG38 in aptamer no. 18, as well as G25 and G26 orG39 and G40 in aptamer no. 20, in Co2+binding.Interestingly, a similar metal ion binding mode tothe tandem guanines has been observed in the ... sitesremain available for interactions with RNA ligands,including the N7 atom of purines. Therefore, there isthe possible involvement of the N7 atom of the neigh-boring tandem guanines, G27...

Báo cáo khoa học: Structural basis for substrate recognition by Erwinia chrysanthemi GH30 glucuronoxylanase potx

... [42].Molecular modelingDocking experiments and binding energy calculations wereperformed with leadfinder [23]. This program was alsoused for the preparation of the protein structure for dock-ing by addition ... claim to original Slovakian government works 2107interesting that the side chain conformations of aminoacids interacting with MeGlcA2Xyl3did not change asa result of binding. The superposition ... by dashed lines.Stacking interactions are also highlighted as dashed lines connecting the centers of interacting groups marked by asterisks. The distancesare in A˚. (A) Stacking interactions...

Báo cáo khoa học: Structural basis for the recognition of complex-type biantennary oligosaccharides by Pterocarpus angolensis lectin ppt

... are summarized in Table 3. As is usually observed for protein:carbohy-drate interactions, the binding constants are in the mil-limolar range.Binding of mannose in the primary binding site isenthalpy-driven. ... obtain the binding constant Kbandbinding enthalpy DHb from the measured heat release Qion each injection using the Wiseman isotherm [46]. Freeenergy and entropy of binding are calculated from ... however, using a binding mode that is distinct from the one observed in the NA2F complex. In thisbinding mode, a total surface of 615 A˚2is shiel-ded from the solvent, compared to 565 A˚2for...

Báo cáo khoa học: Structural basis for stereo-speciﬁc catalysis in NAD+-dependent (R )-2-hydroxyglutarate dehydrogenase from Acidaminococcus fermentans pptx

... Martins et al. NAD+-dependent (R) -2-hydroxyglutarate dehydrogenase FEBS Journal 272 (2005) 269–281 ª 2004 FEBS 281 Structural basis for stereo-speciﬁc catalysis in NAD+-dependent (R )-2-hydroxyglutarate ... nucleotide-binding domain displays a well-preserved foldindicating its evolutionary structural conservation (asexpected from its role in coenzyme binding). The sameprotein overall fold (structural ... coenzyme binding results in the interdomain cleftclosure [11]. Helix aA is the major component of thedimer interface (helix aA in HGDH; Fig. 2A), explain-ing the structural rigidity observed for...

Báo cáo khoa học: Structural basis for the interaction between dynein light chain 1 and the glutamate channel homolog GRINL1A docx

... not impair the interaction, indi-cating that the glutamine residue is not absolutelyrequired for binding and is most likely involved in increasing binding afﬁnity. G426 of GRINL1A occu-pies ... staining andimmunogold labelling [26].A non-consensus sequence within GRINL1A isresponsible for DYNLL1 binding in the canonicalmode In this study, we have identiﬁed GRINL1A as a novelinteracting ... maintained by G424 (G232 in nNOS) with K36and the Y65 ring. The intrinsic ﬂexibility of the glycineresidue may facilitate subtle structural rearrangementsthat enhance binding, compensating for...

Báo cáo khoa học: Structural basis for the changed substrate speciﬁcity of Drosophila melanogaster deoxyribonucleoside kinase mutant N64D docx

... weretransformed into KY895 and then the strains were examined for growth, +, in the presence of different concentrations of thymidine in the medium. In the last column, LD100values are given (in ... deoxyribonucleosides; dT, deoxythymidine; dU, deoxyuridine; dC,deoxycytidine; dA, deoxyadenosine; dG, deoxyguanosine; hTK1, human thymidine kinase 1; HSV1-TK, Herpes simplex virus 1 thymidinekinase; LID region, ... cellu-lar kinases the triphosphorylated nucleoside analogsare incorporated into DNA and cause chain termin-ation and cell death [2]. Alternatively, they inhibit theDNA synthesizing machinery or initiate...

Báo cáo khoa học: Structural basis for poor uracil excision from hairpin DNA An NMR study pptx

... kcalÆmol)1ÆA˚)2 for all nOes involving nonexchangeable protons,10 kcalÆmol)1ÆA˚)2 for all nOes involving exchangeableprotons and the atoms involved in H-bonds. For thedihedral angle restraints a force ... reference.Starting structure and structural restraintsThe starting structures for both U1- and U3-hairpins weregenerated u sing the molecular mod elling p ackageINSIGHT-II(MSI) on an Iris (Indigo ... [4], for both of the hairpins, these J-values qualita-tively indicate that the corresponding sugar rings adoptconformation in the S domain of the pseudo-rotational m apwith P ranging from...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Structural bases for recognition of Anp32⁄LANP proteins doc

... conservedN-terminal domain containing leucine-rich repeats(LRRs), motifs known to mediate protein–protein inter-actions, and of a C-terminal low-complexity region,mainly composed of polyglutamates.Since ... N-termi-nus (1–164 amino acids) was cloned into the pGBKT7 vec-tor (Clontech, Mountain View, CA, USA) for expression asa Gal4 DNA-binding domain fusion protein. This bait wastransformed into an AH 109 ... LRR domain. Interactions with the INHATcomplex, mapped to the ﬂexible C-terminus, mayinduce structuring and stiffening of this region.Modeling the interaction of Anp32a with otherproteins on...

Xem thêm

Từ khóa: báo cáo khoa học mẫu báo cáo khoa học y học báo cáo khoa học sinh học báo cáo khoa học nông nghiệp báo cáo khoa học lâm nghiệp báo cáo khoa học thủy sản Nghiên cứu sự biến đổi một số cytokin ở bệnh nhân xơ cứng bì hệ thống chuyên đề điện xoay chiều theo dạng Nghiên cứu tổ chức pha chế, đánh giá chất lượng thuốc tiêm truyền trong điều kiện dã ngoại Nghiên cứu tổ chức chạy tàu hàng cố định theo thời gian trên đường sắt việt nam Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit Trả hồ sơ điều tra bổ sung đối với các tội xâm phạm sở hữu có tính chất chiếm đoạt theo pháp luật Tố tụng hình sự Việt Nam từ thực tiễn thành phố Hồ Chí Minh (Luận văn thạc sĩ)Phát triển du lịch bền vững trên cơ sở bảo vệ môi trường tự nhiên vịnh hạ long Nghiên cứu, xây dựng phần mềm smartscan và ứng dụng trong bảo vệ mạng máy tính chuyên dùng Nghiên cứu khả năng đo năng lượng điện bằng hệ thu thập dữ liệu 16 kênh DEWE 5000 Thơ nôm tứ tuyệt trào phúng hồ xuân hương Sở hữu ruộng đất và kinh tế nông nghiệp châu ôn (lạng sơn) nửa đầu thế kỷ XIX chuong 1 tong quan quan tri rui ro Giáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vật Giáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vật Giáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vật Chiến lược marketing tại ngân hàng Agribank chi nhánh Sài Gòn từ 2013-2015 Đổi mới quản lý tài chính trong hoạt động khoa học xã hội trường hợp viện hàn lâm khoa học xã hội việt nam TÁI CHẾ NHỰA VÀ QUẢN LÝ CHẤT THẢI Ở HOA KỲ