Cục Thuế Quảng Ngãi gồm có 12 Phòng thuộc cơ quan Cục thuế và 14 Cục Thuế các huyện, thành phố. Trong quá trình xây dựng và trưởng thành, Cục Thuế Quảng Ngãi luôn chú trọng công tác đào tạo, nâng cao trình độ nghiệp vụ chuyên môn cho đội ngũ cán bộ công chức; đến nay, số cán bộ có trình độ đại học và trên đại học chiếm gần 40%; còn lại là trung cấp. Từ đó, đã tác động đến công tác quản lý thuế của ngành ngày càng đạt hiệu quả cao. Số thu thuế, phí và lệ phí do ngành quản lý tăng bình quân 24,5% năm; đặc biệt là năm 2006, năm đầu tiên tỉnh Quảng Ngãi có số thu nội địa đạt trên 1.000 tỷ đồng; chính thức gia nhập Câu lạc bộ 1.000 tỷ đồng. Có được kết quả này, ngoài yếu tố tăng trưởng kinh tế cao, còn có sự điều hành, chỉ đạo của Tỉnh uỷ, HĐND, UBND, UBMTTQ Việt Nam tỉnh; sự nỗ lực của các cấp, các ngành, các doanh nghiệp và người nộp thuế, còn có sự phát huy sáng kiến cải tiến, đẩy mạnh nhiều biện pháp quản lý thuế của toàn thể cán bộ công chức ngành thuế, nhằm khơi dậy trí tuệ của các tập thể, cá nhân tham gia, đề xuất nhiều đề án có chất lượng cao.