CHƢƠNG II : VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
2.2. Phƣơng pháp nghiên cứu
2.2.2.3. Tách chiết thrombin ở các ngưỡng nhiệt độ khác nhau
* Tách chiết thrombin ở các ngưỡng nhiệt độ khác nhau
Mẫu phổi thu thập được được rửa sạch với nước cất rồi sau đó rửa lại với nước muối NaCl 0,05M; bảo quản mẫu ở -20C.
Mẫu phổi được giã đông , 10 g mẫu bổ sung với 10 ml NaCl 0,05M, xay nhuyễn, ngâm mẫu 24h trong điều kiện 4C. Mẫu được ly tâm 4000 rpm, 20 phút, thu dịch. Dịch được tủa với ethanol tuyệt đối để đạt nồng độ cuối cùng là 10%, để -20C trong 15 phút. Mẫu sau đó được ly tâm
4000 rpm trong 5 phút, thu dịch, tiếp tục bổ sung ethanol tuyệt đối để đạt nồng độ cuối cùng là 20% ở điều kiện 4C, 37C, 45C và 60C trong 10 phút, ly tâm 4000 rpm trong 20 phút, thu tủa . Tủa được hòa tan trong NaCl 0,05M. Lặp lại thí nghiệm tủa với ethanol tuyệt đối để đạt nồng độ cuối cùng là 20% ở các điều kiện nhiệt độ n hư trên. Dịch thu được bổ sung CaCl2 0,6M đạt nồng độ 30 mM.
* Đánh giá khả năng chuyển hóa fibrinogen của thrombin
Dịch thrombin sau khi tách từ mẫu được khảo sát hoạt tính có trong mẫu với phản ứng 20 l fibrinogen trong 200 l NaCl 0,9%; sau đó bổ sung 50 l thrombin; với mẫu đối chứng không sử dụng thrombin . Quan sát thời gian chuyển hóa fibrinogen thành fibrin.
* Sắc ký trao đổi ion DEAE-cellulose
Dƣ̣a trên cơ sở của phản ƣ́ng trao đổi anion giƣ̃a protein trong hỗn hợp và các nhóm trao đổi ion (dimethylaminoethyl tích điê ̣n dƣơng ) của chất giá , khi hỗn hợp protein qua cô ̣t , các protein tích điện âm gắn vào cột và sau đó đƣợc đẩy khỏi cô ̣t bằng dung di ̣ch muối có chƣ́a ion có ái l ực mạnh hơn đối với nhóm trao đổi ion của chất giá.
* Sắc ký lọc gel Biogel P100
Là cột phân tách hỗn hợp protein theo nguyên tắc lọc gel . Biogel P100 là mô ̣t polyacrylamide trong đó phân tƣ̉ của chúng liên kết với nhau bởi các liên kết ngang ta ̣o thành sàng phân tƣ̉ bởi hê ̣ thống lỗ lƣới xốp . Dƣ̣a vào sƣ̣ khác nhau về kích thƣớc và phân tƣ̉ lƣợng của các protein có trong hỗn hợp để phân tách.
Cột có kích thƣớc 2,6 x 60 cm đƣợc cân bằng với đệm 20 mM phosphate pH 6,8. Điều kiện sắc ký: Tốc độ dòng chảy 25 ml/giờ, thể tích mỗi phân đoạn 1,5 ml.
* Điện di SDS-PAGE
Khối lƣợng phân tử tƣơng đối của protein tinh sạch và độ sạch của các dịch protein đƣợc đánh giá bằng điện di trên gel polyacrylamide.
* Xác định hàm lƣợng protein
Hàm lƣợng protein đƣợc xác định theo Bradford.