Như ta đã biết hoạt động kinh doanh của doanh nghiệp chịu ảnh hưởng của rất nhiều nhân tố, các chỉ tiêu kinh tế chịu tác động của nhiều yếu tố. Nếu như chỉ phân tích bằng phương pháp so sánh thì ta khơng thể thấy được các nhân tố ảnh hưởng đến kết quả kinh doanh của doanh nghiệp. Để khắc phục hạn chế của phương pháp so sánh trong phân tích kinh tế người ta đã sử dụng phương pháp thay thế liên hồn hay cịn gọi là phương pháp loại trừ. Thay thế liên hoàn là phương pháp xác định mức độ và tính chất ảnh hưởng của các nhân tố đến kết quả kinh doanh bằng cách loại trừ ảnh hưởng của các nhân tố.
Phương pháp thay thế liên hoàn được sử dụng để nghiên cứu các chỉ tiêu kinh tế tổng hợp chịu ảnh hưởng bởi rất nhiều nhân tố nhưng giữa các nhân tố có mối liên hệ với nhau được phản ánh qua các cơng thức tốn học mang tính chất hàm số. Ví dụ doanh thu bán hàng chịu ảnh hưởng của khối lượng tiêu thụ, giá cả hàng bán mà 2 nhân tố này liên hệ với nhau bởi phép nhân, năng suất lao động chịu tác động của doanh thu và số lao động và hai nhân tố này liên hệ với nhau bằng phép chia,… Các nhân tố ảnh hưởng có thể là ảnh hưởng càng nhiều thì số điều chỉnh càng lớn, tính tốn càng nhiều lần việc phân tích càng cụ thể càng chính xác hơn.
Phương pháp thay thế liên hồn là thay thế lần lượt số liệu gốc bằng số liệu muốn so sánh của các nhân tố ảnh hưởng tới một chỉ tiêu kinh tế được phân tích theo một lơgic nhất định. Khi thay thế một nhân tố phải giả định các nhân tố khác cố định.
Phương pháp này ra đời nhằm khắc phục những hạn chế của phương pháp so sánh. Tuy nhiên phương pháp cũng không tránh được những hạn chế của nó, đó là phạm vi áp dụng hẹp, điều kiện áp dụng nghiêm ngặt, trình tự tính tốn phức tạp. Vì thế để hạn chế những khuyết điểm của phương pháp thì trong phân tích nên kết hợp với các phương pháp khác.
Lợi nhuận là chỉ tiêu có rất nhiều nhân tố ảnh hưởng bằng phương pháp so sánh ta mới chỉ thấy được tình hình chung mà chưa thấy được sự ảnh hưởng của các nhân tố đến lợi nhuận như thế nào. Phương pháp thay thế liên hồn sẽ giúp chúng ta phân tích được sự ảnh hưởng của các nhân tố đến lợi nhuận cả về mức độ và sự chi phối của chúng.