Về khai thỏc, Trước năm 1992, Nhật Bản là nước khai thỏc thuỷ sản
lớn nhất thế giới, nhưng từ 1993, do sản lượng cỏ trớch Nhật Bản, là loài chiếm tỷ trọng lớn nhất, bị giảm mạnh cựng với sự suy giảm nguồn lợi của nhiều loài khỏc dẫn đến sản lượng khai thỏc của Nhật Bản đó bị giảm đỏng kể trong những năm tiếp theo. Trong khi đú, nghề khai thỏc của Trung Quốc ngày càng phỏt triển và đưa nước này trở thành cường quốc khai thỏc thuỷ sản hàng đầu thế giới đẩy Nhật Bản xuống vị trớ thứ hai cú thời kỳ xuống vị trớ thứ tư. Sản lượng thuỷ sản khai thỏc của Nhật Bản bị giảm liờn tục, từ mức 10,3 triệu tấn năm 1989 cũn 7,59 triệu tấn năm 1992; 5,9 triệu tấn năm 1995 và 5,18 triệu tấn năm 1998.
Trước năm 1992, sản lượng khai thỏc cỏ trớch hàng năm từ 3 đến 4 triệu tấn, nhưng những năm gần đõy, nguồn lợi này đó bị cạn kiệt nhanh chúng chỉ cũn 1,7 triệu tấn năm 1993, 660.000 tấn năm 1995 và 167.000 tấn năm 1998.
Hiện nay, đối tượng thuỷ sản cú tỷ trọng khai thỏc lớn nhất của Nhật Bản là họ cỏ thu với sản lượng trung bỡnh là 950.000 tấn mỗi năm. Cỏ thu khai thỏc của Nhật Bản rất nhiều loại khỏc nhau nhưng tập trung chủ yếu là cỏ thu nhật và cỏ sũng.
Sản lượng cỏ thu Nhật Bản trung bỡnh trờn 600.00 tấn mỗi năm, năm 1997 sản lượng cỏ này tăng cao đạt 850.000 tấn nhưng sau đú lại bị giảm sỳt. Sản lượng cỏ sũng khỏ ổn định khoảng trờn 300.000 tấn. Cỏ thu núi chung là sản phẩm khỏ được ưa chuộng trờn thị trường Nhật Bản.
Đối tượng cú sản lượng lớn thứ hai và được quan tõm nhất trong ngành khai thỏc của Nhật Bản là cỏ ngừ, bao gồm cỏ ngừ võy xanh, cỏ ngừ võy vàng, cỏ ngừ mắt to, cỏ ngừ vằn. Sản lượng cỏ ngừ trung bỡnh đạt khoảng 680.000 tấn/năm, trong đú cỏ ngừ vằn là loài cú sản lượng lớn nhất (chiếm 50% sản lượng cỏ ngừ) tiếp theo là cỏ ngừ mắt to (16%), cỏ ngừ võy dài (10%) và một số loài cỏ ngừ khỏc. Cỏ ngừ võy xanh chỉ chiếm một phần nhỏ trong sản
lượng của Nhật Bản nhưng là loài cú giỏ trị kinh tế cao nhất và được ưa chuộng nhất trờn thị trường Nhật Bản.
Nhuyễn thể chõn đầu bao gồm mực nang, mực ống và bạch tuộc cũng là một trong những mặt hàng thuỷ sản tiờu thụ mạnh của người dõn Nhật Bản, sản lượng khai thỏc loại thuỷ sản này đứng thứ ba đạt gần 540.000 tấn/năm.
Cỏ tuyết là loại đúng vai trũ quan trọng trong sản lượng khai thỏc của Nhật Bản nhưng nguồn lợi này lại đang bị đe doạ, năm 1993 sản lượng loại này đạt 4450.000 tấn đến năm 1998 chỉ cũn 373.000 tấn. Sản lượng khai thỏc cỏ hồi hàng năm của Nhật Bản đạt khoảng 280.000 tấn bao gồm nhiều loại cỏ hồi khỏc nhau và cú giỏ trị trờn thị trường thế giới.
Về nuụi trồng , Cụng nghiệp nuụi trồng thuỷ sản của Nhật Bản đó phỏt
triển từ lõu, hiện nay sản lượng nuụi trồng thuỷ sản của Nhật Bản đứng thứ ba trờn thế giới, (sau Trung Quốc và ấn Độ). Tuy nhiờn, do Nhật Bản chủ yếu tập trung vào nuụi trồng hải sản với những loài cú giỏ trị cao nờn mặc dự sản lượng thuỷ sản nuụi trồng chỉ bằng 1/3 sản lượng nuụi của ấn Độ nhưng về giỏ trị gấp cao 1,4 lần. Trong suốt thập kỷ qua, sản lượng thuỷ sản nuụi của Nhật Bản tương đối ổn định ở mức trờn dưới 800.000 tấn/năm.
Đối tượng nuụi nhiều nhất là nhuyễn thể hai mảnh vỏ, chiếm tới 50% lượng thuỷ sản nuụi trồng với hai loại chớnh là hầu và điệp. Sản lượng hầu nuụi của Nhật Bản đó bị giảm dần trong nhiều năm, từ 250.000 tấn năm 1990 cũn 200.000 tấn năm 1998. Ngược lại sản lượng điệp lại tăng từ 180.000 tấn năm 1990 lờn 265.000 tấn năm 1996, trong hai năm tiếp theo lại bị giảm xuống cũn 226.000 tấn năm 1998.
Loài cỏ được nuụi nhiều nhất và cũng là loài cú sản lượng lớn nhất của Nhật Bản là cỏ cam, với sản lượng ổn định khoảng 150.000 tấn/năm. Tiếp theo là cỏ trỏp với sản lượng từ 50.000 tấn năm 1990 lờn 825.000 tấn năm
1998. Một số sản lượng cú lượng nuụi tương đối khỏ khỏc là cỏ chỡnh, cỏ hồi, cỏ chộp, cỏ thơm,....