Cập nhật chẩn đoán PCR về viêm phổi do virus

Chẩn đoán PCR và phương pháp PCR biến thể

Nhìn chung, các phương pháp dựa trên PCR có độ nhạy cao hơn từ hai đến năm lần so với các phương pháp chẩn đoán vi rút thông thường (nuôi cấy, phát hiện kháng nguyên và xét nghiệm huyết thanh học) để phát hiện vi rút đường hô hấp. Việc phát triển một số xét nghiệm chẩn doán phân tử (multiplex PCR) đã cho phép phát hiện đồng thời tới 15 loại vi-rút khác nhau và việc sử dụng các xét nghiệm này đang trở thành tiêu chuẩn để xác định vi-rút đường hô hấp[38]. Kể từ khi được giới thiệu, PCR ghép kênh đã được áp dụng thành công trong nhiều lĩnh vực chẩn đoán axit nucleic, bao gồm phân tích xóa gen [3] phân tích đột biến và đa hình, phân tích định lượng và phát hiện RNA Trong lĩnh vực bệnh truyền nhiễm, kỹ thuật này đã được chứng minh là một phương pháp có giá trị để xác định virus, có thể cả vi khuẩn, nấm hoặc ký sinh trùng.

Một số nghiên cứu đã chứng minh tính thực tiễn của việc xác định mầm bệnh virus ở nhiều cơ sở lâm sàng và dịch tễ học bằng cách sử dụng PCR đa kênh Kỹ thuật này đã được sử dụng để sàng lọc các virus riêng lẻ hoặc liên quan đến triệu chứng và kiểm tra mối liên quan giữa nhiễm virus với bệnh tật. Ngoài ra, kỹ thuật này đã được chứng minh là một công cụ mạnh mẽ và tiết kiệm chi phí để phân loại và phân loại các chủng vi rút trong viêm phổi trong các nghiên cứu dịch tễ học khác nhau. Do đó, xét nghiệm nhạy và nhanh đối với các loại virus này là rất quan trọng để giảm khả năng lây truyền bệnh viện sang những bệnh nhân có nguy cơ cao, hạn chế sử dụng kháng sinh không cần thiết.

Vì lý do này, một số nghiên cứu nhằm mục đích phát triển và đánh giá PCR đa kênh để phát hiện các loại virus này và cung cấp bằng chứng đáng kể về tính hữu ích của kỹ thuật này như một công cụ quan trọng để quản lý bệnh nhân bị nhiễm trùng đường hô hấp. Người ta kết luận rằng trong khi RT-PCR đa kênh đã chứng minh tính hữu ích của nó trong việc phát hiện vi-rút cúm ở những bệnh nhân mắc bệnh giống cúm, thì những bệnh nhân mắc bệnh giống cúm âm tính với vi-rút cúm có thể ẩn chứa (các) mầm bệnh gây ra hội chứng khó phát hiện. Xét nghiệm đã phát hiện và phân loại chính xác PIV ở 15 mẫu phân lập và 26 trong số 30 (87%) mẫu xét nghiệm mũi họng dương tính trước đó nhưng vẫn âm tính ở mẫu xét nghiệm mũi hoặc hầu họng và/hoặc mẫu phân lập nuôi cấy của 33 mầm bệnh đường hô hấp không liên quan.

Trong phiên bản sửa đổi, xét nghiệm này cũng được sử dụng để phát hiện RSV và adenovirus bằng cách sử dụng năm bộ mồi để khuếch đại cDNA của phân nhóm RSV A và B; PIV loại 1, 2 và 3; và DNA của adenovirus loại 1 đến 7.

Lâm sàng và cận lâm sàng

Xét nghiệm này có độ nhạy và độ đặc hiệu đối với tất cả 12 loại virus nguyên mẫu được nuôi cấy mô và khi áp dụng cho các mẫu bệnh phẩm hô hấp thì nhạy hơn. Gần đây hơn, người ta đã chứng minh rằng PCR ghép kênh là một công cụ chẩn đoán nhanh chóng và hữu ích để quản lý trẻ em bị nhiễm trùng đường hô hấp cấp tính. Dịch virus hợp bào hô hấp thường xảy ra cách năm vào cuối mùa thu, dịch rhovirus phát sinh vào mùa thu và mùa xuân, trong khi đỉnh điểm cúm xảy ra vào cuối mùa thu và đầu mùa đông.

Mặc dù bệnh viêm phổi do virus ngày càng được ghi nhận ở người lớn nhưng dường như bệnh này vẫn phổ biến nhất ở trẻ em, đặc biệt là trẻ sơ sinh dưới 2 tuổi. Theo Hiệp hội Lồng ngực Anh, sốt cao hơn 38ã5°C, nhịp thở lớn hơn 50 nhịp thở mỗi phỳt và lừm ngực là gợi ý của viờm phổi do vi khuẩn hơn là do vi rỳt; để so sỏnh, tuổi trẻ, thở khũ khố, sốt dưới 38ã5°C và ngực lừm xuống rừ rệt là gợi ý nguyờn nhõn do virus. Điều quan trọng là viêm phổi do phế cầu khuẩn điển hình (khởi phát đột ngột, sốt cao, ớn lạnh, đau ngực kiểu màng phổi, thâm nhiễm thùy phổi, tăng bạch cầu) chỉ là một phần trong phạm vi viêm phổi do vi khuẩn[40].

Số lượng bạch cầu và nồng độ trong huyết thanh của protein phản ứng C và procalcitonin là những biến số được nghiên cứu rộng rãi ở trẻ em và người lớn mắc bệnh viêm phổi mắc phải tại cộng đồng. Tuy nhiên, vi khuẩn và vi rút riêng lẻ hoặc cùng nhau có thể gây ra một loạt các thay đổi trên X quang ngực và những thay đổi này chỉ hữu ích trong những trường hợp cụ thể để xác nhận nguyên nhân gây viêm phổi do vi khuẩn. CT ngực cho thấy các vết mờ ở chồi cây, sự đông đặc đa ổ và các vết mờ hình kính mờ ở người lớn bị viêm phổi do virus mà không có bất kỳ bằng chứng nào về khả năng nhiễm vi khuẩn đồng thời.

Trong một nghiên cứu trên 153 trẻ nhập viện vì viêm phổi mắc phải tại cộng đồng, thời gian sốt trung bình là 14 giờ sau khi bắt đầu điều trị bằng kháng sinh.

Điều trị viêm phổi virus

Thuốc kháng virus

Amantadine và rimantadine đã được đề xuất để điều trị bệnh Cúm vì chúng tác động lên protein màng M2 của virus, có liên quan đến sự hợp nhất của vỏ virus với màng tế bào chất và có thể ngăn chặn sự sao chép RNA của virus. Chất lượng các nghiên cứu về hoạt tính của Amantadine và Rimantadine còn thấp và việc sử dụng chúng bị hạn chế do các phản ứng có hại của thuốc và sự phát triển nhanh chóng của tình trạng kháng thuốc. Trong những trường hợp này, hiệu quả điều trị bị ảnh hưởng bởi tình trạng miễn dịch của bệnh nhân và lợi ích thu được từ việc điều trị bằng ribavirin là kém, kể cả khi sử dụng các globulin miễn dịch cụ thể [31].

Valganciclovir hoặc ganciclovir được sử dụng thường xuyên cho bệnh nhân nhận nội tạng từ người hiến tặng có huyết thanh dương tính với CMV hoặc cho bệnh nhân nhiễm HIV có nguy cơ cao mắc bệnh CMV. Khi valganciclovir và ganciclovir được dùng cho bệnh nhân viêm phổi do CMV, có thể thấy được lợi ích đáng kể, như đã được báo cáo ở những bệnh nhân bị viêm phổi do CMV gây biến chứng ghép tủy xương [6]. Trong bối cảnh này, một số loại thuốc chống vi-rút như pleconaril, ruprintrivir hoặc các loại thuốc tái sử dụng như itraconazole đã được đánh giá, nhưng không có loại nào đạt được kết quả chắc chắn về hiệu quả.

Mặc dù một số loại thuốc có hoạt tính kháng vi-rút đã được đề xuất để điều trị cho bệnh nhân COVID-19 nhưng không có nghiên cứu nào có thể hỗ trợ việc sử dụng thường xuyên các loại thuốc này. Remdesivir, lopinavir, aminoquinolines và các loại thuốc khác có hoạt tính kháng virus đã được chứng minh chống lại các loại virus khác đã được nghiên cứu, nhưng không có hiệu quả nào được chứng minh bằng các thử nghiệm lớn về điều trị hoặc dự phòng [7]. Việc sử dụng steroid ở bệnh nhân viêm phổi do virus có thể được cân nhắc để làm giảm tác động có hại của phản ứng miễn dịch do virus gây ra, nhưng hiệu quả của chúng còn chưa được chứng minh.

Một phân tích tổng hợp bao gồm 10 nghiên cứu đánh giá bệnh nhân bị viêm phổi do cúm liên quan đến việc sử dụng steroid có nguy cơ tử vong cao hơn, thời gian nằm viện trong phòng chăm sóc đặc biệt dài hơn và tỷ lệ nhiễm trùng thứ phát cao hơn, chỉ có nguy cơ trong thời gian thở máy là không bị ảnh hưởng [43].