Kết quả điều tra và phân loại thảm thực vật rừng ta ̣i khu vực Vườn Quốc gia Pù Mát như sau:
- Kiểu rừng kín thường xanh mưa ẩm nhiệt đới: Kiểu rừng này phân bố
ở độ cao dưới 700 m và phân bố trên tất cả các xã trong Vườn quốc gia. Rừng có thành phần loài gồm các ưu hợp của họ Cỏ (Poaceae), Họ Cúc
(Asteraceae), Họ Cà phê (Rubiaceae) và họ Đậu (Fabaceae).
- Kiểu rừng kín thường xanh hỗn giao cây lá rộng, lá kim mưa ẩm á
nhiệt đới: Phân bố ở độ cao trên 700 m thuộc các đỉnh núi cao mà đặc biệt tập
trung ở đỉnh Pù Mát. Kiểu rừng này có thành phần thực vật với các họ Dẻ
(Fagaceae), họ Dâu tằm (Moraceae), họ Nguyệt Quế (Lauraceae) và họ Mộc
Lan. Đặc biệt cây lá kim thực vật hạt trần tham gia trong tổ thành có các loài: Pơ mu (Fokienia hodginsii), Sa mộc dầu (Cunninghamia konishii),...
- Kiểu phụ thứ sinh phục hồi sau khai thác và nương rẫy:
+ Kiểu phụ thứ sinh hỗn giao gỗ và nứa trên đất nguyên trạng: Kiểu này có diện tích không lớn nhưng phân bố rải rác trên toàn bộ Vườn quốc gia Pù Mát.
+ Kiểu phụ thứ sinh nứa: Kiểu phụ này phân bố ven hệ thống suối vì đất ở đó ẩm và còn tốt.
Là thảm thực vật thoái hóa do canh tác nương rẫy và khai thác quá mức hình thành nên; Phân bố ở độ cao dưới 900m trở xuống. Tổ thành loài ưu thế là Thành ngạnh (Cratoxylon polyanthum. C prunilirium), Thẩu tấu (Aporosa
sphaerosperum, A. serata), Me rừng (Phyllanthus emblica), thảm cỏ chiếm phần
lớn diện tích đất trống trọc, phân bố rộng trên độ cao từ 1000 m trở xuống. Tổ thành loài cây ưu thế là Lau (Saccharum spontaneum), Chít (Thysanolaena
maxima), Chè vè (Miscanthus japonica), Cỏ tranh (Imperata cylimdrica).
- Hệ động vật rừng
Thành phần loài: Kết quả khảo sát của các nhà khoa học trong và ngoài nước đã thống kê được 1.121 loài động vật thuộc các nhóm thú, chim, bò sát, lưỡng cư, cá, ... Con số thống kê này đã chứng tỏ Vườn quốc gia Pù Mát là nơi có tính đa dạng sinh học cao.
Điều đặc biệt quan trọng đối với khu hệ động vật Vườn quốc gia Pù Mát là tính đa dạng các yếu tố đặc hữu cao. Trong số đó có những loài đặc trưng như Chào Vao (Sus bucculenus), Sao la (Pseudoryx nghetinhensis), Mang lớn (Megamuntiacus vuquangensis), Mang Trường Sơn (Muntiacus truongsonensis), Chà vá chân nâu (Pygatherix nemaeus), Vượn má vàng (Hylobates leucogenys), Voọc xám (Trachypithecus phayrei), Thỏ vằn (Nesolagus temminsii), Cầy vằn (Chrotogale owstoni), Trĩ sao (Rheinardia ocellate), Khướu mỏ dài (Jaboulleia danjoui). Như vậy về lĩnh vực bảo tồn loài, Pù Mát chẳng những là một khu tầm cỡ quốc gia mà còn có giá trị cho cả Lào và Đông Dương.
Bảng 3.2: Danh mục động vật ở VQG Pù Mát Lớp Số bộ Số họ Số loài Thú 11 30 132 Chim 14 49 361 Bò sát 2 15 53 Lưỡng cư 2 6 33 Cá 5 19 83 Bướm ngày 1 11 365 Bướm đêm 1 2 94 Cộng 36 132 1121 (Nguồn: Số liệu tổng hợp VQG Pù Mát)