Sở Lao động TB&XH thành lập tổ chuyên môn để thẩm tra quyết toán hàng năm của các đơn vị trực thuộc, do đó công tác QLTC ngày càng được chấn chỉnh và đạt được những kết quả nhất định, đồng thời cũng hướng dẫn kịp thời các chế độ chính sách, cách hạch toán quyết toán nhằm khắc phục những sai sót trong QLTC cho các đơn vị trực thuộc. Tuy vậy, trong thời gian qua Sở Lao động TB&XH chưa
tổ chức thường xuyên công tác thẩm tra quyết toán hàng quý tại các đơn vị trực thuộc, việc thẩm tra quyết toán chỉ dừng lại ở mức độ góp ý, sửa chữa, chưa xây dựng chế tài để quy định trách nhiệm và xử phạt vi phạm trong lĩnh vực QLTC nên tính chấp hành của các đơn vị chưa cao.
Đội ngũ cán bộ tham gia công tác thẩm tra quyết toán chưa được đào tạo chuyên sâu từng lĩnh vực mà chủ yếu là bằng kinh nghiệm công tác. Có phân công công việc cụ thể cho từng thành viên nhưng việc thẩm tra quyết toán cũng gặp khó khăn và hiệu quả chưa cao.
Công tác tự kiểm tra tài chính là công cụ quan trọng nhằm đảm bảo cho công tác tài chính được đi vào nề nếp, ngăn ngừa những sai phạm, gian lận trong QLTC, qua đó thực hiện theo đúng các quy định của Nhà nước.
Trong những năm qua, Sở Lao động TB&XH đã thực hiện tốt công tác kiểm tra tài chính, đã mời các tổ chức, cá nhân có trình độ chuyên môn về tài chính, phối hợp với đại diện công đoàn và thanh tra nhân dân của đơn vị thực hiện công tác tự kiểm tra tài chính nhằm kiểm tra việc thực hiện tài chính của các đơn vị theo đúng dự toán, đúng chế độ, định mức, đúng mục đích được quy định trong quy chế chi tiêu nội bộ của đơn vị và theo đúng quy định tại Quyết định số 67/2004/QĐ-BTC ngày 13/08/2004 của Bộ Tài chính.
Tuy vậy, các đơn vị trực thuộc chủ yếu mời cán bộ tại đơn vị tham gia công tác kiểm tra, đại diện công đoàn và thanh tra nhân dân của đơn vị chưa được đào tạo nghiệp vụ tài chính, thời gian tự kiểm tra ngắn, nên nội dung kiểm tra còn đơn giản, sơ sài. Do vậy, công tác tự kiểm tra tài chính chưa thực sự hiệu quả, còn mang nặng tính hình thức.