Cục hải quan Hải Phòng chịu trách nhiệm quản lý về hải quan hoạt động xuất nhập khẩu, xuất nhập cảnh của cảng biển lớn nhất Miền Bắc: Cảng Hải Phòng. Hiện nay, Cục hải quan Hải Phòng gồm hai đơn vị: Hải quan Cảng Hải Phòng khu vực 1 va øHải quan Cảng Hải Phòng khu vực 2.
Với lợi thế gần với Cục công nghệ thông tin và thống kê hải quan thuộc Tổng cục hải quan, Cục hải quan Hải Phịng đã phối hợp với Cục cơng nghệ thông tin và thống kê hải quan nghiên cứu và xây dựng các chương trình ứng dụng tin học quản lý nghiệp vụ hải quan. Một trong những chương trình đã qua giai đoạn thử nghiệm và đưa vào sử dụng chính thức là chương trình quản lý và theo dõi nợ thuế.
Những năm trước đây, Hải quan Pháp và Tổ chức hải quan thế giới WCO đã tài trợ xây dựng hệ thống ASYCUDA, là một hệ thống thu thập và quản lý thông tin nghiệp vụ hải quan dựa trên máy vi tính. Cục hải quan Hải Phịng đã được chọn làm một trong các đơn vị thử nghiệm. Tuy nhiên, cho đến nay dự án này khơng thực hiện nữa vì chưa đáp ứng được các yêu cầu nghiệp vụ cụ thể.
Hệ thống công nghệ thơng tin của Cục hải quan Hải Phịng cịn non trẻ, các cán bộ chuyên về tin học còn thiếu. Trong thời gian tới, Cục hải quan Hải Phòng sẽ tập trung vào phát triển đội ngũ cán bộ tin học, tiến hành xây dựng hệ thống đượng trục cáp quang nối các cảng. Song song với việc xây dựng hệ thống đường trục cáp quang, Cục hải quan Hải Phòng cũng xây dựng hệ thống quản lý mạng nhằm tiến tới trao đổi số liệu trực tuyến. Quá trình này cũng đặt trọng tâm vào yếu tố bảo mật và an toàn dữ liệu.