Việc định giá cĩ vai trị đặc biệt quan trọng trong thành cơng của một thương vụ, mức giá đưa ra phải được chấp nhận bởi hai bên. Cĩ rất nhiều phương pháp định giá và mỗi phương pháp cho một kết quả khác nhau, cĩ khi cách biệt khá lớn. Nếu việc định giá đối với các chỉ tiêu tài chính tương đối dễ dàng thì việc định giá các tài sản vơ hình phức tạp hơn nhiều. Tài sản vơ hình là giá trị thương hiệu, văn hĩa doanh nghiệp, nhân sự, tầm nhìn, chiến lược, thị phần, trình độ quản lý, vị trí địa lý, mạng lưới hoạt động, khách hàng, các mối quan hệ, cần đánh giá những thuận lợi và rủi ro của những nhân tố này sau khi sáp nhập. Trong một số trường hợp, các yếu tố phi tài chính lại là yếu tố tác động làm tăng hoặc giảm giá trị của một vụ M&A, đặc biệt trong ngành ngân hàng. Các bên cần thuê các chuyên gia trong việc tư vấn và định giá trong giao dịch
Đối với ngân hàng mục tiêu: cần phải biết thế mạnh và cả thế yếu của mình; người mua là ai, họ đang cần gì, mong đợi gì. Thơng thường bên mua mong đạt được giá trị gia tăng sau khi mua, nghĩa là sau khi mua tổng giá trị gia tăng sẽ cao hơn giá trị của từng ngân hàng cộng lại. Nếu bên mua nhận thấy tiềm năng họ sẵn sàng trả cao hơn giá thị trường. Việc chọn thời điểm bán cũng cĩ ý nghĩa quan trọng.
Đối với ngân hàng thu mua: cần tìm hiểu kỹ hoạt động của bên bán vì cĩ thể cĩ những thơng tin chưa được phản ánh
Các phương pháp cĩ thể sử dụng trong định giá doanh nghiệp (hữu hình) là phương pháp chiết khấu dịng tiền, phương pháp định giá theo thị giá