Qua số liệu đã phân tích về doanh thu và chi phí ở trên, mặc dù doanh thu tăng qua các năm nhưng chi phí cũng tăng đã làm cho lợi nhuận giảm qua các năm.
Trong năm 2006 lợi nhuận Ngân hàng đạt một con số đáng khích lệ là 11.323 triệu đồng là do để cạnh tranh với các Ngân hàng khác trên địa bàn Ngân hàng đã mở thêm phòng giao dịch ở các xã cho những khách hàng ở xa, tiếp tục đưa ra những phương án cho vay phù hợp cho các thành phần kinh tế, chú trọng cho vay doanh nghiệp vừa và nhỏ, mạnh mẽ đầu tư cho vay hộ sản xuất, kinh doanh dịch vụ góp phần mang lại lợi nhuận cho Ngân hàng. Lợi nhuận năm 2007 đạt 8.905 triệu đồng giảm so với 2006 là 2.418 triệu đồng với tốc độ giảm cao 21,35%. Nguyên nhân dẫn đến sự sụt giảm này là do Ngân hàng đã gặp một số trở ngại như: giá cả hàng tiêu dùng, vật tư nông nghiệp, vật liệu xây dựng, xăng dầu tăng vọt, giá cả hàng nông sản không ổn định, giá trị tiêu thụ hàng nông sản sản xuất ra còn bấp bên gây khó khăn cho nhà sản xuất, dịch bệnh, thiên tai đã
ảnh hưởng lớn đến phát triển kinh tế Huyện nhà…Những tác động trên buộc Ngân hàng phải chi ngân quỹ để khắc phục khó khăn.Ngoài ra do các tổ chức tín dụng khác xâm nhập thị trường nông thôn ngày càng nhiều, sự cạnh tranh ngày càng gay gắt cũng ảnh hưởng lớn đến hoạt động kinh doanh của Ngân h àng. Điều này làm cho lợi nhuận của Ngân hàng năm 2007 giảm so với năm 2006.
Đến năm 2008, lợi nhuận bị âm 1.298 triệu đồng, nguyên nhân là do tốc độ tăng của doanh thu thấp hơn tốc độ tăng của chi phí. Có nhiều nguyên nhân làm cho chi phí tăng cao trong năm 2008. Cụ thể: Do trong năm 2008 ngân hàng tách phòng giao dịch Cầu Đôi ra thành chi nhánh Khu công nghiệp Hòa Phú, đây là chi nhánh trực thuộc Tỉnh nên tăng mọi chi phí về cơ sở hạ tầng, nhân viên, chi cho công cụ dụng cụ… Mua sắm công cụ dụng cụ tăng do việc mua sắm bàn và máy vi tính để thực hiện chương trình chuyển đổi IPCAS nhằm phục vụ cho việc giao dịch với khách hàng được nhanh chóng, thuận lợi. Một nguyên nhân nữa là do năm 2008 nền kinh tế xảy ra lạm phát nên Ngân hàng huy động vốn với đầu vào lãi suất điều chỉnh tăng, điều đó dẫn đến các khoản phải trả tăng theo (trong khi đó vay Ngân hàng khác thì lãi suất huy động thấp). Điều này dẫn đến khoản chi dự phòng bù đắp trong hoạt động kinh doanh tăng. Nguyên nhân cuối cùng là do nợ xử lý rủi ro trích lập 4 tỷ, cuối năm còn tồn đọng 1,2 tỷ. Lãi dự chi chưa chi được đưa qua thu nhập làm cho thu nhập giảm. Trong khi đó, thu không đủ bù đắp khoản dự thu kỳ trước, dự chi đưa qua các khoản dự thu thì chênh lệch 1,2 tỷ đồng. Tất cả các nguyên nhân này làm thu nhập năm 2008 giảm.
Tuy rằng lợi nhuận năm 2008 giảm xuống nhưng nếu so với tình hình thực tế năm 2008 thì hoạt động kinh doanh của Ngân hàng cũng có hiệu quả. Để đạt được kết quả này cùng với việc chú trọng quản trị chi phí, trong thời gian qua toàn Chi nhánh đẩy mạnh công tác nghiên cứu thị trường, mở rộng đối tượng khách hàng, thực hiện những chương trình quảng cáo tiếp thị nhằm duy trì và thu hút khách hàng. Trong 3 năm qua, chi nhánh đã không ngừng củng cố, mở rộng và nâng cao chất lượng phục vụ. Bên cạnh đó, nhờ hiện đại hóa công nghệ ngân hàng, tăng tốc độ xử lý công việc, tự động hóa nhiều khâu nghiệp vụ nên tiết kiệm được chi phí lao động và tiết kiệm được nhiều chi phí khác làm cho thu nhập từ các hoạt động tín dụng, phi tín dụng đều tăng lên.
Qua phân tích cho thấy kết quả hoạt động kinh doanh của NHNo & PTNT Huyện Long Hồ là tương đối tốt, doanh thu luôn tăng qua các năm. Đó là nhờ vào nỗ lực của Ban Giám Đốc và toàn thể cán bộ công nhân viên Ngân hàng đã thực hiện tốt mọi chủ trương, chính sách của Đảng cũng như sự chỉ đạo của Ngân hàng cấp trên; cùng với sự hỗ trợ của chính quyền địa phương các cấp, đã quan tâm giúp đỡ xem công tác tín dụng là biện pháp hàng đầu trong chính sách khuyến nông của Huyện. Tuy nhiên, để nâng cao khả năng cạnh tranh và hoạt động ngày càng hiệu quả, Ngân hàng cần mở rộng thêm các dịch vụ tiện ích, cung cấp ngày càng nhiều sản phẩm dịch vụ đáp ứng nhu cầu ngày càng đa dạng của khách hàng, tăng dần tỷ trọng thu từ dịch vụ và kinh doanh ngoại hối trong cơ cấu doanh thu.