7. KẾT CẤU CỦA ĐỀ TÀI
1.2.3.1. Nhận diện một số rủi ro có liên quan đến việc hoàn thuế GTGT đố
trực thuộc Trung ương khác với tỉnh, thành phố nơi đóng trụ sở chính, đang trong giai đoạn đầu tư chưa đi vào hoạt động, chưa đăng ký kinh doanh, chưa đăng ký thuế thì cơ sở kinh doanh lập hồ sơ khai thuế riêng cho dự án đầu tư đồng thời phải kết chuyển thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư để bù trừ với việc kê khai thuế GTGT của hoạt động sản xuất kinh doanh đang thực hiện. Sau khi bù trừ nếu số thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư mới chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế GTGT cho dự án đầu tư.
Tại Điểm c, Khoản 3, Điều 1 Thông tư số 130/2016/TT-BTC ngày 12/8/2016 của Bộ Tài chính quy định cơ sở kinh doanh không được hoàn thuế giá trị gia tăng mà được kết chuyển số thuế chưa được khấu trừ của dự án đầu tư theo pháp luật về đầu tư sang kỳ tiếp theo đối với các trường hợp:
- Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh không góp đủ số vốn điều lệ như đã đăng ký theo quy định của pháp luật.
- Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện khi chưa đủ các điều kiện kinh doanh theo quy định của Luật đầu tư quy định hoặc chưa có văn bản của cơ quan nhà nước có thẩm quyền cho phép đầu tư kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện.
- Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện không bảo đảm duy trì đủ điều kiện kinh doanh trong quá trình hoạt động quy định.
- Dự án đầu tư khai thác tài nguyên, khoáng sản được cấp phép từ ngày 01 tháng 7 năm 2016 hoặc dự án đầu tư sản xuất sản phẩm hàng hóa mà tổng trị giá tài nguyên, khoáng sản cộng với chi phí năng lượng chiếm từ 51% giá thành sản phẩm trở lên theo dự án đầu tư
1.2.3. Một số rủi ro có liên quan đến việc hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư
1.2.3.1. Nhận diện một số rủi ro có liên quan đến việc hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu dự án đầu
Những năm qua, một bộ phận doanh nghiệp lợi dụng sự thông thoáng của chính sách hoàn thuế GTGT của Nhà nước để trục lợi, gây thất thu NSNN. Nên việc
nhận diện các rủi ro liên quan đến hoàn thuế GTGT nói chung và hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư nói riêng, qua đó đề ra biện pháp phòng chống hiệu quả là hết sức quan trọng. Do đó, tác giả đưa ra một số nhận diện rủi ro có liên quan đến việc hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư như sau:
- Thứ nhất: rủi ro đối với vốn điều lệ đăng ký của doanh nghiệp.
Theo quy định của Luật thuế GTGT hiện hành, đối với doanh nghiệp lần đầu đề nghị hoàn thuế GTGT theo Dự án đầu tư, Cơ quan Thuế căn cứ Giấy chứng nhận đầu tư hoặc Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh của doanh nghiệp tại thời điểm kiểm tra để xác định vốn điều lệ đã đăng ký lần đầu hoặc tăng, giảm vốn điều lệ qua các lần điều chỉnh.
Quy đinh trên còn tiềm ẩn nhiều rủi ro đối với trường hợp doanh nghiệp đã được hoàn thuế GTGT lần đầu, sau đó điều chỉnh tăng vốn điều lệ và đề nghị hoàn thuế GTGT từ lần thứ 2 trở đi. Rủi ro đó là, nếu Cơ quan Thuế không kiểm tra việc doanh nghiệp có điều chỉnh tăng vốn điều lệ hay không? để yêu cầu doanh nghiệp chứng minh đã góp đủ vốn điều lệ, dẫn đến rủi ro trong công tác hoàn thuế.
- Thứ hai: Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện hoặc không bảo đảm duy trì đủ điều kiện kinh doanh trong quá trình hoạt động.
Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh thuộc một số ngành nghề có điều kiện kinh doanh như kinh doanh xăng dầu, kinh doanh khoáng sản, ….quy định tại Phụ lục 4, Danh mục Ngành, Nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện, ban hành kèm theo Luật số 03/2016/QH14 ngày 22/11/2016 của Quốc Hội: sửa đổi, bổ sung Điều 6 và Phụ lục 4 về danh mục, ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện khi chưa được cấp có thẩm quyền cấp Giấy chứng nhận đủ điều kiện kinh doanh hoặc không bảo đảm duy trì đủ điều kiện kinh doanh trong quá trình hoạt động thì không được hoàn thuế theo quy định.
- Thứ ba: Giấy chứng nhận đầu tư hoặc Quyết định phê duyệt Chủ trương đầu tư. Theo quy định của Luật đầu tư có một số trường hợp phải cấp Giấy chứng nhận đầu tư như dự án đầu tư của nhà đầu tư nước ngoài hoặc trường hợp không
cần Giấy chứng nhận đầu tư thì phải có Quyết định phê duyệt Chủ trương đầu tư mới đủ điều kiện hoàn thuế.
- Thứ tư: quy định về Dự án đầu tư đã đi vào hoạt động không được hoàn thuế GTGT.
Theo quy định tại Khoản 3, Điều 1 Luật số 106/QH13 sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thuế GTGT, Luật Thuế TTĐB và Luật Quản lý thuế (sửa đổi, bổ sung Khoản 1 và Khoản 2 Điều 13 Luật Thuế GTGT): “1. Cơ sở kinh doanh nộp thuế giá trị gia tăng theo phương pháp khấu trừ thuế nếu có số thuế giá trị gia tăng đầu vào chưa được khấu trừ hết trong tháng hoặc trong quý thì được khấu trừ vào kỳ tiếp theo.
Trường hợp cơ sở kinh doanh đã đăng ký nộp thuế giá trị gia tăng theo phương pháp khấu trừ có dự án đầu tư mới, đang trong giai đoạn đầu tư có số thuế giá trị gia tăng của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho đầu tư mà chưa được khấu trừ và có số thuế còn lại từ ba trăm triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế giá trị gia tăng."[2]
Tại Khoản 3, Điều 1 Thông tư số 130/2016/TT-BTC ngày 12/8/2016 của Bộ Tài chính (sửa đổi Điều 18 Thông tư số 219/2013/TT-BTC), quy định về việc hoàn thuế GTGT đối với cơ sở kinh doanh mới thành lập từ dự án đầu từ là: "2. Cơ sở kinh doanh mới thành lập từ dự án đầu tư đã đăng ký kinh doanh, đăng ký nộp thuế giá trị gia tăng theo phương pháp khấu trừ, hoặc dự án tìm kiếm thăm dò và phát triển mỏ dầu khí đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động, nếu thời gian đầu tư từ 01 năm trở lên thì được hoàn thuế giá trị gia tăng của hàng hóa, dịch vụ sử dụng cho đầu tư theo từng năm, trừ trường hợp hướng dẫn tại điểm c Khoản 3 Điều này. Trường hợp, nếu số thuế giá trị gia tăng lũy kế của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho đầu tư từ 300 triệu đồng trở lên thì được hoàn thuế giá trị gia tăng."[4].
Theo quy định trên thì chỉ quy định dự án đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động thì được hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư nếu đáp ứng các điều kiện, chưa có quy định dự án đã phát sinh doanh thu là không được hoàn thuế. Một số dự án có phân thành nhiều giai đoạn, khi hoàn thành giai đoạn 1 thì số thuế
GTGT còn được khấu trừ của giai đoạn 1 không được hoàn thuế. Đơn vị tiếp tục đầu tư giai đoạn 2 có số thuế GTGT đầu vào còn được khấu trừ khi đơn vị đề nghị hoàn thì khó xác định số thuế GTGT còn được khấu trừ của giai đoạn 2 có bao gồm số thuế GTGT được khấu trừ của giai đoạn 1.
Bên cạnh đó, Thông tư số 130/2016/TT-BTC quy định chưa rõ đối với “Dự án chưa đi vào hoạt động”, “Dự án chạy thử” dễ dẫn đến người nộp thuế lợi dụng “Dự án chạy thử” để hoàn thuế GTGT.
- Thứ năm: Dự án đầu tư sản xuất sản phẩm hàng hóa mà tổng trị giá tài nguyên, khoáng sản cộng với chi phí năng lượng chiếm từ 51% giá thành sản phẩm trở lên theo dự án đầu tư.
Đối với trường hợp doanh nghiệp có dự án đầu tư sản xuất sản phẩm từ tài nguyên, khoáng sản (có nguồn gốc trong nước) đã chế biến thành sản phẩm khác thì phải xác định tổng trị giá tài nguyên, khoáng sản cộng với chi phí năng lượng chiếm từ 51% giá thành sản phẩm trở xuống thì được hoàn theo quy định tại Khoản 3.3 Điều 1 Thông tư số 130/2016/TT-BTC ngày 12/8/2016 của Bộ Tài chính. Ngược lại, nếu tổng trị giá tài nguyên, khoáng sản cộng với chi phí năng lượng chiếm từ 51% giá thành sản phẩm trở lên thì không thuộc trường hợp hoàn. Việc xác định tỷ lệ chưa được rõ ràng và sự thống nhất tại các văn bản dẫn đến nhiều rủi ro trong trường hợp này.
- Thứ sáu: Trường hợp cơ sở kinh doanh đang hoạt động có dự án đầu tư cùng tỉnh, thành phố.
Một số nội dung quy định giữa Luật, Nghị định, Thông tư còn chưa thống nhất. Chẳng hạn, Luật số 106/2016/QH13, Nghị định số 100/2016/NĐ-CP chỉ quy định 2 trường hợp hoàn thuế GTGT song Thông tư số 130/2016/TT-BTC lại quy định 3 trường hợp hoàn thuế đối với dự án đầu tư, trong đó thêm trường hợp là cơ sở kinh doanh đang hoạt động có dự án đầu tư cùng tỉnh, thành phố đang hoạt động, mà không phân biệt dự án đầu tư mới hay dự án đầu tư mở rộng.
Đối với trường hợp hoàn thuế này, Kiểm toán Nhà nước có ý kiến đề nghị Tổng cục Thuế báo cáo cấp có thẩm quyền đối với trường hợp này. Tổng cục Thuế
đang tổng hợp trình Bộ Tài chính báo cáo cấp có thẩm quyền nội dung trên. Sau khi có ý kiến chỉ đạo của cấp có thẩm quyền, Tổng cục Thuế sẽ thông báo để Cục Thuế biết và thực hiện. Tại Cục Thuế tỉnh Bình Định đang thực hiện dừng không giải quyết hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế đối với trường hợp nêu trên.